<div>
Science Feature Articles</div>

צופן נולד

עברית
 
ד"ר צבי טלוסטי. כמו בסרט
 
את הסיפור הזה אפשר להתחיל, אם רוצים, מתמונת הפתיחה בסרט "טווין פיקס" של דייוויד לינץ'. מסך טלוויזיה שחור-לבן מרצד בלי פשר, מסנוור, מכאיב, מטריד את הצופה. כך, לאחר מספר שניות, הגרזן הניחת על הטלוויזיה ומנתץ אותה לרסיסים, בלוויית זעקת-אימה מהדהדת, מתקבל בהקלה. כל דבר עדיף על הריצוד המחוספס וחסר הפשר. המוח מעדיף תבניות חזותיות בעלות קווי מיתאר ברורים שניתן לפענח ולזהות.
 
המעבר בין מסך מרצד לתמונה חדה עשוי גם להיות תסריט או מודל המתאר את לידתם של צפנים מולקולריים דוגמת הצופן הגנטי. תמונה על מסך הטלוויזיה היא למעשה צופן: היא בנויה כטבלת התאמה בין הקואורדינטות של הפיקסל על המסך, לבין הצבע הקורן מהפיקסל. גם הצופן הגנטי הוא טבלת התאמה בין שלשות של בסיסי די-אן-איי (קודונים) לבין 20 החומצות האמיניות, אבני-הבסיס של החלבונים. במילים אחרות, הצופן הגנטי הוא מעין טבלת תרגום בין שתי שפות מולקולריות: שפת הדי-אן-איי ושפת החלבונים. אם נחזור למסך הטלוויזיה המרצד, נראה מיד שהדבר המטריד אותנו הוא היעדרו של צופן חזותי: טבלת ההתאמה שיוצרת את התמונה המרצדת על המסך היא אקראית לחלוטין ומשתנה ללא הרף. אין מיתאם בין מקום הפיקסל לבין צבעו, כך שלא ניתן להשתמש בטבלה לתרגום בין שפת המיקום לשפת הצבע. צופן נולד בדיוק ברגע שבו מופיע מיתאם כזה, ויחד איתו נולדת האפשרות לתרגם משפה לשפה.
 
"אם כך", אומר ד"ר צבי טלוסטי מהמחלקה לפיסיקה של מערכות מורכבות במכון ויצמן למדע, "אפשר לכתוב תסריט, או מודל מתמטי, שיתארו את הולדת הצופן הגנטי, מתוך תמונה או מצב חסרי-פשר דוגמת המסך המרצד המופיע בסצינה הראשונה של 'טווין פיקס'. בתמונה הראשונה, או במצב ההתחלתי של המודל/התסריט שלנו, אין מיתאם בין קודוני הדי-אן-איי לבין חומצות האמינו. מצב כזה מייצג עולם קדמון שבו חלבונים נוצרים באקראי, ובהרכב אקראי, ללא קשר לצופן הגנטי". מה גורם להופעת הצופן הגנטי (או להופעת תמונה חדה וברורה על מסך הטלוויזיה)? ד"ר טלוסטי אומר, שכדי שמעבר כזה יתחולל, הוא חייב להביא עימו יתרונות ניכרים לאורגניזם, תמורת "מחיר" שאינו גבוה מדי. היתרון בצופן ברור: באמצעותו יוכל האורגניזם לאחסן בגנום שלו תוכניות לייצור חלבונים מתוחכמים, ולהוציא אותן לפועל בזמן ובמקום שבהם הוא זקוק לחלבונים. מחירו של הצופן ברור לא פחות: ההכרח לייצר "מכונות" מולקולריות שיוכלו לתרגם בדיוק הנדרש משפה מולקולרית אחת לשנייה. "עקומת התמורה" הכלכלית בין היתרון למחיר קובעת, שצופן ייוולד בדיוק בנקודת המפגש והאיזון בין יתרון למחיר.
 
ד"ר טלוסטי בחן באופן מתמטי את מאזן הכוחות הזה, וגילה כי הולדתו של צופן (דוגמת תמונה על מסך הטלוויזיה, צופן גנטי או כל צופן מולקולרי אחר) אינה שונה בהרבה ממעבר-מופע בעולם החומר, דוגמת מעבר בין מצבי צבירה (לדוגמא, מעבר של חומר ממצב נוזל לגז). מההקבלה הזאת עולה, כי הצופן הצעיר יהיה "חלק", כלומר, שני קודונים דומים יתורגמו לעיתים לאותה חומצה אמינית או לחומצה אמינית שדומה לה בתכונותיה הכימיות. על מסך הטלוויזיה יתבטא צופן חלק בכך שפיקסלים שכנים יהיו דומים בצבעם. המוח והקודים המולקולריים מעדיפים תמונות כאלה, שנוצרו על-ידי צופן חלק למדי.
 
במערכה האחרונה והמכרעת ב"תסריט" שכתב ד"ר טלוסטי מתברר, שתמונת הצופן המתגלה לעינינו בעת מעבר מופע קשורה לבעיה המתמטית הידועה בשם "בעיית ארבעת הצבעים". כדי לפתור את בעיית הצבעים, צריך למצוא את "מספר הצביעה", מספר הצבעים המזערי שיספיק כדי לצבוע כל מפה גיאוגרפית כך שארצות שכנות יהיו בצבעים שונים. אם המפה משורטטת על כדור, מספר הצביעה הוא ארבע (מכאן שמה של הבעיה). אבל אם המפה משורטטת על טורוס (בייגל), משטח שיש בו חור אחד, צריך לפחות שבעה צבעים. כלומר, מספר הצביעה תלוי במספר החורים במשטח. כדי לשרטט את המפה של הצופן הגנטי צריך משטח שיש בו הרבה יותר חורים, בין 25 ל-41. מספר החורים הוא פועל יוצא מהשפה שבה נכתב הצופן, שלשות של אותיות מתוך אלפבית בן ארבע אותיות (הבסיסים A, T, G, C). מהמודל המתמטי עולה, שמספר חומצות האמינו אשר יופיעו בצופן גנטי חלק מוגבל על-ידי מספר הצביעה. על המשטח מרובה החורים של הצופן הגנטי מספר הצביעה הוא 25-20, כלומר קרוב מאוד למספרן של חומצות האמינו בעולם האמיתי.
 
