<div>
Science Feature Articles</div>

גנים על הספסל

עברית
ד"ר יצחק (צחי) פלפל. הסבר אבולוציוני
 
 
בתי הקברות, כך אומרים, מלאים באנשים שחשבו שאין להם תחליף. המשפט הידוע הזה חל גם בעולמם המיקרוסקופי של הגנים. בשנים האחרונות התברר, שמעט מאוד גנים הם חיוניים להישרדותו של האורגניזם, עד כדי כך שפגיעה בהם עלולה להוביל למות האור-גניזם. הרוב המכריע של הגנים, לעומת זאת, אינם כה חיוניים, והעובדה היא שהאורגניזמים מצליחים לפצות את עצמם בדרך כלשהי על פגיעה בגנים האלה, ואפילו על אובדנם המוחלט.
 
מדובר בתהליך שמזכיר את הדרך שבה מאמן קבוצת כדורגל, למשל, מכשיר כמה משחקניו לאותו תפקיד. בעת שההרכב הפותח של השחקנים עולה למגרש, יושבים המחליפים הפוטנציאליים על הספסל ומחכים לתורם. כאשר אחד משחקני ההרכב הראשון נפצע, או שאינו מתפקד כראוי, המאמן מבצע חילוף, ושולח אל המגרש את אחד מהמחליפים. מובן שהשחקן המחליף אינו זהה לחלוטין לשחקן המקורי, אבל הוא דומה לו, פחות או יותר, ביכולותיו. בדרך זו הקבוצה כולה אינה נפגעת כתוצאה מחוסר תיפקוד של אחד משחקניה. צוות של מדענים ממכון ויצמן למדע מציע תהליך משוב דומה, המאפשר לאורגניזמים לפצות את עצמם על פגיעה או על אובדן של גנים שיש להם "ממלאי מקום".
 
המדענים, ד"ר יצחק (צחי) פלפל ותלמידי המחקר רן כפרי וארן בר-אבן, מהמחלקה לגנטיקה מולקולרית במכון ויצמן למדע, עוסקים במדע חדש הקרוי "ביואינפורמטיקה". מדובר בשילוב של טכניקות וטכנולוגיות של עיבוד נתונים ממוחשב עם מחקרים בתחום הגנטיקה המולקולרית. הביואינפורמטיקה מאפשרת למדענים להתמודד עם השטף העצום של המידע הנובע מפרויקט המיפוי והריצוף של גנום האדם, וכן מפרויקטים דומים למיפוי ולריצוף גנומים של אורגניזמים רבים אחרים. בדרך זו הם מצליחים לזהות מגמות, מבנים ותהליכים מסודרים בסדרי ההתבטאות של גנים (התבטאות של גן משמעותה שהתא מייצר את החלבון שהגן מקודד).
 
מדעני המכון התמקדו במחקריהם בתאי שמרים, המהווים דגם ידוע ומקובל למחקרי גנטיקה. על בסיס מחקרים שבוצעו בשמרים בעבר, המדענים מניחים כי החלק היחסי של גנים שיש להם "מחליפי מקום" מגיע, פחות או יותר, ל-%08 מהגנום של המיקרו-אורגניזם הזה. למעשה, לכל אחד מהגנים הללו יש מספר "ממלאי מקום" פוטנציאליים, המצויים אי-שם בגנום. כמו השחקנים המחליפים בקבוצת כדורגל, גם "ממלאי המקום" הגנטיים הללו אינם זהים לגן המקורי. אלה הם גנים המסוגלים לייצר חלבון שהוא דומה מספיק לחלבון שמייצר הגן המקורי. מדענים רבים סברו ש"ממלאי המקום" הגנטיים הללו מתבטאים יחד עם הגן המקורי בעת ובעונה אחת, כך שביחד הם מספקים לאורגניזם חלבון בכמות הנחוצה. אבל ד"ר פלפל וחברי קבוצת המחקר שלו הצליחו להראות שלמעשה, בעת שהגן "המקורי" מתבטא, האחרים - ממש כמו "שחקני ספסל" - שותקים ואינם פועלים. אבל, אם וכאשר הגן המקורי נפגע, או נמחק, עולים "שחקני הספסל" למגרש ומתחילים להתבטא.
 
כיצד יודעים הגנים "ממלאי המקום" שהגן המקורי אינו מתפקד כראוי ושעליהם להיכנס לפעולה? מדעני המכון ניתחו נתונים שעלו מ-40 מחקרים אשר בוצעו בתאי שמרים, על-ידי מדענים רבים במקומות שונים בעולם. על בסיס ניתוח המידע הזה הם מציעים תהליך משוב הממלא את תפקידו של המאמן בקבוצת כדורגל, ומורה לשחקנים המחליפים מתי להיכנס לפעולה. תהליך משוב זה מתואר במאמר שפרסמו המדענים בכתב העת המדעי "נייצ'ר ג'נטיקס" (ראו מסגרת נפרדת).
 
שאלה נוספת נוגעת לדרך שבה הגנים "ממלאי המקום" שרדו בתהליכי האבולוציה ארוכי הטווח. בקבוצת כדורגל, "שחקן ספסל" שיישב יותר מדי זמן על הספסל ולא ישותף במשחקי הקבוצה, עלול לאבד מכושרו הגופני, וכן את יכולת התגובה שלו וביטחונו העצמי. כתוצאה מכך, הוא עלול לאכזב ולא לתפקד ברגע המכריע, כשהקבוצה תזדקק לו. באותה מידה, גן "ממלא מקום" שלא ייקרא לפעולה זמן רב מדי, עלול להיות מנופה ומסולק מהגנום על-ידי התהליכים האבולוציוניים. כיצד, אם כן, נותרו בגנום כל אותם "שחקני ספסל" גנטיים? מדעני המכון מציעים הסבר המבוסס על העובדה, שכל אחד מהגנים הללו מתאפיין במבנה שונה במעט מהגן המקורי. הייחוד הזה מאפשר ל"ממלא המקום" הגנטי לבצע תפקידים ייחודיים רק לו, דבר שיהפוך אותו לחיוני מספיק כדי שתהליכי הניפוי של האבולוציה יפסחו עליו, הוא יישאר בגנום, ויוכל להציע (ולעיתים גם לספק) את שירותיו כשחקן מחליף.
 

תהליך משוב

תהליך המשוב המוצע יוצא לדרך עם תיפקודו (או חוסר תיפקודו) של הגן המקורי. החלבון שהגן הזה מייצר אמור להשתמש בחומר גלם מסוים, ולייצר ממנו חומר אחר שהאורגניזם זקוק לו. כאשר הגן תקין, הוא משתמש בכמות גדולה של חומר גלם, כך שכמות חומר הגלם הזמינה קטנה יחסית. אבל, כאשר הגן אינו מתפקד כראוי, ואינו יוצר כמות מספיקה של חלבון (או שהוא יוצר חלבון פגום שאינו מסוגל לבצע את תפקידו), נותרת כמות גדולה יחסית של חומר גלם. חומר הגלם הזה מפעיל חלבונים מיוחדים ("גורמים מאתחלים"), שכל אחד מהם נקשר ל"ממלא מקום" גנטי אחר, ומפעיל אותו. כך, אי-תיפקוד של הגן המקורי גורם לגידול בכמות חומר הגלם, מה שמוביל להפעלת אחד מ"ממלאי המקום" הגנטיים.
 
בדרך זו, הודות ל"שחקני הספסל" הגנטיים, מצליחים האורגניזמים לשרוד בתנאים קשים, ולהתגבר על תקלות ונזקים שנגרמים לרוב הגנים במטען הגנטי שלהם.
 
עברית

לאורך המדרגות האטומיות

עברית

 

צוות מדענים, בראשות ד"ר ארנסטו יוסילביץ' מהמחלקה לחומרים ופני שטח במכון ויצמן למדע, פיתח באחרונה שיטה חדשה לייצור מערכים של ננו-צינורות פחמניים. השיטה מבוססת על שימוש במדרגות זעירות (בסדר גודל אטומי) המצויות על פניו של משטח תחמוצת אלומיניום הקרוי ספיר. ננו-צינורות פחמניים עשויים - עקרונית - לשמש לייצור מעגלים חשמליים ננוסקופיים. אחת המגבלות העיקריות בדרך לפיתוח יישומים אלה מתבטאת בקושי ליצור ננו-צינורות פחמניים בתצורות של מערכים מסודרים, "לפי הזמנה". המחקר הנוכחי, של מדעני מכון ויצמן, עשוי להצביע על דרך אפשרית להתגברות על המגבלה הזאת.
 
