לעצב עצבים

עברית
תאי עצב רגילים (משמאל) עוברים גיזום, ואילו בתאי עצב בהם הגן KIF2A פגום תהליך הגיזום אינו יוצא לפועל
 
 
בדומה לעצים המלבלבים באביב, בזמן התפתחות מערכת העצבים שולחים תאי העצב ענפים ארוכים ודקים הקרויים אקסונים לכל חלקי הגוף הגדל. במבט נוסף אפשר להבחין כי זהו גן מטופח ומסודר: במהלך ההתפתחות מסולקים החוצה תאי עצב עודפים, שאינם נחוצים, ורבים מהאקסונים עוברים גיזום. הגינון הקפדני מעצב מחדש את מערכת העצבים תוך כדי התפתחותה וגדילתה. זהו אחד הסודות לפעילותה המוצלחת של המערכת; קיימות עדויות לכך ששיבושים בתהליך העיצוב מחדש של מערכת העצבים גורמים להפרעות נוירולוגיות שונות, כמו, לדוגמה, אוטיזם.
 
ד"ר אברהם ירון ותלמידת המחקר מאיה מאור-נוף, מהמחלקה לכימיה ביולוגית במכון ויצמן למדע, גילו באחרונה גורם הממלא תפקיד מרכזי בגיזומם של תאי העצב. "לפני שנוכל להבין לעומקם את התהליכים המעורבים בהתפתחות נורמלית או במחלות של מערכת העצבים, עלינו לזהות את השחקנים הראשיים בתהליכים אלה", אומר ד"ר ירון. "עד עכשיו היה בידינו רק מידע מועט ביותר על זהותם".
 
 
גיזום האקסונים אינו תהליך חיצוני אלא מתחיל בתוך תאי העצב: מבנים ארוכים, הקרויים מיקרו-צינוריות (microtubules), שחוצים את האקסונים לאורכם, הם הראשונים להתפרק. המיקרו-צינוריות משמשות הן כשלד המייצב את מבנה האקסון והן כמערכת הסעה: מטענים מגוונים, ובהם מולקולות
מאיה‭ ‬מאור‭-‬נוף‭ ‬וד‭"‬ר‭ ‬אברהם‭ ‬ירון‭. ‬גיזום
איתות וחומרים אחרים, נוסעים הלוך וחזור על מסילת המיקרו-צינוריות. המדענים בקשו לגלות את המנגנונים השולטים בהתפרקות המיקרו-צינוריות במהלך גיזום האקסון. מחקר בתאי עצב סנסוריים שגודלו בתרבית הראה, כי גורם הקרוי KIF2A הוא המבצע את המלאכה. באופן מעניין, KIF2A הוא גם חבר במשפחת החלבונים אשר נוסעת על גבי המיקרו-צינורות ומובילה מטענים שונים.
 
כדי להבין טוב יותר את התפקיד שממלא KIF2A בהתפתחות מערכת העצבים ובגיזום אקסונים, קיבלו מדעני המכון עכברים מהונדסים גנטית מעמיתים באוניברסיטת טוקיו, בהם נפגע הגן KIF2A. בעכברים אלה האקסונים גדלו כרגיל אולם תהליך הגיזום עוכב – המיקרו-צינוריות והאקסון נשמרו כפי שהם. כתוצאה מכך העור של העכברים – יעד מרכזי לאקסונים של תאי עצב סנסוריים – מנוקד כולו באין-ספור תאי עצב. ממצאים אלה חיזקו את ההשערה כי KIF2A ממלא תפקיד מפתח בגיזום – בלעדיו התהליך אינו יוצא לפועל.
 
כיצד הגיזום מתרחש? ממצאי המחקר מציעים כי KIF2A נשלט על-ידי מולקולות המכונות נוירוטרופינים, הממלאות את תפקיד "הגנן הראשי". הנוירוטרופינים נמצאים ברקמות היעד של תאי העצב (כמו, לדוגמה, במקרה של תאי העצב הסנסוריים שנבדקו בניסוי זה, העור), ומשם הם "מושכים אליהם" את האקסונים, וכך מכוונים את צמיחתם של תאי העצב בכיוון הנכון ותומכים בהישרדותם. אולם כמות הנוירוטרופינים מוגבלת, ולכן, בסופו של דבר, האקסונים מתחרים ביניהם על האותות שהם שולחים. כאשר האקסון אינו מקבל איתות של נוירוטרופין, ה-KIF2A שבו הופך לפעיל, ובעקבות כך מופעל הגיזום.
 
השלבים האלה יוצרים תהליך שבמבט ראשון עשוי להראות אקראי, אולם למעשה יש בו מידה גדולה של סדר. כך נשמרת בקרה קפדנית לא רק על כמות האקסונים, שאחראית לסידור מיטבי של תאי עצב, אלא גם על רצף השלבים של תהליך הגיזום, המוכתבים על-ידי הגנים. ההתקדמות ההדרגתית והמתוכננת מבטיחה שאם השלב הראשון – התפרקות המיקרו-צינוריות – אינו מתרחש, יתר השלבים יעוכבו.
 
במחקר קודם בקבוצתו של ד"ר ירון, שנעשה ביחד עם ד"ר אלי ארמה מהמחלקה לגנטיקה מולקולרית, נחקר מנגנון אחר השולט בעיצוב מחדש של מערכת העצבים: האפופטוזיס (מוות מתוכנת של תאים). שילוב הממצאים של שני המחקרים מניח את היסודות להבנת התפתחותה של מערכת העצבים: פרץ של גדילה והתפתחות, לצד גיזום, דילול ועישוב, הנעשים בשיקול דעת. לדברי ד"ר ירון, גילוי נקודת שיווי המשקל בין שני התהליכים הסותרים, וההבנה כיצד היא מושגת, יאפשרו לרדת לעומקן של מחלות הנגרמות כתוצאה מחוסר איזון. לדוגמה, קיימות עדויות לכך שבמוחם של אוטיסטים לא מתבצע גיזום מספק, וכך נוצר עודף של קשרים עצביים. ד"ר ירון סבור שפעילות לא תקינה של KIF2A עלולה להיות מעורבת בכך.
 
 
 
מאיה‭ ‬מאור‭-‬נוף‭ ‬וד‭"‬ר‭ ‬אברהם‭ ‬ירון‭. ‬גיזום
מדעי החיים
עברית

קריאת אזהרה

עברית
מימין: ד"ר אנדרו קובלנקו, סאונג-הון יינג, פרופ' דוד ולך, ד"ר ביאטה טוט וד"ר טא-בונג קאנג
 
 
שבץ מוחי, התקפי לב ומחלות רבות נוספות גורמים להרס רב של תאים ורקמות, המכונה נמק (נקרוזיס). מדובר באירוע אלים: מותו של כל תא מלווה בקריעת הקרום ובשפיכה החוצה של חומרים הגורמים לדלקת, שכתוצאה ממנה נגרם נמק של תאים נוספים. מחקר חדש במכון ויצמן למדע עשוי לסייע בפיתוח תרופות ממוקדות, שימנעו את הרס הרקמות הנובע מדלקת ומנמק.
 