ה"תסריט" הזה על לידת הצופן הגנטי, והמודל המתמטי הנובע ממנו, אשר מתאר חוקים לתהליכי ההיווצרות או הלידה של צפנים מולקולריים בכלל, תוארו באחרונה במאמרים שפירסם ד"ר טלוסטי בכתבי-העת המדעיים Journal of Theoreical Biology, Physical Review Letters, ו-Electronic .Journal of Linear Algebra
 
צופן נולד
 

 

 
עברית

אבולוציה בסביבה

עברית
מימין: נדב קשטן, פרופ' אורי אלון ואלעד נור. מציאות משתנה
 
 
האם תנועה בקו ישר אל המטרה היא הדרך המהירה ביותר להגיעה אליה? לפי מחקר חדש של מדעני מכון ויצמן, כאשר שם המשחק הוא אבולוציה, קצב ההתקרבות אל המטרה מואץ דווקא כאשר המטרות עצמן משתנות ללא הרף, דבר שמחייב שינויים והתאמות תכופים במסלול ההתקדמות.
 
פרופ' אורי אלון ותלמידי המחקר נדב קשטן ואלעד נור, מהמחלקה לביולוגיה מולקולרית של התא במכון ויצמן למדע, יוצרים הדמיות ממוחשבות שמחקות את האבולוציה הטבעית. בדרך זו הם יכולים לחקור תהליכים אבולוציוניים שמתחוללים בטבע במשך מיליוני שנה. בהדמיות אלה, אוכלוסייה של גנומים (מטענים גנטיים) דיגיטליים מתפתחת בזמן לקראת מטרה מוגדרת: פיתוח כושר הישרדות מרבי בתנאים מסוימים. כמו אורגניזמים חיים, גנומים שמותאמים טוב יותר לסביבתם מעלים את סיכוייהם לשרוד ולעבור לדור הבא, או להיות פוריים יותר. אולם, בהדמיות ממוחשבות אלו, הדרך להשגת המטרות הפשוטות ביותר נמשכת, בדרך כלל, אלפי דורות. כך עולה השאלה, האם שלושה מיליארד שנים (הזמן שעבר מאז התפתחות החיים על-פני כדור-הארץ) מספיקים כדי לפתח את כל המיגוון והמורכבות שקיימים כיום באורגניזמים השונים המתקיימים בעולם.
 
האבולוציה מתחוללת בתנאים סביבתיים משתנים, דבר שמאלץ את האורגניזמים להתאים את עצמם למציאות חדשה פעם אחר פעם. מצב עניינים זה נתפס על-ידי רבים כגורם שאמור להאט את ההתקדמות אל המטרה. אבל כאשר מדעני המכון יצרו הדמיה שבה המטרות עצמן השתנו שוב ושוב, הם מצאו שהאבולוציה דווקא הגבירה את מהירותה. למעשה, התברר להם שככל שהמטרה מורכבת יותר, השינויים שמתחוללים בה גורמים להאצה רבה יותר של האבולוציה לקראתה. שינויים במטרות שהראו האצה באופן עקבי היו דומים לדפוס השינויים בסביבה האבולוציונית שהמדענים סבורים כי הוא נפוץ בטבע.
 
במחקר קודם הראו קשטן ופרופ' אלון, שהאבולוציה היא, לעיתים קרובות, מודולרית: היא מתקדמת בתיקונים קטנים המתבצעים על יחידות, או מקטעים קיימים, ואינה נוטה לבצע "שיפוצים" גדולים. ממצא זה הוביל אותם להשערה, שגם הכוחות אשר פועלים על האבולוציה הם מודולריים. כדי לבחון זאת, הם הגדירו לכל מטרה, מטרות משנה, שהיו מסוגלות להשתנות ביחס לאחרות. "באורגניזם, למשל, אפשר להגדיר את מטרות המשנה האלה כצורך לאכול, הצורך להימנע מלהיטרף, והצורך להתרבות. כדי לשרוד, חייב כל אורגניזם ליישם ולהשיג את מטרות המשנה האלו בכל סביבה חדשה. אבל אורגניזמים שונים עושים את אותו הדבר בדרכם שלהם, בהבדלי סגנון, עיתוי ושילוב, בהשוואה לאורגניזמים אחרים", אומר תלמיד המחקר נדב קשטן. "במעקב אחר המסלולים האבולוציוניים הדומים והשונים האלה גילינו, להפתעתנו, שההתקדמות המהירה ביותר הושגה דווקא כאשר המטרות החדשות השתנו שינויים מודולריים בהשוואה למטרות הקודמות".
 
ממצאים אלה, שפורסמו באחרונה בכתב העת המדעי "רשומות האקדמיה האמריקאית למדעים" (PNAS), עשויים להוביל לפיתוח יישומים בתחומי ההנדסה שבהם משתמשים בכלים אבולוציוניים לתכנון מערכות. בתחום המחקר במדעי המחשב הם עשויים לאפשר האצה של אלגוריתמי אופטימיזציה.
 