בתחילה ניסו המדענים לכוון ננו-צינורות פחמניים באמצעות הפעלת שדה חשמלי. במסגרת ניסויים אלה הפעילו שדה חשמלי בזמן היווצרותם של הננו-צינורות, על משטחים שונים. להפתעתם גילו, כי ננו-צינורות שנוצרו על משטח ספיר (שלפי הכתוב במקרא, היא אחת מאבני החושן של הכהן הגדול), התארגנו במקביל זה לזה, אך ללא כל התחשבות בשדה החשמלי. למעשה, תהליך ההתארגנות התבצע גם כשלא הופעל כלל שדה חשמלי.
 
התבוננות קרובה יותר במשטח הספיר פתרה את התעלומה: משטחים אלה אינם חתוכים בדיוק לפי מישור הגביש. לכן המשטח אינו חלק, ועל פניו מצויות מדרגות זעירות, בסדר גודל אטומי. מדרגות אלה מקבילות זו לזו, והננו-צינורות הפחמניים "בחרו" להיווצר לאורכן. המדענים מסבירים, כי ננו-צינורות פחמניים נוצרים מהקטליזטור (זרז) של חלקיקי ברזל ננו-סקופיים, והם נמשכים לשדה מקומי שנוצר על-ידי המדרגות הזעירות. ברור שחלקיקים אלה "לא אוהבים" לעלות במדרגות, והם "מעדיפים" להחליק על הצד הפנימי של המדרגה, המשמש להם כמעין מסילה. כך הם מצויים תמיד במגע עם שני משטחים, דבר שכנראה מייצב את הקטליזטור. למעשה, הננו-צינורות הפחמניים עוקבים אפילו אחר פינות וזוויות במדרגות (תוצאת פגמים שונים בגביש הספיר). כך נוצרים ננו-צינורות פחמניים ישרים, או כאלה שמעוצבים במסלול "זיג-זג". לננו-צינורות אלה, אומרים המדענים, עשויות להיות תכונות אלקטרוניות מעניינות במיוחד.
 
ד"ר ארנסטו יוסילביץ: "בתהליך חיתוך המשטח אפשר לשלוט בכיוונן ובצורתן של המדרגות האטומיות על משטח הספיר, דבר שעשוי לאפשר לנו ייצור מבוקר של מערכים שונים של חוטים העשויים ננו- צינורות פחמניים".
עברית

מה אפשר ללמוד מקיפוד הים

עברית
קוץ של קיפוד ים לאחר שבירה, הנבנה והולך מחדש. מבסיסו ועד לחודו, הקוץ מהווה גביש אחד. הצילום בוצע על ידי יעל פוליטי באמצעות מיקרוסקופ אלקטרונים סורק

הקוצים של קיפוד הים מהווים פלא הנדסי. כל קוץ כזה, מבסיסו ועד לחודו, הוא למעשה גביש אחד. כאשר הם נשברים, קוצי קיפוד הים מתפתחים ומשלימים את עצמם בתוך ימיםספורים. צוות של מדענים ממכון ויצמן למדע גילה באחרונה כיצד הם עושים זאת.
 
גבישים - דוגמת גבישים של סוכר ומלח - נוצרים מאטומים או ממולקולות המומסים בנוזל, והם בעלי צורות אופייניות הקבועות מראש. אבל פרופ' ליאה אדדי, פרופ' סטיב ויינר וחברי קבוצות המחקר שלהם במחלקה לביולוגיה מבנית במכון ויצמן למדע, מצאו שקיפוד הים משתמש בשיטה אחרת לגידול הגבישים שמהווים את קוציו. בתחילת התהליך מצוי החומר המשמש לבניית הקוצים בתצורה לא-גבישית הקרויה סידן קרבונט אמורפי (ACC). חבילות של החומר הזה נדחפות מהתאים הנמצאים מסביב לבסיס הקוץ עד למקום השבר, שממנו עתיד הקוץ להתפתח ולהשלים את עצמו. תוך מספר שעות מרגע הגעתו של החומר לנקודה זו הופך ה- ACC הבלתי-גבישי לגביש מאורגן של קלציט היוצר את הקוץ המחודש, דבר שמאפשר לבעל-החיים שליטה בעיצוב הגביש.
 
כדי לעקוב אחר תהליך השקיעה והגיבוש של ה –ACC השתמשו המדענים - ובהם גם תלמידת המחקר יעל פוליטי, ד"ר אוגניה קליין וטלמון ארד מיחידת התשתיות למחקר כימי של מכון ויצמן למדע - בארבע שיטות מחקר שונות, כולל שני סוגים של מיקרוסקופיית אלקטרונים. "טבעי לשאול", אומר פרופ' ויינר, "מדוע היה לנו קשה כל כך לבחון תהליך שנראה לנו בסיסי ביותר, שמדענים חוקרים אותו כבר יותר ממאה שנה. אבל למעשה, מפני שתצורת הACC קיימת באופן זמני בלבד, נדרשנו לפתח דרכים ושיטות חדשות שאיפשרו לנו לפעול בחלון ההזדמנויות הצר יחסית של קיום החומר בתצורתו זו".
 
הצילומים של הקוצים המתחדשים מראים מחטים מיקרוסקופיות שגדלות בתחילה היישר מגדם הקוץ השבור, ואחר-כך מסתעפות כדי ליצור מבנה קשיח, דמוי תחרה, אבל קל. המבנה הגבישי של הקוץ הישן מהווה מעין תבנית שמכתיבה ומבקרת את התארגנות המולקולות של החומר החדש בגביש הגדל והולך.
 
במחקרים קודמים גילו מדעני המכון, ששיטת פעולה זו מיושמת על-ידי רכיכות וקיפודי ים צעירים, המצויים בשלב הזחל, לצורך בניית השלד הפנימי שלהם. אבל במחקר הנוכחי התברר, לראשונה, שגם בעלי-חיים ימיים בוגרים משתמשים בשיטת בנייה זו. אורח החיים של זחל שונה מאוד מזה של בוגר (למשל, הזחל הזעיר של קיפוד הים הוא שקוף, והוא שוחה, לעומת הבוגר העגול והקוצני שחי על קרקעית הים). לכן מפתיע לגלות, ששניהם משתמשים באותה שיטת פעולה. תגלית זו הביאה את פרופ' אדדי ואת פרופ' ויינר להשערה, ששיטה זו מהווה אסטרטגיה בסיסיתהמשותפת למיגוון רחב של יצורים בעלי קוצים וצדפים, כמו הרכיכות והאלמוגים.
 
המדענים אומרים, שהאפשרות לגדל גבישים יחידים מחומר אמורפי עשויה להיות מיושמת לצורך ייצור ועיבוד חומרים סינתטיים מתקדמים בעלי תכונות של גבישים יחידים.
 
עברית

בערוגת הגינה

עברית
ד"ר אסף אהרוני . תהליכי הבשלה
 
בערוגת הגינה
מסביב לחבית
עמדו לרקד
כרוב עם כרובית
 
זאת הסלק ראה
והנה גם הוא בא
איתו עגבניות
והשמחה רבה
 

בערוגת הגינה

מילים: חיים נחמן ביאליק
לחן: מנשה רבינא
 
צמחים הם כמו מפעלים זעירים ועצמאיים, המייצרים תרופות ומוצרים רבים אחרים. בנוסף לחומרים שהם מייצרים לצורכי צמיחה ורבייה, יורדים מקווי הייצור שלהם יותר מ100,000- חומרים טבעיים הידועים כ"מטבוליטים משניים" המשמשים לכמה מטרות. למשל, בזמן שאנחנו מורחים על עצמנו קרם הגנה נגד הקרינה האולטרה-סגולה של השמש, הצמחים מגינים על עצמם באמצעות ייצור מטבוליטים משניים אשר פועלים כקרם נגד שיזוף. קבוצות שונות של מטבוליטים משניים מגיבים לאיומים סביבתיים אחרים, ומגינים על הצמחים מפני זיהום של חיידקים או פטריות. חומרים אלה חשובים גם למחזור החיים של הצמח, לבקרת צבע הפרי והפרח, לריח ולטעם אשר מושכים את החרקים או את הציפורים הנכונים, הממלאים את תפקיד ה"מתווך" או ה"שדכן" בתהליך ההפריה של הצמחים. יש גם מטבוליטים משניים אשר דוחים, ואפילו מרעילים, את המזיקים ואוכלי הצמחים. ד"ר אסף אהרוני, מהמחלקה למדעי הצמח במכון ויצמן למדע, מתמקד בחקר רשתות הגנים והחלבונים המעורבים בתהליכי הייצור של מטבוליטים משניים, בתהליכי הבשלת הפרי, ובקביעת טעמו וריחו.
 