המחקר, שבוצע במעבדתו של פרופ' דוד ולך מהמחלקה לכימיה ביולוגית, התמקד בקבוצת אנזימים מעבירי אותות, ובהם האנזים קספאז 8, אותו גילה פרופ' ולך לפני כמעט שני עשורים. מחקרים קודמים בארה"ב, בסין ובאירופה הראו, כי קבוצת חלבונים זו מובילה לנמק "מתוכנת", כלומר מכוון מראש, המיועד להעלים תאים פגומים ונגועים. גילוי זה הוליד תקווה, כי ניתן יהיה למנוע הרס מוגזם של רקמות במחלות שונות - אם תימצא דרך למנוע מחלבונים אלה להוביל לנמק.
 
אך במחקר החדש, אשר פורסם בכתב-העת Immunity, משמיעה קבוצת המחקר של פרופ' ולך אזהרה. המדענים גילו, כי בתנאים המעודדים דלקת, כלומר בנוכחותן של מולקולות מסוימות שמקורן בחיידקים, או של איומים מולקולריים אחרים, עשויה אותה קבוצת אנזימים מאותתים להוביל בתאים מסוימים לתהליך אחר לגמרי. האנזימים יכולים לעורר שרשרת אחרת של תגובות ביוכימיות, שלא הייתה ידועה קודם, המובילה לדלקת בדרך ישירה יותר, ללא הנמק: היא מעודדת את יצירתם של חלבוני בקרה דומים להורמונים, הקרויים ציטוקינים. המחקר התבסס בעיקר על ניסויים בעכברים מהונדסים גנטית, שהאנזים קספאז 8 היה חסר בתאים חיסוניים מסוימים שלהם. החוקר הבתר-דוקטוריאלי ד"ר טא-בונג קאנג תרם תרומה מרכזית למחקר זה. כמו כן השתתפו בו סאונג-הון יינג, ד"ר ביאטה טוט וד"ר אנדרו קובלנקו.
 
הממצאים מצביעים על כך, שכדי לפתח טיפולים ממוקדים למניעת הנמק, צריכים המדענים ללמוד יותר על האותות שמעבירים קספאז 8 והשותפים המולקולרים של אנזים זה. מאחר שאותות אלה עשויים להוביל לתופעות שונות לגמרי זו מזו, צריכים המדענים להגיע להבנה מתי בדיוק מוביל התהליך ישירות לנמק ומתי הוא אינו מוביל במישרין לכך. להבחנה זו יש חשיבות עצומה: נמק של רקמות מתרחש במיליארדי בני אדם הסובלים ממחלות רבות, החל משבץ והתקפי לב, וכלה בזיהומים נגיפיים ובניוון הכבד כתוצאה משתיית יתר של אלכוהול.
 
מימין: ד"ר אנדרו קובלנקו, סאונג-הון יינג, פרופ' דוד ולך, ד"ר ביאטה טוט וד"ר טא-בונג קאנג
מדעי החיים
עברית

עקרון הרצף

עברית
בבית החרושת הרוחש שבתא, שבו, בכל רגע נתון, מופעלים גנים והופכים לחלבונים, שמור מקום של כבוד לחלבון NF-kappaB. חלבון זה מפקח על הייצור של גנים רבים הנחוצים לתפעול השוטף של התא. אך בעוד שהשפעתו של NF-kappaB על תאים בריאים היא ארעית ומתוזמנת לפי הצורך, הרי שבמקרי דלקת כרונית ובסוגי סרטנים מסוימים נעשית הפעילות שלו קבועה. מצב כזה של פעילות רציפה תורם להתפשטותם של תאים סרטניים יוצרי גרורות, וכן להגברת העמידות של גידולים לטיפולים כימותרפיים.
פרופ' רבקה דיקשטיין. פעילות רציפה
NF-kappaB משפיע ישירות על צמיחת גידולים באמצעות דיכוי תהליך המוות המתוכנת של תאים (אפופטוזיס), וכן באמצעות השפעה על תהליכים תאיים שגורמים לגדילה בלתי-מבוקרת. ממצאים אלה הפכו את NF-kappaB ואת המסלולים שהוא מפעיל למטרות מרכזיות לטיפול תרופתי בסרטן.
 
רבים מהמחקרים מתמקדים בשלב ההתחלתי, שבו, בתגובה לאותות חיצוניים מסוימים, NF-kappaB נכנס לפעולה, ועובר מהציטופלסמה של התא אל הגרעין. פרופ' רבקה דיקשטיין, מהמחלקה לכימיה ביולוגית, בוחנת דווקא את השלב האחרון בשרשרת הפעילות שלו, כלומר, את האופן בו הוא גורם לביטוי של גנים מסוימים. עם אלה נמנים למעלה מ-100 גנים שזוהו עד כה, שמהם מיוצרים, בין היתר, חלבונים המעורבים בדלקת ובגדילה של תאים. בנוסף, NF-kappaB משפעל גנים שמטרתם העיקרית היא להפסיק את פעילותו שלו, באמצעות מנגנון של משוב שלילי. מחקרים קודמים שלה קבעו כיצד מצליח NF-kappaB להפעיל גנים במהירות רבה כל כך בתגובה לאותות חיצוניים, בעיקר אותות המאיימים על הישרדותו של התא. בנוסף, היא חוקרת כיצד משפיע NF-kappaB על שיעתוקם של הגנים שהוא מפעיל.
 
השיעתוק הוא השלב הראשון והחשוב בתהליך התבטאותם של גנים. הוא כולל מספר שלבים עיקריים: איתחול, הארכה (כלומר ייצור מולקולת אר-אן-אי), עיבוד וסיום. פרופ' דיקשטיין גילתה, כי ה-NF-kappaB מבקר בעיקר את השלב השני, שלב ההארכה. הוא ממלא תפקיד של "מנהל", אשר מגייס קבוצה של "עובדים" להיכנס לפעולה. התוצאה של המאמץ המשותף של כל הגורמים האלה היא עלייה משמעותית בכמות מולקולות האר-אן-אי, המוכנות לקראת תרגומן לחלבון פעיל.
 
פרופ' דיקשטיין ותלמיד המחקר גיל דיאמנט גילו באחרונה מנגנון בקרה לא מוכר אשר מציע הסבר אפשרי לפעילות הרצופה והלא רצויה של NF-kappaB במקרים של דלקת כרונית וסרטן, בו מעורב אחד החלבונים מ"צוות העובדים" של ההארכה, הקרוי DSIF. החוקרים גילו, ש-DSIF קשור למנגנון המשוב השלילי, וכי הוא מתאם בין שלב ההארכה לשלב העיבוד: ביחד עם NF-kappaB הוא מקדם את הביטוי של קבוצת גנים שתפקידם הוא להפסיק את פעילותו של NF-kappaB. תאים שבהם הגן DSIF אינו קיים, או שפעילותו מופרעת, הם בעלי סיכון מוגבר להראות פעילות לא מבוקרת של NF-kappaB הקשורה להתפתחות מחלות. ממצאי המחקר התפרסמו באחרונה בכתב-העת המדעי  Cell Reports.
 