ימין: הציור "הגיאוגרף" של הצייר ההולנדי בן המאה ה-17, יוהנס ורמיר (שנודע באחרונה בזכות ציור אחר שלו: "נערה עם עגיל פנינה"). על-פי סברה רווחת, דמות ה"גיאוגרף" צוירה על-פי דמותו של אנטוני ואן לוונהוק, מדען הולנדי בן תקופתו של ורמיר, שנודע כמי שגילה את קיומם של חיידקים (אותם כינה "חיות קטנות השוחות בטיפת מים").  משמאל: ציור (אקריל על בד) של הציירת והמורה לפיסיקה, פנינה אלון, אמו של פרופ' אורי אלון, שבו מופיע פרופ' אלון - החוקר רשתות גנים בחיידקים - במקומו של לוונהוק שכנראה שימש מודל ל"הגיאוגרף". לשמאלו מונח ספרו של פרופ' אלון "מבוא לביולוגיה של מערכות" (ראו גיליון "המכון" מספר 47, יוני 2007).
 
עברית

בקרה, צורה ומטרה

עברית
מימין: ד"ר ערן סגל ומיכאל קרטס. ההתאמה מרחבית
 
 
המטען הגנטי של האדם מכיל כ-20,000 עד 30,000 גנים, שעל-פי המידע המקודד בהם מיוצרים חלבונים שונים. תהליך זה, הקרוי "התבטאות גנים", מבוקר על-ידי מנגנונים מורכבים ומסועפים, הקובעים אילו מהגנים יתבטאו, באיזה תא, מתי, ובאיזו מידה. החלבונים שנוצרים בסופו של תהליך זה קובעים כיצד התא החי יתפקד, דבר שמשפיע על האורגניזם כולו. כך, למשל, התבטאות גנים היא מרכיב מרכזי בהתפתחות עוברית. באורגניזם הבוגר היא משפיעה על תהליכים כמו יצירת כלי-דם, חילוף חומרים, וגם על התחוללות מחלות שונות, לרבות סרטן.
 
מולקולות מיקרו-אר-אן-איי (microRNA) הן אחד מגורמי הבקרה המשפיעים על תהליך ייצור החלבונים בגוף בשלב מאוחר יחסית: השלב שבו מולקולת אר-אן איי-שליח (שנוצרה על-פי המידע הצפון בגן שגורמי בקרה אחרים כבר "עוררו"), עושה את דרכה לעבר הריבוזומים, בתי החרושת לחלבונים של התא. מולקולת המיקרו-אר-אן-איי נצמדת לאתר מטרה מסוים על מולקולת האר-אן-איי-שליח, ובכך היא מונעת את ייצור החלבון שהיא מקודדת. עד היום זוהו מאות סוגים שונים של מולקולות מיקרו-אר-אן-איי, כאשר לכל מיקרו-אר-אן-איי יש קבוצה שונה של גני מטרה. כדי להבין את התהליך הזה יש למצוא את אתרי המטרה, על גבי האר-אן איי-שליח, שאליהם נקשרות מולקולות המיקרו-אר-אן-איי. זיהוי אתרי המטרה האלה עשוי לסייע גם בהבנת השיבושים הגורמים להתבטאות בלתי-מבוקרת של גנים, תהליך שגורם מחלות מסוימות.
 
כדי למצוא את אתרי המטרה, מתמקדים מדענים רבים בזיהוי התאמות כימיות בין הרצף של מקטעים שונים בשתי המולקולות (בדומה להתאמה הקיימת בין שני הסלילים של מולקולת הדי-אן-איי). אלא שלמעשה, במקרים רבים, לא קיימת התאמה מושלמת בין רצף בסיסי המיקרו-אר-אן-איי לרצף הבסיסים שבאתר המטרה. מדענים שביקשו להבין את התופעה הזאת פיתחו שיטות לחיזוי אתרי המטרה, אשר מחפשות התאמה חלקית בין רצף בסיסי המיקרו-אר-אן-איי לרצף הבסיסים שבאתר המטרה. אולם הדרישה להתאמה חלקית מובילה לחיזוי אתרי מטרה רבים שהוכח בצורה ניסויית כי הם אינם נכונים. בניסיון לשפר את יכולת החיזוי, הסתבכו השיטות והלכו, אולם בסופו של דבר לא הצליחו לחזות באופן מלא ומדויק לאילו אתרים על האר-אן-איי-שליח ייקשרו מולקולות מסוימות של מיקרו אר-אן-איי.
 
ד"ר ערן סגל ותלמיד המחקר מיכאל קרטס, מהמחלקה למדעי המחשב ומתמטיקה שימושית במכון ויצמן למדע, בחרו לחקור את התהליך מכיוון אחר: במקום לבחון את הרצף הכימי של המולקולות, הם התמקדו במבנה המרחבי, התלת-ממדי, של מולקולת האר-אן-איי-שליח. יחד עם קבוצת חוקרים מאוניברסיטת רוקפלר בניו-יורק הם בדקו האם קיפולים באר-אן-איי-שליח משפיעים על קישור מולקולות מיקרו-אר-אן-איי לאתרי המטרה שלהן.
 