בעבודתו במכון ויצמן למדע מתכנן ד"ר אהרוני לחשוף את מאות הגנים השולטים בייצורם של המטבוליטים המשניים שמעורבים ביצירתה של אחת מיצירות המופת של הטבע: העגבנייה. רוב פעילותם של הגנים הללו ושל תוצריהם (המטבוליטים המשניים) מתרחשת בשלבים הסופיים של ההבשלה, כאשר צבע העגבנייה משתנה מירוק לאדום, הקליפה נעשית דקה יותר, והטעם והריח האופייניים "עולים לשלטון". תהליכים אלה תורמים לא רק לטעם ולריח של הפרי, אלא גם (אם כי בעקיפין) להגנתו. ד"ר אהרוני חוקר גם את השפעתם של גורמי עקה שונים, ואת התהליכים שבאמצעותם הצמחים מתגוננים כנגד תנאי העקה.
 
"הבשלה היא תהליך מורכב מאוד, אשר מתאפיין בשורה של שינויים ביוכימיים ופיסיולוגיים מתוזמנים", אומר ד"ר אהרוני. התוצר של תגובה כימית אחת יכול לשמש בסיס לתגובה הכימית הבאה לאורך כל תהליך ההבשלה, וההצטברות של מטבוליטים משניים מהווה היבט חשוב של ההבשלה. לשילובים שונים של טעם וריח יש, בזמן ההבשלה, תפקידים שונים, כגון הגנה על הפרי מפני גורמי מחלות שונים. כך, למשל, נוצרים בתהליך זה חומרים מרים, שתכליתם היא למנוע את אכילת הפרי לפני הבשלת הזרעים. בדרך זו נאבק הצמח כדי לאפשר לפרי למלא את ייעודו: פיזור זרעים והבטחת המשכיותו של הדור הבא.
 
ברוב הפירות ישנם כמה מאות שילובים של מטבוליטים משניים המעורבים ביצירת הטעם והריח. כדי לגלות ולזהות את הבסיס הגנטי של הסבך המורכב שלרשתות הגנים והחלבונים אשר מעורבים בתהליכי ההבשלה, פיתח ד"ר אהרוני כמה דרכים ליישום ושילוב של טכנולוגיות מתקדמות שאיפשרו לו, בין היתר, להפריד ולזהות את הנוכחות של כל תרכיב אשר תורם ליצירת הטעם והריח. חומרי הטעם והריח הבונים את התערובת יופרדו לחומרים בודדים באמצעות כרומטוגרפיה גזית ויזוהו לאחר מכן. כדי לגלות ולזהות פיגמנטים ותרכיבים אשר בולעים קרינה אולטרה סגולה, משתמשים המדענים בכרומטוגרפיה של נוזלים. שילובה של הטכנולוגיה הזאת בספקטרוסקופיה של מאסות מאפשר זיהוי ואיתור של מטבוליטים משניים נוספים, כולל חומרים שהמדענים לא תכננו לזהותם.
 
חברי קבוצת המחקר של ד"ר אהרוני מתכננים להשתמש בטכנולוגיה של שבבי די-אן-אי, וכן לפתח מספר רב מאוד של צמחי עגבניה מוטנטיים. שילוב הטכנולוגיות האלה יאפשר להם לנתח את השפעת הביטוי של גנים שונים על התפתחות תכונות הטעם, הריח וההתרככות של פרי הנמצא בתהליך הבשלה. להבנת המבנה ואופן הפעולה של רשתות הגנים והחלבונים המעורבים בתהליכים אלה עשויות להיות השלכות מחקריות רבות בתחום חקר מחזור החיים של הצמח, וכן ייתכן שאפשר יהיה לפתח על בסיסה יישומים שונים.
 
כעת מתמקד ד"ר אהרוני בפרי העסיסי של העגבניה, אך המחקרים שביצע בעבר הניבו פירות משלהם. במחקר הדוקטורט שלו, למשל, הוא הצליח לשבט ולאפיין גן מפתח הקרוי SAAT, שמקודד את האנזים אשר מבצע את התגובה הכימית שיוצרת שורה של שילובי חומרים החיוניים לטעמם של תות גינה, בננה ועוד. במחקר אחר הוא זיהה גן, שהתוצר החלבוני שלו ממלא תפקיד מרכזי בתגובה הכימית שיוצרת את שילובי החומרים אשר אחראיים לריח המנטה, הריחן וקליפת הלימון. כאשר שולב הגן הזה במטען הגנטי של צמח תפוח אדמה, הדיפו עליו של הצמח ריח מובהק של פרחים. אפילו האפידים, החרקים הקטנים המזיקים לירקות, לפירות ולעצי אורן, הגיבו לשינוי. בניסויים אחרים זיהה ד"ר אהרוני סידרה של שלושה גנים, שכאשר הם מתבטאים יתר על המידה בצמח הקרוי "אראבידופסיס", הם גורמים לכך שמשטח העלה יהיה מבריק ומכוסה שעווה, דבר שמעניק לעלה הגנה כפולה. 
 
הבנת הגנים המעורבים ביצירת המט-בוליטים המשניים ויכולת שליטה בהם עשויות להוביל לפיתוח דרכים חדשות להגדלת יבול, להגברת העמידות לבצורת ולמזיקים, להארכת חיי המדף של הפרי, וכן לשיפור הטעם. אך ייתכן שאלה הם יישומים בעלי חשיבות פחותה, בהשוואה לאפשרות שעולה מהעובדה שערכם הרפואי של המטבוליטים המשניים ידוע זה שנים רבות, כך ששליטה בתהליכי הייצור שלהם עשויה להציע דרכים רבות לפיתוח תרופות חדשות. למשל, מטבוליטים משניים הם המקור לפעולתם האנטי-סרטנית של מאכלים המבוססים על סויה, והימצאותם ביין תורמת להפחתת הסיכון לחלות במחלות לב. הגינה, מתברר, היא ארץ האפשרויות הבלתי-מוגבלות באמת.

 

אישי

ד"ר אסף אהרוני הצטרף למחלקה למדעי הצמח של מכון ויצמן למדע בחודש אוגוסט 2004. לפני כן למד לתואר ראשון ושני בפקולטה לחקלאות של האוניברסיטה העברית ברחובות. בשנת 1996 החל בלימודי דוקטורט במכון CPRO-DLO בווגנינגן שבהולנד. מחקרו התמקד בביוסינתזה של טעם הפרי בתות גינה בזמן ההבשלה. ד"ר אהרוני היה בין הראשונים שהשתמשו בשבבי די-אן-אי במדעי הצמח. הוא השתמש בטכנולוגיה זו לחקר ביטוי גנים המעורבים בתהליכי ההבשלה של תות גינה. לאחר מכן ביצע מחקר בתר-דוקטוריאלי במעבדתו של ד"ר אנדי פרירה באותו מכון. במחקר זה חקר את תפקידם של גנים שונים בתהליכי חילוף החומרים בצמחי

 

מחסום ריח בולם טעם

ריח מוכר יכול לזמן זיכרון ילדות כמו שיר ישן, אך כאשר האף סתום, אפילו אוכל מוכר וחביב מאבד את טעמו. הסיבה לכך היא, שהריח משפיע על הטעם. על הלשון יש קולטני טעם אשר יכולים לזהות רק ארבעה סוגים שונים של טעמים אמיתיים: חמוץ, מתוק, מלוח ומר. חוש הריח שלנו - שמסוגל לזהות אלפי שילובים שיוצרים ריחות שונים - מאפשר לנו לטעום את מיגוון הטעמים שאנו אוהבים. למשל, כאשר אנו לועסים מסטיק בטעם מנטה, וסוגרים את האף, נעלמת תחושת הטעם, אבל כאשר אנו משחררים את החסימה, תחושת הטעם חוזרת.
 