לממצאים אלה עשויה להיות משמעות יישומית ישירה למאבק במחלת הסרטן. NF-kappaB מעורב בשורה ארוכה של תהליכים ביולוגיים, ולכן, ניסיון להתערב באופן ישיר בפעילותו עלול לגרום פגיעה בגנים רבים, ולפיכך לתופעות לוואי רבות. תוצאות המחקר רומזות על אפשרות להתערבות עקיפה באמצעות גורמים אחרים, כמו DSIF, שהשפעתו מוגבלת למספר מצומצם יותר של גנים, ולכן הוא עשוי להבטיח טיפול בררני יותר, ולהפחית את תופעות הלוואי.
מדעי החיים
עברית

קוצו של יו"ד

עברית
לפני מספר שנים גילו פרופ' מייק פיינזילבר וחברי קבוצתו, מהמחלקה לכימיה ביולוגית במכון ויצמן למדע, תגלית מפתיעה: משפחת חלבונים, הקרויים אימפורטינים, שעל-פי הסברה המקובלת נמצאים אך ורק בסמוך לגרעין התא, התגלו גם בקצותיהם המרוחקים של התאים הארוכים ביותר: תאי עצב של מערכת העצבים ההיקפית. תאים אלה יוצרים שלוחות – הקרויות אקסונים – שאורכן יכול להגיע עד לאורך של מטר באדם בוגר.
מימין: רותם בן-טוב פרי, מאיר רוזנבאום ופרופ' מייק פיינזילבר. שלוחות
התפקיד העיקרי של האימפורטינים הסמוכים לגרעין היה ידוע: חלבונים אלה מובילים חומרים שונים אל תוך גרעין התא והחוצה ממנו, דרך הקרום המגן על הגרעין. פרופ' פיינזילבר וחברי קבוצתו הראו, כי גם האימפורטינים שבאקסונים, המרוחקים מגרעין התא, ממלאים תפקיד בהובלה, אם כי מסוג שונה: כאשר תא העצב נפגע בנקודה כלשהי לאורך האקסון, מתגייסים האימפורטינים לעזרה ומתפקדים כמעין "מערכת התראה", אשר מסיעה את אותות המצוקה ליעדם - גרעין התא.
 
תגלית זו העלתה שאלה מעניינת: כיצד מגיעים האימפורטינים לאקסונים? עדויות ראשוניות הצביעו על האפשרות שאחד האימפורטינים החשובים, הקרוי אימפורטין בטא-1, מיוצר בדיוק בזמן ובמקום בו הוא נדרש: לאחר פגיעה בתא העצב הוא נוצר באקסון עצמו, בסמוך למקום הפגיעה. עדויות אלה עמדו בסתירה לסברה שהתבססה בעקבות שנים ארוכות של מחקר מדעי, כי חלבונים אינם מיוצרים בשלוחות אקסונליות של תאי העצב, אלא בגוף התא בלבד. סברה זו התבססה, בין היתר, על העובדה שבשיטות מיקרוסקופיות היה קשה לגלות ריבוזומים (בתי חרושת לחלבונים) באקסונים.
 
יישוב הסתירה אינו משימה פשוטה: השיטות המקובלות להשתקת גנים –במטרה ללמוד את תפקידם – אינן יעילות במקרה זה, שכן האימפורטינים הם חלבונים חיוניים להישרדות התא ובעל החיים כולו. במחקר של רותם בן-טוב פרי, תלמידת מחקר משותפת בקבוצתו של פרופ' פיינזילבר ובקבוצתו של ד"ר אברהם ירון, התגלתה אפשרות להבחין בין חלבון האימפורטין בטא-1 שבגוף התא לבין אחיו שבאקסון: התברר, כי מולקולת האר-אן-אי-שליח המקודדת לחלבון שבאקסון מכילה פיסה נוספת, שאחראית לשליחת האר-אן-אי לאקסון, ולכן היא ארוכה יותר. כדי לפגוע באופן ספציפי בחלבון זה השתמשו המדענים, ביחד עם פרופ' ג'ף טוויס מאוניברסיטת דרקסל שבפילדלפיה, בטכנולוגיות מדויקות למחיקת גנים. במקום למחוק את הגן במלואו, הם הסירו רק את פיסת האר-אן-אי הנוספת. כך לא נפגע האימפורטין בטא-1, אשר נוצר בגוף התא וחיוני להישרדות העובר.  
 
העכברים המהונדסים שנוצרו בדרך זו אכן ייצרו כמויות תקינות של אימפורטין בטא-1 בגוף תאי העצב, אך לא באקסונים. לעכברים אלה נדרש פרק זמן ארוך יותר כדי להתאושש מפגיעה עצבית, וגם הגנים המופעלים בדרך כלל בתגובה לפגיעה כזו הראו הפעלה נמוכה יחסית. כל העדויות הצביעו על כך שהאימפורטין בטא-1, אשר מדווח לתא העצב על פגיעה, אכן מיוצר באופן מקומי באקסון.
 
פרופ' פיינזילבר: "בניסויים אלה הצלחנו, זו הפעם הראשונה, להראות שעיכוב בהובלה של אר-אן-אי-שליח מסוים לאקסון גורם להיעלמות של החלבון המקודד מהאקסון. המחקר מוכיח באופן חד-משמעי, כי האימפורטין בטא-1 מיוצר באקסונים,  ומאשר את התפקיד החיוני שממלאים חלבונים אלה בשיקום של תאי עצב". הממצאים, שהתפרסמו באחרונה בכתב העת Neuron, עשויים להצביע על דרכים לטיפול יעיל יותר בפגיעות עצביות,  ולהאצת השיקום של תאי עצב פגועים.
מימין: רותם בן-טוב פרי, מאיר רוזנבאום ופרופ' מייק פיינזילבר. שלוחות
מדעי החיים
עברית

בין שתי מולקולות

עברית
 
 
אוכלוסיית חיידקים שחיה בקרקעיתו של אגם בקליפורניה מצאה את עצמה, לפני זמן לא רב, במרכזה של מחלוקת מדעית: קבוצת מדענים טענה כי יצורים זעירים אלה, אשר חיים על קרקע עשירה בתרכובת הקרויה ארסנאט, המבוססת על היסוד הרעיל ארסן, יכולים לנצל תרכובת זו כתחליף לפוספאט – תרכובת הזרחן החיונית לכל היצורים החיים. בעקבות הטענה, שהופרכה מאז, עלתה שאלה אחרת: כיצד מצליחים יצורים שחיים בסביבות עתירות ארסנאט לברור בינו לבין התרכובת הנכונה, כלומר פוספאט? תשובה לשאלה זו התקבלה באחרונה במחקר בראשותו של פרופ' דן תופיק ממכון ויצמן למדע, שהתפרסם בכתב-העת המדעי Nature.
מימין: פרופ' דן תופיק, קורינה גולדין-אזולאי, ד"ר מיכאל אליאס ואלון ולנר. יכולת הבחנה
מבחינה כימית-פיסיקלית, ההבדל בין פוספאט לארסנאט הוא דק. ובכל זאת, בעוד הראשון חיוני לחיים, השני מהווה איום גדול עליהם. כיצד, אם כן, מצליחים חיידקים המוקפים בארסנאט להבחין בין שתי מולקולות שהן כמעט זהות בגודלן, בצורתן, ובתכונותיהן הכימיות? כדי לחקור את השאלה בחנו פרופ' תופיק, יחד עם החוקר הבתר-דוקטוריאלי ד"ר מיכאל אליאס, תלמיד המחקר אלון וולנר, וטכנאית המעבדה קורינה גולדין מהמחלקה לכימיה ביולוגית, ביחד עם עמיתים מציריך, את החלבון שאחראי לגיוס הפוספאט. החלבון, הקרוי PBP) phosphate binding protein), ממוקם על הקרום החיצוני של החיידק, שם הוא לוכד את מולקולות הפוספאט ומעביר אותן למשאבות - המכניסות אותן לתא.  
 