המדענים יצרו מוטציות שגרמו לאר- אן-איי-שליח להתקפל ולסגור את אתרי המטרה, או, להיפך, להיפתח ולחשוף אותם. לאחר מכן הישוו את רמת הביטוי של הגן המקורי לזו של הגן עם המוטציות. "על-פי התיאוריות הקיימות, שינויים אלה אינם אמורים להשפיע על ביטוי הגן, שכן המוטציות לא בוצעו בבסיסים המעורבים במגע הישיר בין המולקולות, אלא בבסיסים הסמוכים אליהם", אומר ד"ר סגל. תוצאות הניסויים הראו באופן חד-משמעי, כי המבנה המרחבי של אתר המטרה במולקולת האר-אן-איי-שליח אכן משפיע על רמת ביטוי הגן. כאשר אתר המטרה נמצא באיזור פתוח ונוח לגישה של מולקולות המיקרו-אר-אן-איי, יותר מולקולות מיקרו אר-אן-איי נצמדות לאר- אן-איי-שליח, דבר שגורם לבלימה חזקה של ייצור החלבון שהמידע לבנייתו נישא על-ידי האר-אן-איי-שליח. לעומת זאת, כאשר אתר המטרה נסגר, יש פחות היצמדויות בין המולקולות - וביטוי הגן גדל במידה דרמטית.
 
המדענים פיתחו נוסחה המסבירה את יחסי הגומלין בין מולקולות מיקרו-אר-אן-איי לאתרי המטרה שלהם, והמאפשרת לזהות אתרי מטרה חדשים. הנוסחה מורכבת מההפרש בין האנרגיה שיש להשקיע כדי לפתוח את אתר המטרה (במקרה של מבנה סגור יהיה צורך בהשקעה גבוהה, במקרה של מבנה פתוח תהיה ההשקעה זניחה), לבין האנרגיה הנפלטת כאשר המיקרו-אר-אן-איי נקשר לאתר המטרה (במקרה של התאמה גבוהה ברצף הבסיסים תשתחרר כמות גדולה של אנרגיה, ובמקרה של התאמה חלקית תשתחרר כמות קטנה יותר). ככל שהערך המתקבל גבוה יותר, כך עולה הסיכוי שמדובר באתר מטרה פוטנציאלי למיקרו-אר-אן-איי.
 
תגלית נוספת שעולה מהמחקר היא, שקישור מולקולת מיקרו-אר-אן-איי לאר-אן-איי-שליח אינה תלויה רק במבנה פתוח של רצף המטרה עצמו, אלא גם בזה של הרצפים הסמוכים לאתר המטרה. הסיבה לכך היא, שמולקולת המיקרו-אר-אן-איי נתונה בתוך מבנה חלבוני גדול, ויש לאפשר למבנה כולו גישה נוחה לאתר המטרה. בעקבות הגילוי הזה ערכו החוקרים התאמה של הנוסחה, כך שרכיב "השקעת האנרגיה" כולל את האנרגיה שיש להשקיע כדי לפתוח את אתר המטרה באופן שיתאים לכניסה של המבנה החלבוני כולו. התאמה זו שיפרה את הדיוק ואת יכולת החיזוי של המודל. בהמשך יצרו החוקרים ארבעה קטלוגים המגדירים אתרי מטרה פוטנציאליים של מיקרו-אר-אן-איי על-פני גנומים של אדם, עכבר, זבוב ותולעת. בדיקה של כל היצורים הראתה, כי אתרי המטרה נמצאים באתרים חשופים, לא מקופלים, מה שמעיד כי המבנה המרחבי של האר-אן-איי-שליח, הקובע את אתרי הקישור למיקרו-אר-אן-איי, מילא תפקיד חשוב לאורך האבולוציה. תוצאות המחקר, שפורסמו באחרונה בכתב העת Nature Genetics, מספקות למדענים כלי שימושי, המאפשר להם לסרוק רצפים גנטיים, ולזהות אתרי מטרה אפשריים של מיקרו אר-אן-איי, הן על סמך הרצף והן על סמך המבנה המרחבי.
 
על-אף שמדובר במודל פשוט ואמין, ובשיפור ניכר של האמצעים שהיו בידי חוקרים עד כה, המדענים מציינים כי החישובים אינם מדויקים במאה אחוז, גם משום שקשה לחשב במדויק את המחיר האנרגטי של פתיחת אתר המטרה, אך בעיקר משום שהתא אינו סביבה סטרילית, וקיימים בתוכו שלל גורמים המשפיעים גם הם על הקשירה של המיקרו-אר-אן-איי לאתר המטרה. תלמיד המחקר מיכאל קרטס: "היופי שבמחקר הזה הוא, שעל-אף כל הרכיבים והגורמים הנמצאים בתא, שאותם לא הבאנו בחשבון, עדיין המודל הפשוט שלנו, המבוסס אך ורק על יחסי הגומלין בין המיקרו-אר-אן-איי לבין אתר המטרה, ועל המבנה השניוני של אתר המטרה, מסביר את התוצאות הניסיוניות בצורה טובה למדי".
 
עברית

פנויים להובלה

עברית
פרופ' מיכאל אלבאום. דיוור ישיר
 
 
פסי הייצור בבית החרושת התאי עובדים ביעילות וללא הפסקה, כדי לספק לתא את החלבונים הדרושים לקיומו. המפעל מחולק לאגפים בעלי תפקיד מוגדר: השלב הראשון של התהליך מתבצע בגרעין התא - מולקולת אר-אן-איי שליח מיוצרת על פי החומר הגנטי שבדי-אן-איי. השלב השני מתרחש בציטופלסמה, שם מיוצרים החלבונים על פי המידע המקודד במולקולת האר-אן-איי. התהליך מחייב העברה של "חומרי גלם" מאגף לאגף: מולקולות אר-אן-איי שליח קשורות לחלבונים יוצאות מהגרעין אל הציטופלסמה, וחלבונים אחרים הדרושים בגרעין התא נכנסים אליו ממקום ייצורם בציטופלסמה.
 