עברית

איים של יציבות

עברית
פרופ' ורד רום-קידר. מסלולים
 
פול ניומן וטום קרוז, כוכבי "צבע הכסף", אולי לא ידעו זאת, אבל שולחנות ביליארד מייצגים בעיות מתמטיות מורכבות. מתמטיקאים ושחקני ביליארד מנוסים יכולים, אולי, לחשב מראש את המקום שבו יפגע כדור ביליארד הנהדף בפעם הראשונה, או השנייה, מדפנותיו של שולחן ביליארד חסר חיכוך. אבל ככל שמתרבות הפגיעות וההדיפות, הפערים הזעירים שבין זווית הפגיעה החזויה של הכדור לבין המתחולל בפועל, מצטברים ומקשים מאוד על חיזוי מסלולו של הכדור ומקוםפגיעתו בדופן השולחן. בשלב מסוים, הפערים האלה גדלים עד כדי כך שחישוב מסלולו של הכדור נעשה משימה בלתי-אפשרית בשביל בני-אדם, מיומנים ומוכשרים ככל שיהיו.
 
פרופ' ורד רום-קידר, מהמחלקה למדעי המחשב ומתמטיקה שימושית במכון ויצמן למדע, חוקרת את התכונות התיאורטיות של שולחנות ביליארד דמיוניים, ואת המסלולים האפשריים של כדורים הנהדפים שוב ושוב מדפנותיהם. השורשים ההיסטוריים של העיסוק בתכונות המתמטיות של שולחנות ביליארד נעוצים בשלהי המאה ה- 19-, כאשר לודוויג בולצמן טען, שמולקולות גז הכלואות במכל סגור מתנהגות כמו כדורים בתנועה. בדומה לכדורי ביליארד, המולקולות הללו מתנגשות אלה באלה,ומפעם לפעם פוגעות בדפנות המכל ונהדפות מהן. כך, כל אחת ממולקולות הגז נעה במסלול בלתי-יציב ובלתי-ניתן לחיזוי, הייחודי לה. תובנה זו הובילה את בולצמן לניסוח החוק הקרוי על שמו, הקובע שבממוצע, מולקולות גז מתפזרות בחלל נתון בצפיפות שווה.
 
במערכת כאוטית מאוד, כמו הגז של בולצמן, אי-אפשר לחזות את מסלול התנועה של "כדור" בודד, אבל אפשר לנבא את התוצאה הממוצעת למספר גדול של כדורים. לעומת זאת, כדור בודד הנע על פניו של שולחן ביליארד עגול, נע במסלול קבוע החוזר על עצמו שוב ושוב, וניתן לחיזוי בקלות יחסית. למעשה, צורת השולחן ממלאת תפקיד מרכזי בקביעת מסלול תנועתו של הכדור. פרופ' רום-קידר חוקרת, יחד עם פרופ' דימיטרי טורייב מאוניברסיטת בן-גוריון, שולחנות בעלי דפנות קעורות. שולחנות אלה,הקרויים שולחנות פיזור, הם הכללה של דגם פשוט יותר שבו שני דיסקים נעים על שולחן מלבני. תנועת הכדורים בשולחנות אלה היא כאוטית; כלומר, מעבר למספר מסוים של שינויי כיוון אי-אפשר לחזות אותה. פרופ' רום-קידר ופרופ' טורייב חוקרים את השינויים ההופכים מערכות כאוטיות ל"מערכות מעורבות", שבהן "איים של יציבות" (אזורים של מסלולים יציבים החוזרים על עצמם שוב ושוב, ולכן הם ניתנים לחיזוי) מתקיימים לצד אזורים אחרים שבהם מתחוללת תנועה בלתי-יציבה (שאינה ניתנת לחיזוי).
 
המדענים סבורים, שמערכות כאוטיות עשויות להפוך למערכות מעורבות כאשר, למשל, ה"כדורים" אינם פועלים כמו כדורי ביליארד, אלא כמו אלקטרונים או אטומים. חלקיקים אלה נושאים מטענים חשמליים הדוחים זה את זה, דבר שאינו מאפשר להם להתנגש זה בזה. כששני חלקיקים כאלה נעים זה לעומת זה, כוח הדחייה בין המטענים החשמליים שלהם גורם להם לסטות הצידה רגע לפני ההתנגשות. "דרך אחרת לחשוב עלהבעיה", אומרת פרופ' רום-קידר, "היא לתארמערכת בעלת כדור אחד הנע על שולחן ביליארד בעל דפנות גמישות. כדור כזה, במערכת כזאת, מהווה מודל טוב להתנהגותו של אלקטרון הסוטה ממסלול התנגשות עם גוף אחר, כתוצאה מהשפעת כוח הדחייה של המטענים החשמליים שלהם. בפועל, האלקטרון הנמנע מהתנגשות, כמו הכדור הנהדף מהדופן הגמישה של שולחן הביליארד, נע לאורך עקומה חלקה, כתוצאה מקיומו של פוטנציאל חשמלי 'חלק' או 'רך'".
 
פרופ' רום-קידר ופרופ' טורייב הוכיחו, פוטנציאל חלק מאפשר את היווצרותם שלאיי יציבות בשולחנות פיזור. הם גם גילו כיצד הקשיחות או הרכות היחסית של דפנות השולחן משפיעות על גודלם של איי היציבות, המתקיימים כאשר חלק ממסלול הכדור משיק לאחד מקטעי הדופן הקעורים של השולחן. במחקר אחר הם מצאו, שגם קליעת כדורים לפינות השולחן (כל עוד הפינות האלה הן בעלות זוויות מוגדרות וסופיות) עשויה להכניס את הכדור למסלול בלתי-כאוטי ויציב החוזר על עצמו שוב ושוב.
 
במחקרים אלה בחנו המדענים את התנהגותם של כדורי ביליארד הנעים על פניהם של שולחנות דו-ממדיים. בימים אלה, יחד עם תלמידת המחקר אנה רפופורט, הם שואפים לפתח תיאוריה מתמטית שתתאר ותחזה את התנהגותם של מספר אטומיםצ במרחב תלת-ממדי (כלומר, מערכות חלקות בממדים גבוהים יותר). "אם נצליח בזה", אומרת פרופ' רום-קידר, "נתקרב להבנת תקפות החוק של בולצמן".
 
כדורים בתנועה. ציור: פרופ' ורד רום-קידר
 

 

מהמתמטיקה אל הפיסיקה ובחזרה                                

פרופ' ניר דודזון, מהמחלקה לפיסיקה של מערכות מורכבות במכון ויצמן למדע, עוסק בקירור אטומים, במטרה ללמוד על תכונותיהם הבסיסיות. באמצעות קרני לייזר הוא הודף את האטומים בזהירות אל תוך מלכודות מיקרוסקופיות אפלות, שאפשר לראותן כשולחנות הביליארד הקטנים בעולם. קירותיהן של המלכודות האפלות הללו עשויים גליאור שהאטומים חוזרים ונהדפים מהם, בדומה לכדורי ביליארד. פרופ' דודזון וחברי קבוצת המחקר שלו ניסו לשפר את הקירות במלכודות האלה, באמצעות שינויים בצורת המלכודת ובעובי קירות האור. אבל האטומים שנלכדו במלכודות התנהגו בדרך לא צפויה: לפני שנהדפו מהקירות, הם חדרו מעט לתוכם, כאילו שהקירות היו עשויים חומר ספוגי.תופעה זו השפיעה על זווית ההדיפה של האטומים, ועל מסלוליהם בהמשך. בשלב זה שמעו הפיסיקאים על עבודתם של פרופ' רום-קידר ופרופ' טורייב בחקר שולחנות ביליארד דמיוניים בעלי דפנות גמישות, שבהם נוצרים איים של יציבות. במבט ראשון נראה היה, שמערכות תיאורטיות אלה עשויות להוות מודל למלכודות האור האפלות של פרופ' דודזון. ואכן, התברר שהנוסחאות שפיתחו המתמטיקאים מסוגלות לנבא כיצד שינויים בעובי ובשיפועי הקירות של מלכודות האור האפלות משפיעים על תנועות האטומים הלכודים בהן. כך קיבלו הפיסיקאים הסבר מתמטי לתצפיות המעשיות שלהם.
 