צוות המדענים הישווה את הפעילות של חלבוני PBP שנלקחו מסוגי חיידקים שונים: חלקם מחיידקי מעיים, הרגישים לארסנאט, וחלק מחיידקים עמידים לחומר. הם גילו, כי בעוד שהחיידקים הרגילים קשרו מולקולות פוספאט בזיקה הגבוהה פי 500 מזיקתם לארסנאט, בחיידקים העמידים קפץ היחס לפי 5,000. כלומר, כדי להתמודד עם סביבה רעילה פיתחו החיידקים מנגנון בררני אשר מבטיח אספקה מספקת של פוספאט, ובה בעת מוודא כי לא תחדור ולו מולקולה אחת של ארסנאט. בהמשך, כדי להבין כיצד בורר חלבון ה-PBP פוספאט מארסנאט, יצר ד"ר אליאס גבישים של החלבון, כשהוא קשור לכל אחת מהמולקולות. בדיקה ראשונית הראתה, כי קישור הארסנאט לחלבון נעשה באופן זהה לקישור הפוספאט: הן המולקולות הקשורות והן החלבון נראו זהים.
 
חיידקים על מצע עשיר בארסנאט. צילום: נאס"א
ד"ר אליאס שיער, כי המפתח עשוי להיות קשר כימי יחיד ולא רגיל בין אטום מימן שבחלבון ה-PBP לבין המולקולה הנקשרת אליו. למרבה הצער, השיטות המקובלות לפיענוח מבנה חלבונים אינן מגיעות בדרך כלל לדרגת רזולוציה המאפשרת לראות הבדלים כאלה. אולם, לאחר שהגיע עד כאן, הצוות סירב להרים ידיים. המדענים הצליחו למתוח את גבול היכולת של הטכנולוגיה, ולהגיע לרמת הפרדה של אנגסטרום בודד (עשירית מיליונית המילימטר) – הפרדה שמאפשרת לזהות את אטום המימן, ולהשוות את הקשר שהוא יוצר עם שתי המולקולות השונות.
 
המדענים גילו, כי למרות שהקישור, בשני המקרים, מתרחש בתוך בקע צר בעמקי החלבון, הזוויות של הקשר המימני הנוצר הן שונות. במקרה של הפוספאט נוצר קשר אידאלי "לפי הספר". לעומת זאת, מולקולת הארסנאט, למרות שהיא גדולה רק במעט, נדחקת אל המימן באופן שגורם לה להיקשר אליו בזווית לא טבעית, מעוותת. פרופ' תופיק סבור, כי בעקבות זאת נוצרת דחייה בין הארסנאט לבין אטומים אחרים באיזור הבקע, וכי דחייה זו מונעת מה-PBP לקשור את מולקולות הארסנאט בזיקה המאפשרת לו להתחרות בפוספאט ולחדור  אל פנים התא.
 
חשיבותם של הממצאים היא לא רק לשם פתרון תעלומה ביולוגית. "הפוספאט הוא מרכיב חיוני ביותר לקיומו של יצור חי, ועם זאת, במקומות רבים הוא אינו מצוי בשפע. מסיבה זאת יש עניין רב בשאלה כיצד אורגניזמים מצליחים לקלוט אותו", אומר פרופ' תופיק. "מחקר זה הוא הראשון שהצביע על מנגנון ההבחנה של חלבון ה-PBP בהקשר לארסנאט. מלבד זאת, המחקר מהווה דוגמה מרתקת ליכולות הזיהוי של חלבונים, ושל המנגנונים העדינים המאפשרים להם להבחין בין שתי מולקולות כמעט זהות".   
 

 
 
מימין: פרופ' דן תופיק, קורינה גולדין-אזולאי, ד"ר מיכאל אליאס ואלון ולנר. יכולת הבחנה
מדעי החיים
עברית

מירוץ חימוש

עברית
בספרו הידוע, "מלחמת העולמות", מתאר הרברט ג'ורג' ולס פלישה של "מפלצות מאדים" לכדור-הארץ. המפלצות חזקות בהרבה מבני-האדם, והאנושות ניגפת לפניהם. אבל בסופו של דבר, המפלצות נכנעות ועוזבות את כדור-הארץ - מכיוון שלא יכלו לעמוד כנגד חיידקים ונגיפים. בראשית המאה הקודמת, גם האנושות עצמה התקשתה במאבק נגד גורמי המחלות הזעירים. מחלות זיהומיות היו אחת מסיבות המוות השכיחות ביותר. מה שהיטה את הכף אז לטובת האנושות, במאבק נגד החיידקים גורמי המחלות, היה גילוי האנטיביוטיקות, כמו הפניצילין. אולם, עם הזמן התברר שהחיידקים מפתחים עמידות לתרופות האנטיביוטיות בקצב שמאיים להחזיר את המצב לקדמותו. למעשה, מאז גילוי האנטיביוטיקה הראשונה, נמצאים בני- האדם והחיידקים במירוץ חימוש מתמיד, והחיידקים מוצאים דרכים להתגבר כמעט על כל אנטיביוטיקה שאנו מפתחים.
פרופ' איתן ביבי, ניר פלומן ואסנת תירוש. עמידות
אחד מכלי ההתגוננות של החיידקים הוא יצירה של חלבונים המסלקים את האנטיביוטיקה מהתא. חלבונים אלו נמצאים במעטפת התא של החיידק, שם הם פועלים כמעין שואב אבק המסלק חומרים מזיקים מתוך התא ומהמעטפת. כל אחד מהחלבונים האלה מסוגל לסלק מיגוון רחב של אנטיביוטיקות, ולכן הם קרויים multidrug transporters.
 