המעבר בין האגפים נעשה בצורה מבוקרת ומסודרת: כל חלבון נושא עליו מעין "תג זיהוי" המסמן את שייכותו לאחד משני מדורי התא. חלבונים-מובילים מיוחדים "קוראים" את תגי הזיהוי, ומעבירים את החלבונים למקום הרצוי, דרך נקבים בקרום העוטף את גרעין התא. "ניתן להשוות את הפעילות הזו למתרחש בחברת משלוחים", מסביר פרופ' מיכאל אלבאום, מהמחלקה לחומרים ולפני שטח שבפקולטה לכימיה. "השליחים, שהם החלבונים-המובילים, קוראים את הכתובת שעל החבילה, ומובילים אותה ליעד המתאים. הדעה המקובלת היא, ששירות המשלוחים הוא אמין ומסודר - רק השליח יכול להעביר את החבילות, ומרגע שחבילה מגיעה ליעד, היא נשארת בו, והשליח מתפנה להעביר את החבילה הבאה". עקרונות "שירות המשלוחים התאי" הם עקרונות מבוססים ומקובלים, אולם קיימות עדיין שאלות ובעיות הנוגעות ל"מנוע" המספק את האנרגיה הדרושה להפעלתו. מחקר שביצעו פרופ' מיכאל אלבאום ותלמיד המחקר רונן קופיטו, במטרה להבין את העקרונות האנרגטיים האלה, העלה ממצאים מפתיעים. מתברר, שבשירות המשלוחים התאי, ממש כמו בחברות משלוחים אנושיות, חבילות אשר הגיעו ליעדן עשויות לחזור לשולח, וכי תהליכי ההובלה הם דו-כיווניים ודינמיים יותר ממה שמקובל היה להניח.
 
מטרת המחקר הייתה לנסות לפתור את אחד הפרדוקסים העיקריים הקשורים במערכת ההובלה התאית. אספקת האנרגיה לתהליכים אלו מתבצעת באופן בלתי-ישיר: לאחר שהוביל את החבילה לגרעין, השליח חוזר אל הציטופלסמה, כשהוא נושא חומר עתיר-אנרגיה קשור לחלבון. החומר מתפרק בציטופלסמה תוך שחרור אנרגיה, ותוצרי הפירוק מועברים, על-ידי שליח נוסף, בחזרה לתוך הגרעין. בינתיים אוסף השליח חבילה נוספת ומוביל אותה לגרעין, וחוזר חלילה. הבעיה היא, שעל פי חוקי התרמודינמיקה, שימוש עקיף שכזה באנרגיה אפשרי רק לצורך הנעת תהליכים הפיכים, ואילו תהליך ההובלה נחשב, כאמור, לבלתי-הפיך - החלבונים מוסעים לגרעין ומצטברים בו. הדרך חזרה בלתי-אפשרית.
 
כדי לנסות לפתור את הפרדוקס השתמשו החוקרים במערכת ביולוגית המאפשרת למדוד במדויק את קצב תנועת החלבונים מהציטופלסמה לגרעין התא. המערכת מורכבת מגרעיני תאים המוקפים ב"אמבט" של נוזל ציטופלסמי, ובתוכו מצויים החלבונים-השליחים. אל האמבט מכניסים ריכוזים שונים של חלבונים מסומנים בחומר פלואורסנטי, הנושאים כתובת ששולחת אותם לגרעין, ועוקבים אחר הצטברות החומר הפלואורסנטי בגרעיני התאים.
 
תוצאות המדידות היו מפתיעות. בניגוד לסברה המקובלת, הגורסת כי החלבונים מצטברים בגרעין עד להיעלמותם המוחלטת מהציטופלסמה, החוקרים גילו כי ריכוז החלבון בגרעין מתייצב על רמה מסוימת, ואינו ממשיך לעלות, וכי הריכוז הסופי של החלבון בגרעין תלוי בריכוזו ההתחלתי בציטופלסמה. הפתעה נוספת ציפתה לחוקרים כשהמשיכו לעקוב אחר החלבונים לאחר ההגעה לשיווי משקל. מתברר, כי תנועת החלבונים דרך קרום הגרעין נמשכת: כמות החלבונים היוצאת זהה לזו הנכנסת, כך שריכוזם בגרעין נשאר קבוע. ממצאים אלה פורסמו באחרונה בכתב העת "רשומות האקדמיה הלאומית למדעים של ארה"ב" (PNAS).
 
פרופ' אלבאום: "גילינו כי מנגנון ההובלה התאי הוא מנגנון דינמי, וכי תנועת החלבונים נעשית בשני הכיוונים, אל הגרעין והחוצה. כך, כאשר נוצר עומס חלבונים בגרעין, ניתן 'להחזיר את החבילה לשולח', למרות שהיא נושאת את הכתובת המייעדת אותה לגרעין. בזכות הכתובת, רוב החבילות אכן מצטברות ביעד המתאים. אך הכתובת מתפקדת כגורם מנתב, המפנה את רוב החבילות למיקום מסוים, ולא כגורם הקובע את מיקומה של כל חבילה בודדת". המחקר מספק לביולוגים תובנות חדשות ביחס לאחת המערכות התאיות החשובות, הפועלות בכל מיגוון היצורים החיים, וגם מציע הסבר לתופעות ביולוגיות, ולדרכי התקשורת בין הציטופלסמה לבין הגרעין. פרופ' אלבאום מקווה, כי למחקר יהיו גם השלכות מעשיות - בימים אלו הוא מנסה לבנות מערכת מלאכותית למיון וריכוז חומרים, שתפעל על-פי העקרונות הפיסיקליים של חברת המשלוחים התאית.
 