בהמשך הבחינו הפיסיקאים, כי אטומים שהגיעו לפינות המלכודות נטו לחזור למקוםשבו החלו במסעם. הם סיפרו על התופעה לפרופ' רום-קידר, מה שהוביל אותה ואת פרופ' טורייב לחקירת התנאים לקיומם של איי היציבות בפינותיהם של שולחנות פיזור.
עברית

אדומים

עברית
ד"ר ניר גוב. פיסיקה של תאי דם
 
19 אלף קילומטר ביום. זה אורך הדרך שעובר הדם הזורם במסלול המחזורי שבגופנו. בכל רגע נתון עוברים בכלי הדם שלנו 30-20 טריליון תאי דם אדומים המבצעים משימות חיוניות לחיים: הם מספקים חמצן לתאים החיים ומסלקים מהם את הפחמן הדו-חמצני. כדי לבצע את המשימות האלה, חייבים תאי הדם האדומים להיות חזקים מספיק על מנת לשרוד במסלולי התנועה הצפופים שבכלי הדם שלנו, הדומים במידה רבה למתחם המכוניות המתנגשות בלונה-פארק. תא דם אדום הוא מעין כלי רכב הנושא מטען יקר של המוגלובין, הכולל יונים של ברזל. יונים אלה עלולים להגיב בעוצמה עם סביבתם, ולגרום נזק לאיברים אם יישפכו אל מחוץ לתא, במקרה שהוא יתפרק כתוצאה מהתנגשות רבת-עוצמה. אבל תא הדם האדום חייב גם להיות גמיש מספיק כדי שיוכל להתפתל, להתכווץ,ולעבור דרך כלי דם קטנים. נימי דם אלה מובילים לרקמות רחוקות שקיומן תלוי ביכולתם של תאי הדם האדומים לספק להן חמצן. כאשר תאי הדם האדומים פגומים, או שאינם גמישים די הצורך ואינם מתפקדים כראוי, עלול הדבר להוביל למחסור בחמצן ברקמות שונות של הגוף, דבר שעלול להוביל להתפתחות מחלות שונות. מכאן עולה חשיבות ההבנה של תכונותיו הפיסיקליות של תא הדם האדום.
 
ד"ר ניר גוב, מהמחלקה לפיסיקה כימית במכון ויצמן למדע, חוקר את מבנה תא הדם האדום, את תכונותיו הפיסיקליות, וכן את המבנה והתכונות של השלד התאי, קרום התא, ומרכיבים נוספים המשפיעים על מבנה התא. "בשבילי, כפיסיקאי, המחקר של מערכת חיה הוא חוויה מרתקת, מאתגרת וייחודית", אומר ד"ר גוב. "שלא כמו מוצקים כגון גבישים, שהם מאורגנים, בעלי סימטריה מוגדרת, חוזרים על עצמם, ניתנים למדידה ויציבים, ובאופן שונה גם מנוזלים, שמתנהלים באי-סדר, התאים החיים מצויים במקום טוב באמצע. הביולוגים פיענחו, מיפו וריצפו כבר את רוב גנום האדם, ובכל זאת, אנחנו יודעים מעט מאוד על תכונותיהם הפיסיקליות של החומרים שמהם אנחנו עשויים". במחקריו מפתח ד"ר גוב מודלים תיאורטיים של התכונות הפיסיקליות של תא הדם האדום. "מודל כזה", הוא אומר, "לא חייב לכלול את כל התכונות הידועות של התא. למעשה, כדי שנוכל להסביר אירועים שונים בחיי המערכת, וכדי שנוכל לחזות נכונה כיצד יגיב תא דם אדום במצבים שונים, די לנו במודל שידמה נכונה את האיפיונים העיקריים של המערכת הנחקרת".
 
באחרונה הצליחו ד"ר גוב ושותפיו למחקר להסיק כמה מסקנות חשובות באשר לתכונות הפיסיקליות המאפיינות את תאי הדם האדומים. המבנה האופייני של תא דם אדום רגיל הוא סגלגל, שטוח, עם שקע במרכזו. מבנה זה נתמך מבפנים על-ידי השלד התאי, המתפקד כמעין רשת קפיצים המחוברת בנקודות מסוימות לקרום העוטף את התא. חיבורים אלה יוצרים נקודות מתח הקובעות את צורתו של התא. המדענים סברו בתחילה, שאפשר יהיה לחשב את קשיחותו ואת גמישותו של התא לפי איפיון מידת האלסטיות של השלד התאי. אבל המודל שפותח על בסיס ההנחה הזאת לא הצליח לחזות את התנהגותו האמיתית של תא דם אדום. משהו היה חסר.
 
ד"ר גוב ופרופ' שמואל שפרן מהמחלקה לחקר חומרים ופני שטח הכניסו שינויים שונים במודל, עד שהצליחו להתאימו לתגובות האמיתיות של תא דם אדום. הם מצאו, שהמודל המקורי לא תיאר נכון את נקודות החיבור שבין השלד התאי לקרום התא, מכיוון שATP גורם לסירוגין להתנתקות ולהתחברות מחדש של החיבורים בין השלד התאי לקרום התא. כשהחיבור משתחרר, פוחת מתח הקרום ומתחוללת בו תנועה מסוימת. במילים אחרות, התנודות בגודלו של התא, שבהן צפו החוקרים, לא נבעו מפעילות תרמית, כפי שסברו בתחילה, אלא מפעילות של חילוף חומרים (המרת אנרגיה מכנית מאוחסנת לאנרגיה של תנועה קינטית), המאפיינת מערכות חיות. תגלית זו המחישה לד"ר גוב את מידת המורכבות של בניית מודלים פיסיקליים של מערכת חיה ודינמית, והובילה אותו לפיתוח מודל אשר קישר בין נוכחותו וריכוזו של ATP לבין השפעותיו של חומר זה על מידת קשיחותו של השלד התאי, המשפיעה על צורתו, תיפקודו, וכושר הישרדותו של תא דם אדום.
 
מודלים כאלה של תאי דם אדומים, אשר מאפיינים ומנבאים היבטים חשובים והקשרים של מחלות שונות, עשויים להוביל להשגת תובנות חדשות בתחום הרפואה העתידית. למשל, עודף ATP מוביל לגמישות יתר של התא, כפי שקורה בסוגים מסוימים של אנמיה. או, שלד תאי פגיע, שעלול להישבר כתוצאה מהתנגשות של תא הדם האדום בתאים אחרים או בדפנות כלי הדם, עלול להוביל לפגיעה ביכולתו של תא הדם האדום למלא את משימותיו החיוניות לתהליכי החיים. כאשר מתקיים מחסור מסוים ב- ATP, כפי שקורה במחלות כבד, החיבורים של השלד התאי לקרום התא נעשים נוקשים, דבר שגורם לכך שתא הדם האדום נעשה קשוח, קוצי, והוא מתקשה לנוע בחופשיות דרך כלי הדם, כך שהוא עלול לחסום את זרימת הדם. תופעה זו מתחוללת גם בגופם של אנשים מבוגרים אשר לא מפיקים מספיק ATP. בניית מודלים מוצלחים יותר של תאי דם אדומים תאפשר הבנה טובה יותר של הגורמים המשפיעים על תיפקודם של התאים האלה, כך שאפשר יהיה לפתח דרכים לשליטה בתכונות אלה ולריפוי מחלות הנובעות מתיפקוד לקוי של תאי הדם האדומים.
 
הרפואה המודרנית אינה יכולה להציע כיום תחליף ממשי לתא הדם האדום. עירוי דם לסובלים ממחלות דם תלוי באספקה של דם מתאים, והוא מוגבל למשך החיים של תאי הדם. טיפולים חוזרים ונשנים עלולים לגרום לתגובות-נגד של המערכת החיסונית. לפיכך, מדענים רבים, במקומות שונים בעולם, מחפשים דרכים להפקת תחליפים סינתטיים לתאי דם אדומים. בניית מודלים תיאורטיים מדויקים יותר של התכונות הפיסיקליות של תאי הדם האדומים, כמו אלה שמפתח ד"ר גוב, עשויה להוות צעד ראשון במסע הארוך לקראת השגת המטרה הזאת.
 