כמו שואב אבק חשמלי, גם חלבונים אלו זקוקים לאנרגיה כדי לפעול. לשם כך, החלבון מנצל את מפל ריכוזי הפרוטונים סביב קרום התא, כך שעל כל מולקולה של אנטיביוטיקה המסולקת מהתא מוכנס לפחות פרוטון אחד פנימה. כדי להכניס פרוטון, החלבון צריך לקשור אותו מבחוץ ולשחררו בפנים, ואולם, המנגנון המאפשר קישור ושיחרור פרוטון היה עד לאחרונה לוטה בערפל. פרופ' איתן ביבי, ותלמידי המחקר ניר פלומן ואסנת תירוש, מהמחלקה לכימיה ביולוגית במכון ויצמן למדע, חקרו את התופעה הזאת באמצעות החלבון MdfA מהחיידק אשריכיה קולי. בשני מחקרים מקבילים עלה בידם לגלות את המנגנון האחראי לקישור הפרוטון ואת התנאים הדרושים לשיחרורו. המדענים יצרו, בטכניקות של הנדסה גנטית, חלבונים מוטנטים בעלי יכולת לקשור ולשחרר יותר מפרוטון אחד תוך כדי סילוק מולקולה אחת של אנטיביוטיקה.
 

 

במונחים מיקרוסקופיים, קרום התא מכיל ממברנה כמעט בלתי-חדירה,המורכבת מליפידים (חומרים דמויי שומן), והחלבון מוטמע בה וחוצה אותה לכל עוביה. המחקר הראשון, שהתפרסם בכתב-העת המדעי Molecular Cell, זיהה בחלבון את האתר החומצי האחראי לקישור ולשיחרור הפרוטון. אתר זה נמצא בתווך הממברנה, ומשמש כמעין תחנת עצירה של הפרוטון בין שני צידיה. ממצאי המחקר מראים, שהאתר החומצי יכול לחוש גם את קישור האנטיביוטיקה לחלבון. בעת קישור אנטיביוטיקה משחרר האתר את הפרוטון הקשור אליו לתוך התא. מנגנון זה מאפשר לתאם את הוצאת האנטיביוטיקה עם הכנסת הפרוטון. המנגנון פועל גם בכיוון השני, כלומר, גם קישור של פרוטון יגרום לשיחרור האנטיביוטיקה הקשורה לחלבון. תופעה זו ידועה בשם "תחרות" על קישור. ואכן, המדענים מצאו שתחרות על הקישור היא חיונית לפעילות החלבון MdfA. למרבה ההפתעה, מתברר שהאנטיביוטיקה והפרוטון נקשרים למקומות שונים, ומכאן שהמידע לגבי קישור של פרוטון או אנטיביוטיקה מעובד על-ידי החלבון ומועבר לאתר הקישור השני. השינויים המבניים המתרחשים בחלבון תוך כדי עיבוד המידע על קישור הפרוטון עומדים בבסיס תהליך סילוק האנטיביוטיקה מהתא.
 
מודלים תלת-ממדיים של חלבון MdfA טבעי ומוטנטי. למעלה: שתי חומצות האמינו החומציות בחלבון הטבעי, האחראיות לקישור הפרוטון, מסומנות בשחור, וארבע חומצות האמינו המוטנטיות, אשר מאפשרות הוצאת אנטיביוטיקה תוך קישור שני פרוטונים, מסומנות באפור כהה. למטה: התפלגות מטענים חשמליים על החלבון הטבעי (משמאל) והמוטנט (מימין). מטענים חיוביים מסומנים בכחול, מטענים שליליים מסומנים באדום
במחקר השני ניסו פרופ' ביבי ותלמידיו לאתגר את החלבון, כך שיוכל להעביר שני פרוטונים. החלבון MdfA יכול להכניס רק פרוטון אחד עבור כל מולקולת אנטיביוטיקה מסולקת, ולכן אין באפשרותו לספק לתא החיידק הגנה מפני חומרים רעילים מסוימים, שסילוקם מהתא מחייב הכנסה של שני פרוטונים. החוקרים סרקו שינויים גנטיים אקראיים בחלבון, ומצאו מוטציה שמעניקה עמידות גם לחומרים המחייבים מעבר שני פרוטונים. ואכן, שינויים גנטיים אלו יצרו אתר חומצי נוסף, הממוקם קרוב לאתר קישור הפרוטון שבחלבון הטבעי.
 
בעזרת האתר החומצי החדש מסוגל החלבון המוטנטי להעביר פרוטון נוסף. תוצאות אלו עוררו השערה, שמנגנון העברת הפרוטון הוא מודולרי, כך שיצירת אתרים חומציים באיזור זה של החלבון עשויה לאפשר העברת שני פרוטונים. תפיסה זו אוששה בטכניקה של הנדסה גנטית, בניסויים שבהם תוכננו אתרים חומציים נוספים אשר איפשרו עמידות לאנטיביוטיקות המחייבות מעבר של שני פרוטונים. ממצאים אלו התפרסמו בכתב-העת המדעי רשומות האקדמיה האמריקאית למדעים (PNAS), והם ממחישים את הפוטנציאל הרב של החיידק לרכוש עמידות לאנטיביוטיקות חדשות. 
 
חקר מנגנון הפעילות של חלבונים המקנים עמידות חשוב במיוחד בעת הזו, שבה קשה לפתח אנטיביוטיקות חדשות, וגילויים בתחום זה נעשים נדירים יותר ויותר. הבנה עמוקה יותר של דרך פעולתם של החלבונים המעורבים בתהליכים אלה תסייע לפיתוח דרכים לעיכובם, דבר שיקנה לאנושות כלי נוסף במירוץ החימוש מול החיידקים גורמי המחלות. 
 
תיאור המנגנון שהציעו המדענים לקישור הפרוטון ולשיחררו, תוך הוצאת מולקולת אנטיביוטיקה מתא החיידק
 
 
 
 
 
פרופ' איתן ביבי, ניר פלומן ואסנת תירוש. עמידות
מדעי החיים
עברית

הצילו את המציל

עברית
חלבונים פגומים וחלבונים שסיימו את תפקידם בתא יש לסלק ולפרק, אך בו בזמן יש להקפיד שחלבונים חיוניים לא ישוגרו בטעות ל"גריסה". מחקר חדש של מדעני המכון, בראשות ד"ר מיכל שרון מהמחלקה לכימיה ביולוגית, מגלה כיצד עובד האנזים ה"מציל", אשר מונע פירוק לא רצוי של חלבונים חיוניים. אנזים זה מציל, בין היתר, חלבונים בולמי גידולים סרטניים – כמו p53 ואחיו המוכר פחות, p73 – וכך מגן מפני סרטן.
מימין: פרופ' יוסף שאול, גילי בן ניסן, ד"ר מיכל שרון ואורן מוסקוביץ'. גריסה.פירוק חלבונים פגומים, או חלבונים שסיימו את תפקידם, נעשה באמצעות תהליך "ביורוקרטי" מסודר ומבוקר, שבו מסומנים החלבונים המועמדים לפירוק בתווית מיוחדת – יובקוויטין – ומועברים אל "האגף לפירוק חלבונים", הפרוטאוסום. לאחר זיהוי התווית – שנעשה באמצעות יחידה מסוימת של הפרוטאוסום – נכנס החלבון ליחידה אחרת, המתפקדת כ"מגרסה", שם הוא מתפרק למרכיביו. אולם מלבד התהליך ה"ביורוקרטי", שגילויו זיכה את רוז, הרשקו וצ'חנובר בפרס נובל בכימיה לשנת 2004, הולכת ומתבהרת בשנים האחרונות חשיבותו של תהליך פירוק נוסף, פסיבי ו"ספונטני" יותר. מתברר, כי חלבונים מסוימים – שהם חסרי מבנה מקופל ומסודר, במלואם או בחלקם – יכולים למצוא את דרכם לתוך המגרסה מבלי שעברו את שלבי הסימון והזיהוי. זהו אינו תהליך שולי: כמעט שליש מהחלבונים בתא כוללים מקטעים לא מקופלים, ובהם גם חלבונים חשובים לתיפקוד התא, הממלאים תפקידי בקרה והעברת אותות. למעשה, חמישית מכלל חלבוני התא מפורקים באופן זה. לכאורה, מדובר ב"שואב אבק" יעיל, אשר שומר על סדר וניקיון בתא. אך כיצד מונעים ממנו לשאוב את כל הנקרה על דרכו? שאלה זו מסובך לחקור – משום ששני המסלולים, ה"ביורוקרטי" והפסיבי, מתקיימים זה לצד זה בתא.