עברית

פעולה ותגובה

עברית
 
פרופ' צבי לפידות וד"ר אסף שפיגל. קריאה לעזרה
 
 
 
עסקות מורכבות בעולם העסקים נסגרות בסיועם של מתווכים מתוחכמים שיודעים לסגל לעצמם דרכי פעולה שונות המתאימות לסביבות שונות. נראה, שתכונה זו מאפשרת לכמה מתווכים עצביים, שעד כה היה ידוע כי הם תורמים להעברת מסרים במערכת העצבים, לפעול ולהעביר מסרים גם אל המערכת החיסונית בכלל, ולתאי גזע בפרט.
 
כשהגוף נכנס למצב עקה, כתוצאה מפגיעה, מחלה, או פעילות גופנית מאומצת, מופעלת בו מערכת אזעקה אוטומטית ומהירה. פעמוני האזעקה מעוררים מערכות שונות בגוף, במטרה להתמודד עם המצב: קצב הלב והנשימה מתגברים, כלי הדם המובילים חמצן לשרירים מתרחבים, ועוד. קריאת הגיוס כוללת גם את מערכת הדם - הגוף דורש כמות מוגברת של כדוריות-דם אדומות לשיפור אספקת החמצן, וגם תוספת של תאי-דם לבנים, רכיבי מערכת החיסון, לשם חיזוק ההגנה מפני גורמי זיהום חיצוניים ושיקום רקמות פגועות. לצורך כך ניתנת פקודה לתאי הגזע של מערכת הדם, מהם נוצרים כלל תאי הדם, להתחלק, להתמיין, ולנדוד מלשד העצם אל כלי הדם - שם הם נדרשים. קבוצתו של פרופ' צבי לפידות, המתעניינת במנגנונים המווסתים את תהליכי השגשוג והנדידה של תאי הדם, גילתה באחרונה שחקן מרכזי ובלתי-צפוי המתווך בין פעמוני האזעקה של מערכת העצבים המרכזית, לבין תגובת תאי הגזע של מערכת הדם. המחקר, שפורסם בכתב העת Nature Immunology, מראה כי המוליכים העצביים (נוירו-טרנסמיטורים) האופייניים למצבי עקה, דופמין, אפינפרין (המוכר גם בשם אדרנלין) ונוירואפינפרין, המופרשים מתאי-עצב, משפיעים באופן ישיר על תאי הגזע של מערכת הדם, מזרזים את חלוקתם והתפתחותם, וגורמים לנדידתם מלשד העצם לזרם הדם.
 
כיצד מתאפשרת ההשפעה הישירה הזו? לשד העצם, בו נמצאים תאי הגזע של מערכת הדם, מרושת על-ידי שלוחות תאי עצב, בהם נוצרים הנוירו-טרנסמיטורים, ומהם הם מופרשים אל הסביבה החיצונית. צוות המדענים, שכלל את ד"ר אסף שפיגל, ד"ר שהם שבטיאל, ד"ר אלכסנדר קלינקוביץ וחברים נוספים מקבוצת המחקר של פרופ' לפידות במחלקה לאימונולוגיה, בשיתוף עם פרופ' מנחם רובינשטיין מהמחלקה לגנטיקה מולקולרית במכון ויצמן למדע, גילה כי תאי הגזע של מערכת הדם מכילים קולטנים לנוירו-טרנסמיטורים, וזיהה את המסלול התוך-תאי של העברת האותות המאפשר את תגובת תא הגזע לפקודות המועברות על-ידי המוליכים העצביים. בנוסף לכך גילו החוקרים, כי גורמי-גדילה מסוימים המשפיעים על תאי הגזע של מערכת הדם, ומופרשים בכמות מוגברת במצבי עקה, גורמים לעלייה ברמת הקולטנים לנוירו-טרנסמיטורים על-פני תאי הגזע. גורמים מתווכים אלו מאפשרים תגובה חזקה ומהירה של תאי הגזע, בדיוק כאשר היא נחוצה.
 
בשורה של ניסויים הראו המדענים, כי מתן דופמין, אפינפרין או נוירואפינפרין גורם לחלוקה ולהתפתחות מוגברת של תאי הגזע של מערכת הדם, ומעודד נדידה שלהם מלשד העצם. כתוצאה מכך, כמות כדוריות הדם הלבנות בכלי הדם עולה. ממצאי ניסויים אלו, שבוצעו בתאי דם שמקורם בבני-אדם, ובשיתוף עם מחלקות להשתלת לשד עצם במספר בתי-חולים בארץ, עשויים לסייע בפיתוח שיטות חדשות ויעילות יותר להשתלת לשד עצם. "קיימים כיום טיפולים שונים שמטרתם לגרום לנדידה של תאי גזע מלשד העצם לכלי הדם, למטרות ריפוי או השתלה, אך לא כל המטופלים מגיבים באופן חיובי לטיפול", אומר פרופ' לפידות. "הבנה מלאה של המנגנונים המווסתים את הנדידה עשויה לסייע בשיפור השיטות להשתלת לשד עצם".
 