 

אישי

ד"ר ניר גוב נולד בחיפה בשנת 1968. הוא קיבל תואר ראשון בפיסיקה מאוניברסיטת תל-אביב ותואר שני ושלישי מהטכניון. לאחר מכן ביצע מחקר בתר-דוקטוריאלי באוניברסיטת אילינוי, והחל לבצע מחקר בתר-דוקטוריאלי נוסף, בהנחייתו של פרופ' שמואל שפרן, במחלקה לחקר חומרים ופני שטח במכון ויצמן למדע. לפני כשנה הצטרף כחוקר בכיר למחלקה לפיסיקה כימית במכון ויצמן למדע.
עברית

מבוכים ומחשבים

עברית
ד"ר עומר ריינגולד. הוראות התמצאות
 
סכסוך בין שני מלכים עלול להכניס את נתיניהם למבוך מסובך, מפותל,ולעיתים אפילו קטלני. כך, למשל, כשמינוס מלך כרתים זעם על אגאוס מלך אתונה, הוא אילץ את האתונאים לשלוח אליו מדי שנה שבעה נערים ושבע נערות,שאותם השליך למבוך שבמעמקיו המתיןלהם המינוטאור, שחציו פר וחציו אדם,וזה טרף אותם לתיאבון. מצב העניינים העגוםהזה קיבל תפנית לא צפויה כאשר תזאוס,בנו של מלך אתונה, התנדב להישלח לכרתים.תזאוס האמין שיוכל להרוג את המינוטאור,למצוא את דרכו אל מחוץ למבוך, ולחזור לאתונה, בריא ושלם. למזלו, בעת שהיה בדרכו אל המבוך הבחינה בו אריאדנה, בתו של מינוס מלך כרתים - והתאהבה בו. היא ציידה את תזאוס בחוט שאותו קשר לשער המבוך, ולאחר מכן, עם התקדמותו במעבה המבוך, שיחרר אותו בהדרגה. לאחר שהצליח להרוג את המינוטאור, עקב אחר החוט, וכך הצליח למצוא את דרכו אל מחוץ למבוך.
 
מהסיפור הזה אפשר ללמוד לא מעט לקחים מועילים. למשל, שאם אתה כבר נכנס למבוך, כדאי מאוד שתביא אתך מהבית סליל חוטים, או,לחלופין, שתמצא שיטה שתאפשר לך למצוא את דרכך במבוך.למעשה, עד לאחרונה לא הייתה מוכרת שיטה שכזו, שלא נזקקה לכמות גדולה שלזיכרון, ושלא הסתמכה על האפשרות לבצע סימונים במבוך (כדוגמת השימוש בסליל החוטים). השיטה היעילה היחידה שעמדה לרשותם של הלכודים במבוך התבססה על אקראיות. מתברר, שאפשר להגיע מכל מקום במבוך לכל נקודת יעד רצויה באותו מבוך, כאשר בכל "צומת" שאליו מגיעיםמקבלים החלטה באופן אקראי (למשל,באמצעות הטלת מטבע) לאיזה כיוון לפנות.כאן, פחות או יותר, נכנס לתמונה ד"ר עומר ריינגולד, מהמחלקה למדעי המחשב ולמתמטיקה שימושית במכון ויצמן למדע. ד"ר ריינגולד הצליח באחרונה לפתח דרךדטרמיניסיטית (שאינה מבוססת עלאקראיות) לניווט במבוכים ולהגעה לנקודות רצויות בהם, שהיא חסכונית מאוד בזיכרון.
 
מדוע מדען מחשבים מתעניין במבוכים? מתברר, שמבוך עשוי לשמש דגם לרשת מחשבים, או לרשת של קווי תעופה בין ערים שונות בעולם. למעשה, היכולת למצוא מסלולים במבוכים, או ברשת של דרכים המקשרות ערים שונות, או ברשת של קווי תעופה, היא בעיה חישובית מרכזית שעומדת בבסיסם של חישובים רבים מאוד שבהם - בבסיס העמוק שלהם - חבויים מבוכים. השאלות שמעסיקות את מדעני המחשבים בתחום זה הן: כמה זמן וכמה זיכרון נחוצים כדי לחשב ולמצוא את הדרך מנקודה נתונה לנקודה רצויה בכל מבוך או רשת דרכים. שאלת הזמן הנחוץ נפתרה כבר, למעשה, לפני עשרות שנים. לשאלת הזיכרון הייתה ידועה תשובה חלקית בלבד. האלגוריתם (מתכון פעולה ממוחשב) המבוסס על אקראיות צורך כמות קטנה מאוד של זיכרון. כל הדרוש להפעלתו הוא לזכור את המיקום הנוכחי של "הלכוד" במבוך. אבל כמה זיכרון יידרש להפעלת אלגוריתם לניווט במבוכים שלא יעשה כל שימוש באקראיות? עד לאחרונה, אלגוריתמים דטרמיניסטיים כאלה צרכו משאב יזיכרון גדולים בהרבה בהשוואה למשאבי הזיכרון שצרך האלגוריתם המשתמש באקראיות.אלא שבאחרונה הצליח ד"ר ריינגולד למצוא פתרון לבעיה מרכזית זו, שהעסיקה מדעני מחשב רבים, במקומות שונים בעולם, במשך 35 השנים האחרונות. הוא יצר אלגוריתם דטרמיניסטי לניווט במבוכים, או ברשתות דרכים, שהפעלתו צורכת כמות זיכרון קטנה מאוד, הגדולה רק במעט מזו שצורך האלגוריתם המבוסס על אקראיות. אלגוריתם חדש זה מצייד את תזאוס המודרני, או את התייר המבקש לנווט את דרכו ברשת כבישים לא מוכרת, או את מי שמבקש לתכנן מסלולי טיסה, בספר של הוראות חד-משמעיות,שאם ימלא אותן בקפדנות, יגיע בסופו של התהליך ליעדו. מדובר בהוראות פשוטות ביותר. למשל: בצומת השני פנה ימינה, אחרכך, בפנייה השלישית שמאלה, וכך הלאה. מעניין לציין, כי אותה סדרת הוראות פשוטות מתאימה לכל מבוך ולכל מפת דרכים.
 
האלגוריתם החדש של ד"ר ריינגולד גם מרמז על כך שהשימוש באקראיות כנראה אינו הכרחי כדי לחסוך בזיכרון הדרוש לחישובים. על אף העובדה שהשימוש באקראיות הוא דרך נוחה לתכנון אלגוריתמים, עבודתו המקורית של ד"ר ריינגולד מאפשרת כעת לשער, כי לכל אלגוריתם המשתמש באקראיות ניתן יהיה למצוא אלגוריתם דטרמיניסטי, שיבצע אותן מטלות ולא יצרוך הרבה יותר זיכרון. אלגוריתם זה פותח כיווני מחקר חדשים עבור בעיות בסיסיות רבות הממתינות לפתרונן בתחום מדעי המחשב.
 
כיצד פועל האלגוריתם החדש? ד"ר ריינגולד מציע רדוקציה מפתיעה הנוגדת את האינטואיציה. הצעד הראשון הוא לסבך את המבוך עוד יותר, ולהוסיף לו צמתים ודרכים. הצמתים והדרכים החדשים נבנים בצורה כזו שהמבוך החדש הוא מהסוג הקרוי בפי מדעני המחשב "גרף מרחיב", שמציאת המסלול הרצוי בו יכולה להתבצע תוך שימוש באלגוריתם ידוע ופשוט שאינו צורך זיכרון רב. יחד עם זאת, בניית המבוך המוגדל מתבצעת תוך כדי שמירה על המבנה הבסיסי של המבוך המקורי. כך, כאשר מוצאים את הדרך הרצויה במבוך המוגדל, אפשר לשחזר את הדרך הרצויה במבוך המקורי תוך צריכה מינימלית של זיכרון.
 
 
 
 
 
 

 

 דגל שחור, דגל לבן

היבט כמעט שכוח של האגדה המיתולוגיתעל תזאוס ואריאדנה הוא סיפור השיבה של הגיבור לעיר הולדתו, אתונה. כשיצא בספינה לכרתים, הבטיח תזאוס לאביו,מלך אתונה, שעם שובו יניף על ספינתו דגל לבן, במקום דגל האבל השחור שהונף מעל לספינה שהסיעה את הנערים והנערות אל מותם המיועד בכרתים. אבל בדרכו חזרה לאתונה שכח תזאוס את הבטחתו לאביו, ולא החליף את הדגל השחור שהתנופף מעל לספינתו בדגל לבן. כשאביו, אגאוס, הבחין מרחוק בדגל השחור, הבין מכך כי בנו נכשל במשימתו, ונהרג. ברוב צערו השליך את עצמו אל הים, שמאז נקרא על שמו, "הים האגאי".