לפני מספר שנים גילה פרופ' יוסף שאול, ראש המחלקה לגנטיקה מולקולרית במכון, רמז ראשון לתשובה: הוא זיהה את ה"מציל", אשר מונע פירוק לא רצוי של חלבונים בפרוטאוסום. מדובר באנזים הקרוי NQO1, אשר מנהל חיים כפולים: הוא נלחם בתרכובות חמצן פעילות, וכך מגן על התא מפני עקה חימצונית, ובנוסף, הוא גם מגן על חלבונים חיוניים מפני פירוק. כיצד בדיוק הוא עושה זאת? שאלה זו עמדה במרכז המחקר הנוכחי, שביצעו אורן מוסקוביץ, נמרוד חזן, הודיה קיסר, גילי בן ניסן, וד"ר יצחק מיכאלבסקי מקבוצתה של ד"ר שרון. כדי לחקור לעומק את יחסי הגומלין בין האנזים NQO1 לבין הפרוטאוסום במסלול הפירוק הפסיבי, יצרו המדענים מערכת ניסוי מלאכותית, שלתוכה הכניסו את האנזים ואת יחידת ה"מגרסה" של הפרוטאוסום בלבד – ללא היחידה שאחראית לזיהוי תווית היוביקוויטין. כך עלה בידם לבודד ולחקור את המסלול הרצוי. הגורם השלישי שהוסיפו המדענים למערכת הוא מולקולה שמקורה בוויטמין B2, הקרויה FAD. קשירה של שתי מולקולות FAD לאנזים המורכב משתי יחידות של NQO1 היא שמאפשרת לו לבצע את תפקידיו בתא.

בדיקת האנזים NQO1 בשיטות של ספקטרומטריית מאסות גילתה, שקשירת המולקולות FAD מייצבת את המבנה המרחבי שלו. כאשר בדקו המדענים צורה נוספת של האנזים, שבה אתר הקישור ל-FAD הוא פגום, וכן כאשר הסירו את מולקולות FAD מאנזים תקין, נוצר אנזים חסר צורה, שאינו מסוגל להתקפל למבנה מסודר. בהמשך התגלה, כי אנזימים חסרי צורה אלה מפורקים בפרוטאוסום, ו"נעלמים" ממערכת הניסוי. לעומת זאת, כאשר הוסיפו המדענים למערכת הניסוי כמויות גדולות של FAD, הם הצליחו להחזיר לאנזימים – הרגיל והמוטנטי – את צורתם, וכך להצילם מפירוק.

מחקר בתאים חיים, שנעשה בשיתוף עם פרופ' יוסף שאול ועם תלמיד המחקר מקבוצתו, פטר צבקוב, הרחיב את התמונה. מתן ויטמין B2 לתאים אנושיים הוביל לא רק לעלייה ברמת ה-NQO1 ולייצוב המבנה שלו, אלא גם לעלייה ברמת p53. תמונה דומה התקבלה בבדיקת תאי סרטן שד, שאינם מכילים את האנזים בגלל הפגם בקשירת FAD. הוספת B2 לתאים אלה הצליחה להציל את NQO1, וכך איפשרה לו להציל את p53.

ממצאי המחקר, שהתפרסמו באחרונה בכתב-העת המדעי Molecular Cell, מגלים כי יחסי הגומלין בין הפרוטאוסום לבין NQO1 מבוססים על עיכוב הדדי: הפרוטאוסום מפרק אנזימי NQO1 חסרי מבנה, ואילו האנזים "חוסם בגופו" את הפעילות ההרסנית של הפרוטאוסום,ובדרך זה מציל מפירוק לא רק את עצמו, אלא גם חלבונים אחרים. מרכיב חשוב בבקרה ההדדית הזו הוא גורם תזונתי חיצוני – ויטמין B2, אשר משפיע על מבנה האנזים, וכך שולט בתיפקודו. המדענים סבורים, כי ייתכן שהתופעה שגילו, כלומר שגורם מטבולי משפיע על תיפקוד מערכת באמצעות השפעה על המבנה, אינה ייחודית למסלול שחקרו.

המוטציה אשר פוגעת ביכולתו של NQO1 לקשור FAD, ששכיחותה בקרב בני אדם לבנים עומדת על כ-4%, קיימת בחמישית מהאוכלוסייה האסיאתית. המוטציה גורמת לכך שהתאים אינם מסוגלים להתמודד היטב עם עקה חימצונית, ומכילים רמות נמוכות של p53 ו-p73, ולכן הם פגיעים לסרטן – במיוחד לסרטן השד וללוקמיה. ממצאי המחקר רומזים על חשיבותו התזונתית של ויטמין B2, ובפרט אצל אנשים הסובלים מהמוטציה.
יחסי הגומלין בין הפרוטאוסום לבין NQO1 מבוססים על עיכוב הדדי: הפרוטאוסום מפרק אנזימי NQO1 חסרי מבנה (שאינם קשורים ל-FAD), ואילו האנזים, כשהוא קשור ל-FAD, מונע מהפרוטאוסום לפרק חלבונים אחרים – כולל אותו עצמו
 
 
מדעי החיים
עברית

ספירת מלאי

עברית
סידן הוא אחד המינרלים החשובים בגוף האדם, ורמתו בתאי הגוף נמצאת תחת בקרה הדוקה. התא זקוק ליוני סידן עבור תהליכים חיוניים רבים, ובהם, בין היתר, גדילת התא, העברת אותות עצביים, התכווצות השרירים, היווצרות העצמות, ותהליך ההפריה. לכן, חיוני שריכוז נמוך אך קבוע של יוני סידן יישמר תמיד בתוך התאים. שינויים בריכוזי הסידן – כך הולך ומתברר – עשויים להוביל להפרעות בתיפקוד התא, ולגרום מחלות שונות. כך, לדוגמה, ריכוז גבוה מדי של יוני סידן בתאי העצב גורם למותם, דבר שעשוי לגרום למחלות עצבים ניווניות. בנוסף, מדענים סבורים כי חוסר איזון ברמות הסידן קשור לסוגים שונים של סרטן ולמחלות לב וכלי דם. פרופ' איתן ראובני, מהמחלקה לכימיה ביולוגית במכון, גילה באחרונה את תפקידו של חלבון חדש, שמעורב בתהליך הבקרה ואיזון רמת הסידן בתא.
 