עברית

כוחות משיכה

עברית
 
פרופ' סאם שפרן. משיכת חבל
 
 
 
מה שלא הולך בכוח, הולך (רק לפעמים) ביותר כוח. גרסה מסוימת של הקביעה החברתית-פוליטית-מכנית הזאת מתקיימת גם במערכות ביולוגיות. היבטים מכניים של מערכות ביולוגיות מעסיקים את פרופ' שמואל (סאם) שפרן, מהמחלקה לחומרים ופני שטח שבפקולטה לכימיה, במכון ויצמן למדע. בניגוד לחומרים הכימיים, שהם גופים "מתים", החומרים הביולוגיים הם למעשה יצורים חיים ודינמיים, המסוגלים להגיב לכוחות מכניים המופעלים עליהם מהסביבה החיצונית. הכרת הפתרונות המכניים שהתפתחו במערכות ביולוגיות במשך מיליוני שנות אבולוציה, עשויה לסייע בפיתוח טכנולוגיות רפואיות מתקדמות. פרופ' שפרן וחברי קבוצת המחקר שהוא עומד בראשה בוחנים, בין היתר, את מנגנוני ההיצמדות בין תאים למשטחים, או בין תאים למרקם הבין-תאי בגוף. יחסי הגומלין בין התאים למרקם הבין-תאי מזכירים לעיתים תחרות במשיכת חבל. כאשר המרקם הבין-תאי "מושך את החבל", הוא מותח למעשה סיבים המחוברים לשני צידי התא. בשלב הראשון של תגובתו, התא אומד את מידת המתיחה הנוצרת.אומדן זה מבוסס על כוחות המשיכה המופעלים על ה"דבק התאי" המחבר את התא לסביבתו. לאחר מכן, התא מפעיל את מנגנוני ההתכווצות שלו במידה מתאימה, "מושך את החבל לצדו", ומפעיל כוח נגדי על המרקם הבין-תאי. בסופו של דבר מגיעים שני הכוחות הנגדיים לאיזון.
 
עם זאת, היבטים מסוימים הנוגעים לתגובת התא לכוחות המופעלים עליו נותרו חסרי הסבר. כך, למשל, המדענים הופתעו לגלות כי כאשר המרקם הבין-תאי נמתח באיטיות, התאים מתארגנים במבנה מקביל לכיוון המתיחה, אך כאשר המתיחה נעשית במהירות, התאים מסתדרים במאונך לכיוון המתיחה. "הבנת התגובה התאית לכוחות חיצוניים חשובה בתחום הביולוגיה, כאמצעי להבין כיצד מתרפאים פצעים, כיצד גדלים השרירים או כיצד מתפתח גידול סרטני. בנוסף לכך, היא עשויה לסייע בפיתוח רקמות מלאכותיות", אומר פרופ' שפרן. "מחקרים אחרונים מראים, כי התמיינות תאי גזע, כמו תיפקודים תאיים אחרים, תלויה, במידת מה, בגמישות של המרקם הבין-תאי. אם לא נצליח להבין ולחזות בצורה כמותית את תגובת התאים, לא נוכל לשלוט בתכונותיהן של רקמות מהונדסות ולתכנן חומרים שיתאימו לצרכינו".
 
פרופ' שפרן וחברי קבוצת המחקר שלו, החוקרים הבתר-דוקטוריאלים ד"ר רומי דה וד"ר אסף זמל, הציעו באחרונה מודל תיאורטי פשוט אשר מסביר את ההבדלים בארגון התאים, ומאפשר לחזות את תגובתם לכוחות המופעלים עליהם על-ידי הסביבה. מחקר זה פורסם באחרונה בכתב-העת המדעי Nature Physics. שיתוף פעולה של החוקרים ממכון ויצמן עם ד"ר ראלף קמקמר, ממעבדתו של פרופ' יואכים ספאץ במכון מקס פלנק בשטוטגארט, גרמניה, הניב שורת ממצאים ניסויים העולים בקנה אחד עם החיזוי התיאורטי.
 
על-פי המודל שפיתחו, כאשר המרקם הבין-תאי נמתח באיטיות, לתאים ניתן מספיק זמן כדי לסדר את עצמם במקביל אליו, ולווסת את מנגנון ההתכווצות שלהם. כתוצאה מכך, הם מגיעים מוכנים ל"תחרות משיכת החבל", ומצליחים לאזן את כוחות המשיכה. לעומת זאת, כאשר המרקם הבין-תאי נמתח במהירות, אין לתאים די זמן להתארגן. הם "מוותרים מראש" על תחרות המשיכות, ומתארגנים במהירות בניצב לכיוון המתיחה, משום שבכיוון זה הוא אינו מסוגל להפעיל עליהם כוח. בצורה זו מופחת הלחץ המופעל בין שני הצדדים, והם עדיין מגיעים לאיזון, אם כי באופן שונה.
 
"המודל שלנו מביא בחשבון את התלות הקיימת בין כיוון ההתארגנות של התאים לבין גורם הזמן. בעתיד, אנו מקווים לפתח דרך לחשב ולחזות במדויק את הזווית שבה התאים יסתדרו, בהתאם למהירות בה מתרחשת המתיחה. מידע זה יאפשר למדעני החומרים העוסקים בהנדסת רקמות לקבוע במדויק את סידור התאים ברקמה, וכך לשלוט בתכונותיה", אומר פרופ' שפרן.
 