 

 אישי

ד"ר עומר ריינגולד נולד בתל-אביב וגדל בגבעתיים. כנער, למד בבית-הספר התיכון תלמה ילין, במגמת תיאטרון. בצה"ל שירת במסגרת גרעין נח"ל אמנויות שפעל במצפהרמון. עם שחרורו מצה"ל החל בלימודי מתמטיקה באוניברסיטת תל-אביב, ואחרי שנה בחר להמשיך במגמת מדעי המחשב. לאחר שקיבל תואר ראשון מאוניברסיטת תל-אביב, בחר להמשיך את לימודיו במדרשת פיינברג של מכון ויצמן למדע. כאן השלים את לימודיו לתואר שני ושלישי בהנחייתו של פרופ' מוני נאור, במחלקה למדעי המחשב ולמתמטיקה שימושית. לאחר שביצע מחקר בתר-דוקטוריאלי קצר במכון ויצמן למדע, ביצע מחקר בתר-דוקטוריאלי נוסף, במעבדות שנון של חברת AT&Tובמכון ללימודים מתקדמים שבפרינסטון. בשנת 2004 הצטרף כחוקר בכיר למחלקה למדעי המחשב ולמתמטיקה שימושית במכון ויצמן למדע. ד"ר ריינגולד נשוי ללאה, מהנדסת תוכנה, ואב ליובל, בן שנה וחצי. המשפחה מתגוררת בקמפוס של מכון ויצמן למדע.
 
 
עברית

תמונת קרב

עברית
מימין לשמאל: פרופ' איתן דומאני ופרופ' ירון כהן. אסטרטגיה חיסונית
 
הם מתנדבים בצבא הגדול בעולם. הם לא לובשים מדים, לא נועלים מגפיים וגם לא מקבלים משכורת, אבל הם חמושים היטב. הם יוצאים לסיורים ארוכים באזורי סכנה, בודקים את זהותו של מי שנקרה על דרכם, מבודדים ומנטרליםגורמים חשודים, ומסתערים בחירוף נפש על כל מי שהם מזהים כאויב ופולש. אלה הם לוחמי המערכת החיסונית של הגוף.
 
אך כמו כל צבא, בלהט הקרב הם עלולים לעשות טעויות. התקשורת לעיתים nמתנתקת, ואז יש נפגעים מאש כוחותינו. כשזה קורה, אנחנו מאבחנים מחלה של חיסון עצמי (מחלה אוטו-אימונית).כדי למנוע טעויות גורליות כאלה שואפים המדענים להבין ולהכיר את המערכת החיסונית כמכלול, כיצד היא קובעת אסטרטגיות פעולה, וכיצד היא מוציאה אותה אל הפועל. הבנה כזאת עשויה להוביל לפיתוח דרכים להשפעה על תפקוד המערכת ולמניעת תקלות מבצעיות חמורות, דבר שעשוי למנוע את הצורך בהקמת ועדות חקירה לאחר מעשה. המערכת החיסונית מפעילה היסטוריונים המתעדים את מורשת הקרב של יחידותיה השונות, וכן גם צוותים של כתבי שטח אשר אוספים מידע באופן שוטף על מצבהגוף, רמת התחזוקה שלו ומידת פגיעותו.היחידות האלה, וכן יחידות אחרות של המערכת החיסונית, מנהלות ביניהן מערךמסועף של תקשורת וחילופי מידע על הקרבות המתנהלים בחזית. צוות רב-תחומי של מדעני מכון ויצמן מצא באחרונה דרךלצותת לתקשורת האל-חוטית הזאת, דבר שמאפשר לו לחדור מבעד לערפל הקרב ולקבל תמונת מצב כוללת של תפקוד המערכת.
 
המחקר החלוצי הזה החל כאשר פרופ' ירון כהן, מהמחלקה לאימונולוגיה של מכון ויצמן למדע, הבין שכדי לאסוף ולנתח את המידע המודיעיני אין די בכלים שמציעים מדעי החיים ותורת החיסון. הוא יצר קשר עם פרופ' איתן דומאני מהמחלקה לפיסיקה של מערכות מורכבות, שהביא אתו שיטות מחקר מתחומי הפיסיקה והביו-אינפורמטיקה. הצוות הרב-תחומי החל לזהות ולמיין מיגוון אנטיגנים המגיבים עם הנוגדנים שנמצאו בדמם של נבדקים שונים, ולאחר מכן נותחו הממצאים בשיטות סטטיסטיות מתקדמות. בדרך זו קיוו המדענים לגלות דפוסים במלאי הנוגדנים של הנבדקים, שיאפשרו להם לחזות את מידת העמידות או הפגיעות של כל נבדק כלפי מחלות מסוימות. במחקר הראשון התמקדו המדענים בניסיוןלחזות את מידת הסיכון של הנבדקים לחלות בסוכרת מסוג 1, הנגרמת כאשר המערכת החיסונית תוקפת ומשמידה את התאים יוצרי האינסולין שבלבלב. חיזוי מוקדם של הסיכון לחלות במחלה זו הוא גורלי, מכיוון שהרס התאים יוצרי האינסולין מתחולל עוד לפני שמופיעים סימני המחלה, כך שעם גילוי הסימנים הראשונים כבר אין, למעשה, דרך יעילה לבלום את המחלה.
 
במחקרם המשותף הראשון הצליחו מדעני המכון לזהות "טביעות אצבעות חיסוניות" האופייניות לחולי סוכרת מסוג 1, המבדילות אותם מאנשים בריאים. תגלית זו נבעה מניתוח והשוואת ממצאים על הימצאותם של נוגדנים המגיבים עם 80 אנטיגנים שונים בדגימות דם. בהמשך הצליחו המדענים להראות, שניתן להשתמש בטביעות האצבעות החיסוניות האלה כדי לזהות את החולים. כדי לייעל את הבדיקות האלה הם פיתחו שבב שיאפשר לבדוק את תגובת המערכת החיסונית לכמה מאות אנטיגנים בעת ובעונה אחת.
 
המידע הרב שהתקבל מבדיקות שבוצעו באמצעות שבב האנטיגנים נותח באמצעות אלגוריתם (מתכון פעולה ממוחשב), שפיתח פרופ' דומאני. אלגוריתם זה מאפשר למחשב למצוא דפוסים המאפיינים את תגובת המערכת החיסונית של בעל-חיים או אדם מסוים, ולזהות דמיון ושוני בין תגובות של מערכות חיסוניות של בעלי-חיים או אנשים שונים. במחקר שבוצע בדגימות דם אשר נלקחו מעכברים הצליחו המדענים לבודד 27 אנטיגנים, שבחינת התגובה של המערכת החיסונית כלפיהם איפשרה לאבחן מי מהעכברים עתיד לחלות בסוכרת הדומה לסוכרת מסוג 1, ומי מהם חסין מפני מחלה אוטו-אימונית זו.
 
המדענים מקווים שיישום שיטת הפעולה החדשה בבני-אדם יסייע, בעתיד, בחיזוי מוקדם ואף בבלימת מחלות רבות ושונות.
 
 
 
 
עברית

הגנטיקה הסודית של הטרנזיסטור

עברית
פרופ' רון נעמן. גשרים של פחמן
 
קח מעט די-אן-אי, קורט ננו-צינורות פחמניים, כמה גבישי זהב זעירים ומשטח סיליקון, ובנה מהם ננו-טרנזיסטור. זה בדיוק מה שעשו חברי קבוצת המחקר של פרופ' רון נעמן מהמחלקה לפיסיקה כימית במכון ויצמן למדע. למעשה, הם התחילו את המסע בשלב ראשוני יותר: לקחו ערימה קטנה של פוספטים, סוכרים ונוקליאוטידים, ובנו מהם גדילים של די-אן-אי שתוכננו כך שייצמדו לננו-צינורות פחמניים. לאחר מכן בנו באותה שיטה גדילי די-אן-אי שנצמדו למגעים זעירים עשויים זהב, אשר עוגנו למשטח סיליקון. בשלב הזה עירבבו את שתי הקבוצות האלה, כך שגדילי הדי-אן-אי המחובריםלננו-צינורות העשויים פחמן נצמדו לגדילי הדי-אן-אי המחוברים למגעי הזהב. כך, למעשה, עלה בידיהם ליצור מעין "גשרים" של ננו-צינורות פחמניים שגישרו מעל למשטח הסיליקון, בין מגעי הזהב.
 