מימין: ד"ר עדי רוה, רז פלטי, רות מלר, פרופ' איתן ראובני ועידו קמינסקי. ריכוזים

כדי לוודא כי בתא קיימת אספקה מספקת וזמינה של יוני סידן, וכדי למנוע "קפיצות" לא מבוקרות בריכוזו בתא, מאוחסן הסידן במחסנים תאיים – מעין בועיות עטופות בקרום. מחסנים אלה יודעים לחדש את המלאי השמור בהם ברגע שהוא מתחיל להידלדל. אך כיצד יודע התא בדיוק כמה סידן יש להזמין? עד היום הכירו מדענים שתי מולקולות המשתתפות בבקרת תהליך הכניסה של סידן לתא ואגירתו במחסנים. מולקולה אחת, STIM, מבצעת "ספירת מלאי" במחסנים, ומזהה ירידה בכמות הסידן. במקרה כזה היא מדווחת למולקולה השנייה – Orai. מולקולה זו היא למעשה תעלה חלבונית סלקטיבית ליוני סידן, הממוקמת על קרום התא. בעקבות האיתות של מולקולת STIM נפתחת התעלה, יוני סידן זורמים לתוך התא, ונאגרים במחסנים. עם זאת, בתמונה חסר מרכיב מרכזי נוסף: מהו הגורם אשר שולט בסגירת התעלות, וכך מונע מהמחסנים לעלות על גדותיהם, ולשפוך את תכולתם החוצה? פרופ' ראובני, ביחד עם חברי קבוצתו רז פלטי, עדי רווה, עידו קמינסקי ורות מלר, זיהו חלבון חדש שמסייע בבקרת מנגנון אגירת הסידן – גילוי שהתפרסם באחרונה בכתב-העת המדעי Cell. נראה, כי כאשר תעלות ה-Orai נפתחות, החלבון החדש, הקרוי SARAF, מעכב בהדרגה את פעילותו של STIM, וכך גורם לסגירתן של התעלות באופן מבוקר.
 
כשגרמו המדענים להפסקת פעילותו של החלבון המעכב, בשיטות של הנדסה גנטית, הצטברו עודפי סידן בתא, ונגרמו שיבושים בתהליכים שונים בתא. אבחנה נוספת של החוקרים הייתה, שהחלבון המעכב, SARAF, נע ביחד עם STIM אל קרום התא (שם ממוקמות התעלות) – דבר שמספק עדות נוספת לכך שחלבון זה אכן מעורב בעיכוב STIM.
 
תאים המבטאים את החלבון SARAF(צבוע בסמן פלואורסצנטי אדום), ותאים המבטאים STIM1 (צבוע בסמן פלואורסצנטי ירוק). התמונה הימנית, בה נראים שני החלבונים, מראה כי הם מצויים ביחד
על אף שאין כל עדות ישירה לקשר בין מוטציות ב-SARAF לבין מחלות בבני-אדם, מחקרים שנעשו באחרונה זיהו את החלבון SARAF כסמן ביולוגי המעורב במחלות כמו סרטן בלוטת הערמונית, אלצהיימר, וחוסר תיפקוד של שריר הלב – כולן מחלות המאופיינות ברמות לא תקינות של סידן בתאים.
 
פרופ' ראובני: "החלבון SARAF מיוצר בכל תאי הגוף, אך הרמה שלו גבוהה בעיקר בתאי המערכת החיסונית ובתאי המוח. אנחנו עדיין לא יודעים בדיוק מה הוא עושה שם וכיצד הוא פועל, ואלה המשימות שלנו להמשך המחקר".
 
 
חלבון SARAF צבוע בסמן בחלבון פלואורסצנטי ירוק. הצבע מתחזק ככל שהחלבון מתקרב לקרום התא
מימין: ד"ר עדי רוה, רז פלטי, רות מלר, פרופ' איתן ראובני ועידו קמינסקי. ריכוזים
מדעי החיים
עברית

מפגשים

עברית
כשמשוטטים בכיכר ריקה כמעט מאנשים דרוש פרק זמן קצר ביותר כדי להגיע לאדם שעומד בצדה השני של הכיכר. לעומת זאת, כאשר הכיכר עמוסה בהמוני אנשים, כמה זמן נוסף יידרש כדי להגיע לאדם מסוים?
 
שאלה דומה לזאת מציגים ביוכימאים שחוקרים חלבונים. הם מסוגלים לצפות בקלות בשני חלבונים במבחנה, ולמדוד כמה זמן נדרש להם כדי להיפגש וליצור קשר בתוך התמיסה. מקרה זה דומה לכיכר הריקה מאדם, אבל בפועל, החלל הפנימי של התא הוא צפוף מאוד: כדי שייפגשו ויקיימו אינטראקציה, על החלבונים למצוא את דרכם בתוך המון צפוף של מולקולות שונות בציטופלסמה של התא. כדי לנסות לגשר על הפער בין המבחנה לבין התא החי, נוהגים מדענים להוסיף חלבונים שונים, או חומרים דמויי חלבון, למבחנות בהן מתבצע הניסוי.
מימין: פרופ' גדעון שרייבר ויעל פיליפ. זמן אמת
עד כמה משפיע החלל הצפוף של התא על הקצב בו מתקיימים יחסי גומלין בין חלבונים? כדי לענות על שאלה זו, פיתחו פרופ' גדעון שרייבר, תלמידת המחקר יעל פיליפ, וד"ר ולדימיר קיש, מהמחלקה לכימיה ביולוגית, שיטה לצפייה ישירה בחלבונים המצויים בתאים חיים. באמצעות השיטה הם הצליחו לראשונה למדוד את קצב האינטראקציה בין חלבונים בתוך תא חי. ממצאיהם התפרסמו באחרונה בכתב-העת של האקדמיה הלאומית למדעים של ארה"ב (PNAS).
 
כדי למדוד את קצב האינטראקציה, הפעילו המדענים תאים בודדים, וגרמו להם לייצר חלבון מסוים. את החלבון השני הם החדירו בעדינות לתוך התא באמצעות מחט מיקרוסקופית, ומיד החלו במדידה. שני החלבונים סומנו באמצעות חומר פלואורסצנטי מיוחד, אשר זוהר בזמן מעבר אנרגיה – וכך מאותת על התחוללות אינטרקציה בין החלבונים.
 
להפתעתם גילו החוקרים, שקצב האינטראקציה בין החלבונים במחקר היה איטי רק במעט מזה של חלבונים המצויים בתמיסה, בתוך מבחנה. גם כשיצרו המדענים מוטציות בחלבונים – אשר גרמו להם לפעול מהר יותר או לאט יותר – עדיין לא נראו הבדלים משמעותיים.
 