היכולת לעצב ננו-גשרים כאלה, בין מגעים של חומר מוליך חשמל (זהב), עשויה להוביל לפיתוח ננו-טרנזיסטורים זעירים שמהם ייתכן שאפשר יהיה, בעתיד, לבנות מעגלים אלקטרוניים זעירים, מהירים ויעילים במיוחד. המדענים סבורים, שייתכן כי בנוסף לכך אפשר יהיה לשלב בהתקנים מולקולות ביולוגיות שיגיבו עם הדי-אן-אי, ובכך ישנו את התנהגותם החשמלית של ההתקנים. ממצאים אלה תוארו במאמר שהמדענים פרסמו בכתב-העת המדעי APPLIED PHYSICS LETTERS. בניסוי זה נוצרו ננו-טרנזיסטורים בכ-10 אחוזים מזוגות מגעי הזהב, אך בימים אלה מחפשים המדענים דרכים לשפר את התוצאות האלה, דבר שעשוי לקדם את אפשרויות היישום של השיטה החדשה.
 
ננו-צינורות עשויים פחמן הם מעין "דפים הבנויים מאטומי פחמן, המגולגלים כך שהם יוצרים צינור דק שקוטרו יכול להיות קטן מננו-מטר אחד. ננו-מטר הוא מיליונית המילימטר, גודל השווה לרוחבם המשותף של 10 אטומי מימן. החומר הגנטי די-אן- אי יוצר גדילים המתלפפים זה סביב זה ונצמדים זה לזה בתצורה המזכירה סולם חבלים. כל "שלב" ב"סולם" הזה בנוי משני נוקליאוטידים, הנבדלים זה מזה על-פי הבסיסים החנקניים הכלולים בהם. סדר ההיצמדות של הנוקליאוטידים קבוע: טימין תמיד נצמד לאדנין, ואילו גואנין תמיד נצמד לציטוזין. כללי הצימוד האלה מאפשרים, למעשה, להנדס רצפים מולקולריים של די-אן-אי שייצמדו זה לזה וייצרו מבנים חדשים. כך גם אפשר להנדס רצף מולקולרי של די- אן-אי שייצמד לננו-צינורות עשויים פחמן. יכולות אלה של הד-אן-אי כבר עמדו במרכז מאמציהם של מדענים רבים ממקומות שונים בעולם ליצור ננו-טרנזיסטורים, אבל כפי שהדברים נראים כיום, השיטה שפיתחו מדעני מכון ויצמן היא המתאימה ביותר, עד כה, לפיתוח יישומים תעשייתיים ולייצור כמויות גדולות של ננו-טרנזיסטורים.
 
 
 
ננו-צינור עשוי פחמן( חום),מגשר בין שני מקטעי די-אין-אי, הנשענים על מגעי זהב (צהוב),שמחוברים למשטח סיליקון (ירוק)
 
עברית

גרורות על הכוונת

עברית
פרופ' זליג אשחר. המערכת החיסונית נלחמת בסרטן
 
התפשטות גרורות היא השלב המסוכן והקטלני של מחלת הסרטן. כך, למשל, סרטן הערמונית, הנחשב לאחד מגורמי המוות העיקריים בגברים במדינות המפותחות, מגיע לשלב הקטלני שלו כאשר הוא שולח תאים המייסדים גרורות סרטניות בעצמות. פרופ' זליג אשחר, ראש המחלקה לאימונולוגיה מכון ויצמן למדע, גילה ובחן בהצלחה דרך לכוון טיפול נוגד סרטן אל הגרורות הקטלניות.
 
הטיפול מבוסס על תאים של המערכת החיסונית שעוברים "הכשרה" מיוחדת באמצעות הנדסה גנטית, וכתוצאה מכך מצוידים בשילוב ייחודי של אמצעי ניווט ולוחמה המגביר את יכולתם לזהות ולהרוג את תאי הגרורות הסרטניות. מדובר בשילוב בין שני הכלים העיקריים שמפעילה המערכת החיסונית במלחמתה בפולשים זרים ובגורמי מחלות החודרים לגוף. הכלי הראשון הוא הנוגדנים המזהים מולקולות מוגדרות המוצגות על קרומיהם החיצוניים של תאים נגועים בנגיפים, תאים סרטניים מקוריים, תאי סרטן הנודדים בזרם הדם בדרכם לייסוד גרורות, וכן חיידקים גורמי מחלות. הכלי השני הוא תאי דם לבנים מסוג T, המסוגלים להרוג תאים המזוהים כ"אויב", אלא שבפועל הם מסוגלים לזהות כ"אויב" רק מיעוט מבין הגידולים הסרטניים. במילים אחרות, הנוגדנים מצטיינים בזיהוי האויב, אך מתקשים בהריגתו, ואילו תאי ה- T מצטיינים בהריגת תאי אויב, אך מתקשים בזיהויים. פרופ' אשחר מצא דרך לשלב את שתי היכולות האלה. כדי לעשות זאת הוא יצר –בשיטות של הנדסה גנטית - קולטן מיוחד המוצג על קרומיהם של תאי T,ומצטיין בכושר זיהוי הדומה לזה של נוגדן. כך, למעשה, עלה בידו ליצור תאים לוחמים המסוגלים לזהות ביעילות את תאי הסרטן (המקוריים או הגרורתיים) ולהורגם.
 
מחקר זה בוצע בעכברים חסרי יכולת חיסונית, שבגופם הושתלו גידולי סרטן אנושיים, ואליהם הוזרקו תאי T אנושיים המצוידים בקולטן המהונדס. כך, בניסוי שבוצע בפועל בעכברים, בחנו המדענים את דרכי הפעולה של מערכות ביולוגיות אנושיות. אלא שבשלבים הראשונים של המחקר התקשו התאים שהוכשרו למלחמה בסרטן לאתר את תאי הגרורות שהתמקמו בעצמות. כדי להתגבר על הקושי הזה טיפלו המדענים בעכברים - מראש - בתרופה כימית מסוימת, וכן במנות קטנות של קרינה (שאינה משפיעה על הגידול הסרטני).
 
שני הטיפולים המקדימים הללו גורמים פגיעה קצרת מועד בלשד העצם, שבו מתמקמים תאי הגרורות הסרטניות, ואליו אמורים להגיע התאים שהוכשרו למלחמה בתאי הסרטן. כתוצאה מהטיפולים המקדימים (טיפול כימי או מעט קרינה), שולח לשד העצם אותות מצוקה שתכליתם גיוס עזרה מהמערכת החיסונית. אלא שאותם אותות נקלטים גם על-ידי התאים הלוחמים בסרטן, ומכוונים אותם למטרתם: האתרים שבהם התאים הסרטניים מייסדים גרורות סרטניות. אותות אלה מסייעים לתאים הלוחמים גם לחצות מחסומים המפריעים להם לחדור אל לשד העצם.
 
בעכברים שקיבלו אחד משתי הטיפולים המקדימים, ולאחר מכן קיבלו מנה של תאי T מהונדסים, המכוונים למטרתם בשיטה שפיתח פרופ' אשחר, ניכר הרס משמעותי של הגרורות הסרטניות. באחדים מהם אף הושגו נסיגה בגודל הגידול והפוגה מוחלטת של המחלה הסרטנית, שנמשכה עד לסיום המחקר. שיטת פעולה זו עשויה להתאים במיוחד לחולי סרטן המצויים בשלב שבו הם אינם מגיבים לטיפולים רגילים. מכיוון שכך, המדענים מקווים שבקרוב אפשר יהיה לבחון את השיטה בניסויים קליניים.
 
במחקרים אלה, שהאחרון מביניהם פורסם באחרונה בכתב העת המדעי JOURNAL OF CLINICAL INVESTIGATION, שיתפו מדעני מכון ויצמן פעולה עם ד"ר יהונתן פינטהוס מהמרכז הרפואי על-שם שיבא בתל-השומר.
 
עברית

עמודים