פרופ' שרייבר וחברי קבוצתו משערים, שדווקא תסריט "ההמון הצפוף", באופן פרדוקסלי לכאורה, עשוי להסביר מדוע יחסי הגומלין בין חלבונים בציטופלסמה הדחוסה מתרחשים מהר יותר מהצפוי. "בהתחלה הצפיפות אמנם מעכבת את התקדמות החלבונים", אומר פרופ' שרייבר. "אבל כשהם מתקרבים זה לזה, ההמון הסואן דווקא דוחף אותם להיפגש. החלבונים אינם 'מכירים' זה את זה באופן אוטומטי – הם עשויים להתנגש פעמים רבות לפני שתתחולל אינטראקציה כלשהי. הקפיצות והדחיפות בין מולקולות שונות בקהל הדינמי הזה מגדילות את מספר הפגישות האקראיות בין שני החלבונים, דבר שמגדיל את הסיכוי לאינטראקציה ביניהם".
 
הממצאים החדשים רומזים, כי למרות ההבדל בין המבחנה לבין התא החי, תוצאות ניסויים המתבצעים במבחנות תואמות בקירוב את הנעשה בתאים. עם זאת, השיטה החדשה שפותחה במעבדתו של פרופ' שרייבר עשויה לקדם את חקר יחסי הגומלין המולקולריים בין חלבונים בסביבתם הטבעית: תאים חיים.
 
פרופ' שרייבר: "לראשונה הצלחנו למדוד את קצב האינטראקציה בין מולקולות בתוך תא חי בודד. הודות לטכנולוגיית דימות פלואורסצנטית אנחנו מסוגלים לראות את הפעולות בזמן אמת, ולעקוב לא רק אחרי הקצב שלהן, אלא גם אחר שינויי הריכוזים של מולקולות לאורך זמן. גילינו, כי אפשר אפילו להתמקד באזורים ספציפיים בתוך גוף התא. בהמשך אנחנו מתכננים ליישם את השיטה הזו במחקרים ביו-מולקולריים שונים, תוך שיתוף פעולה עם מדענים נוספים – שכבר הביעו בה עניין".
 
 
 
יחסי גומלין בין חלבונים בתא. משמאל למטה: צילום במיקרוסקופ אור של הזרקת החלבון לתא. משמאל למעלה: החלבון המוסר אנרגיה (בירוק). מימין למעלה: כאשר מתקיימת אינטראקציה בין החלבונים, מועברת אנרגיה ל"חלבון המקבל", שגורמת לו לזהור באדום. מימין למעלה: תמונה משולבת של החלבון המוסר והחלבון המקבל
מימין: פרופ' גדעון שרייבר ויעל פיליפ. זמן אמת
מדעי החיים
עברית

רואים את האור

עברית

חלק מתא צמח, המוגדל פי יותר מ-20,000.

לאישה שבתמונה יש רעמת שיער מפוארת, העוטפת חלקית את גופה העירום. זו אינה יצירה אמנות לא מוכרת שהתגלתה באחרונה, אלא חלק מתא צמח, המוגדל פי יותר מ-20,000. התמונה הופקה במסגרת מחקר של פרופ' זיו רייך וחברי קבוצתו, מהמחלקה לכימיה ביולוגית במכון ויצמן למדע, יחד עם פרופ' הלמוט קירצ'נוף מאוניברסיטת ושינגטון, ארה"ב. ה"שיער" הוא למעשה מערכת של בועיות קטנות ושטוחות הקרויות תילקואידים, הנמצאות בכלורופלסט של הצמח. בועיות אלה מכילות את המערכת המבצעת את השלבים העיקריים של הפוטוסינתזה – תהליך בו משתמשים צמחים, אצות, וחיידקים מסוימים באור השמש כדי להפיק אנרגיה כימית, ואגב כך מייצרים גם את רוב החמצן המצוי באטמוספרת כדור-הארץ. במאמר שפירסמו בכתב-העת המדעי "רשומות האקדמיה למדעים של ארה"ב" (PNAS), מדווחים המדענים כי גילו מדוע ה"שיער של האישה" עשיר כל כך: עובי החלל שבתוך התילקואידים, הקרוי לומן, כמעט מוכפל כאשר העלה חשוף לאור.


נב
התרחבות הלומן מסייעת לפוטוסינתזה: היא מגדילה את המרחב בו מתבצע הפעפוע (דיפוזיה) של חלבון האחראי להעברת אלקטרונים – צעד חיוני בפוטוסינתזה. אלקטרונים אלה משמשים להפיכת דו-תחמוצת הפחמן לסוכרים, והעברתם דרושה להיווצרות מולקולת ה-ATP: מולקולת האנרגיה העיקרית של התא. בנוסף, התרחבות הלומן מאפשרת תיקונים בחלבוני הפוטוסינתזה, משום שהיא מסייעת לפירוקם ולשינועם.
 
מימין: ד"ר אייל שמעוני, ד"ר דנה חרובי, פרופ' זיו רייך, ד"ר רינת נבו ואוני צברי. לחץ גבוה
כאשר יורדת החשיכה מתכווץ הלומן, ובכך מגביל את תנועת החלבונים. ההתכווצות נדרשת כנראה כדי למנוע נזק שעשוי להיגרם למערכת הפוטוסינתטית בעת הזריחה, או כאשר עוצמת האור גוברת בפתאומיות – לדוגמה, בעקבות תנועת עננים. כאשר האור מתעצם בבת אחת, הלומן המתרחב בהדרגה דואג לכך שקצב העברת האלקטרונים לא יגבר מהר מדי – דבר שעלול לפגוע בחלבון מרכזי בשרשרת העברת האלקטרונים.
ממצאים אלה מפריכים את הסברה ארוכת השנים, כי הלומן שבתילקואידים מתכווץ באור. מקור הסברה הוא במגבלות שיטות המחקר בתחילת שנות ה-70 של המאה הקודמת. המחקר החדש, לעומת זאת, נעשה באמצעות שיטות מתקדמות: עלי הצמח נחקרו תחת מיקרוסקופ אלקטרונים, לאחר הקפאה מהירה באמצעות חנקן נוזלי, בתנאי לחץ גבוה ביותר. העלה המוקפא נחתך לשכבות דקיקות, שעוביין אינו עולה על כמה עשרות ננומטרים (מיליארדיות המטר).

הממצאים החדשים מספקים מידע חיוני על בקרת הפוטוסינתזה, ועל הדרכים בהם הצמחים מתאימים את עצמם לשינויים בעוצמת האור, המתרחשים במהלך היום.
 
במחקר השתתפו קריס הול, מגנוס ווד וד"ר מירוסלבה הירבסטובה מאוניברסיטת ושינגטון, וכן אוני צברי, ד"ר רינת נבו וד"ר דנה חרובי מהמחלקה לכימיה ביולוגית, וד"ר אייל שמעוני מיחידת המיקרוסקופיה האלקטרונית במכון ויצמן.
 
 
 
חלק מתא צמח, המוגדל פי יותר מ-20,000.
מדעי החיים
עברית

עמודים