עברית

בלימת חירום

עברית
 
פרופ' עידית שחר. יישומים באופק

 

 

 
 
סרטן דם מהסוג הקרוי לוקמיהלימפוציטית כרונית מתאפיין בהצטברות סוג מסוים של תאי דם לבנים, הקרויים לימפוציטים מסוג B, בדם, בלשד העצם ובבלוטות לימפה. באופן נורמלי, משך חייהם של תאי הדם מוגבל באמצעות מנגנון פנימי הגורם להרג עצמי. בתאים הסרטניים, מנגנון ההשמדה הזה אינו מתפקד כראוי, ולכן התאים שורדים, מתרבים ומצטברים. קבוצת מדענים, בראשות פרופ' עידית שחר מהמחלקה לאימונולוגיה במכון ויצמן למדע, בשיתוף ד"ר מיכל הרן וצוות המכון ההמטולוגי במרכז הרפואי קפלן, גילתה באחרונה מנגנון הישרדות חשוב של התאים הסרטניים האלה. באמצעות פגיעה מכוונת וממוקדת במנגנון ההישרדות הצליחו המדענים לגרום לתמותה מוגברת שלהם. התגלית, שפורסמה באחרונה בכתב העת המדעי "רשומות האקדמיה הלאומית למדעים של ארצות הברית" (PNAS), עשויה להוות בסיס לפיתוח דרכי טיפול מתקדמות במחלה זו, וייתכן שגם במחלות אחרות בהן קיימת הצטברות של תאי דם לבנים מסוג B.
 
מחקרים קודמים של פרופ' שחר הראו כי קולטן מסוים, המצוי על פניהם של תאי B תקינים, ממלא תפקיד חשוב בהישרדותם של תאים אלה. לאור זאת הועלתה האפשרות, שקולטן זה מעורב גם בהישרדותם החריגה של תאים ממאירים מאותו סוג.
 
חברי קבוצת המחקר של פרופ' שחר, ובהם תלמידות המחקר ענבל בינסקי, דיאנה סטרלטס ויעל גור, וטכנאית המעבדה פרידה לנטנר, יחד עם צוות רופאים מהמכון ההמטולוגי במרכז הרפואי קפלן ברחובות, שכלל את ד"ר הרן, ד"ר לב שוידל, פרופ' אלן ברבי ונורית הרפז, מדענים מאוניברסיטת ייל וד"ר דייוויד מ. גולדנברג מהמחלקה לאימונולוגיה ולרפואה מולקולרית במרכז לחקר הסרטן בניו-ג'רסי, בדקו תאי דם סרטניים שנלקחו מחולים בלוקמיה לימפוציטית כרונית, וגילו כי בתאים אלו מצויות רמות גבוהות הן של הקולטן, והן של החלבון הנקשר אליו, החל משלבי המחלה המוקדמים. בהמשך התברר כי הפעלת הקולטן מובילה לרצף אירועים תוך-תאי, אשר מגביר את יכולת ההישרדות של התאים הסרטניים. אחד השלבים החשובים בתהליך הוא הגברה משמעותית בייצור חומר שמווסת את משך חייהם של תאי הדם. חומר זה גורם לייצור חלבון אשר מונע את הפעלת התוכנית להשמדה עצמית. כאשר טופלו התאים הסרטניים בנוגדנים הנקשרים לקולטן באופן בררני, ובולמים את הפעלתו, חלה עלייה משמעותית בתמותה של התאים הסרטניים. נוגדנים אלה, המיוצרים על ידי חברת Immunomedics בניו-ג'רסי, מצויים בימים אלו בשלב הראשון של ניסויים קליניים לטיפול בסוגי סרטן שונים. ממצאי המחקר מספקים הסבר למנגנון פעולתם של הנוגדנים, ובעקבותיו מתוכנן מחקר קליני שיבדוק את יעילותם בקרב חולים הסובלים מלוקמיה לימפוציטית כרונית.
 
פרופ' שחר: "אנו סבורים שהכמויות החריגות של הקולטן ממלאות תפקיד חשוב בהתפתחות המחלה, החל משלביה המוקדמים, וכי הן אחראיות ליכולת ההישרדות המוגברת של תאים סרטניים מסוג B. חסימה של הקולטן, או של שלבים אחרים במסלול ההישרדות שהוא מפעיל, עשויה לשמש בעתיד אמצעי יעיל למלחמה בסוגי סרטן נוספים, שמקורם בתאי דם מסוג B".
 
עברית

ננס לבן מכה ענק אדום

עברית
ד"ר אבישי גל-ים. פיצוץ
 
 
כאשר כוכב מסוג ננס לבן מגיע לסוף דרכו ומתפוצץ, הוא משאיר אחריו ענן של "אבק כוכבים" שמתפשט במהירות. תופעה זו ידועה כ"סופרנובה מסוג Ia". אלה הן סופרנובות בוהקות ביותר, והדמיון ביניהן רב, ולכן הן מעוררות עניין בקרב מדענים, המשתמשים בהן כב"נקודות ייחוס" קוסמולוגיות, המאפשרות לעקוב אחר התפשטות היקום.
 
על-אף ההתקדמות המשמעותית שהושגה באחרונה במחקר הסופרנובות מסוג Ia, הרי שטבעם המדויק של הכוכבים המתפוצצים האלה, והחוקים הפיסיקליים השולטים בהתפרצויותיהם האלימות, מובנים באופן חלקי בלבד. באחרונה הושגה התקדמות משמעותית בהבנת התופעה, כאשר אסטרונומים הצליחו, זו הפעם הראשונה, לאסוף נתונים מפורטים באמצעות מערך ייחודי של תצפיות שהתבצעו בפרק זמן קצר יחסית (ארבעה חודשים) לאחר התפוצצות הסופרנובה. נתונים אלה איפשרו זיהוי של החומר המקיף את הננסים הלבנים לפני ההתפוצצות. התצפיות בוצעו באמצעות שני טלסקופי ענק: טלסקופ ESO/VLT המוצב בצ'ילה, וטלסקופ Keck המוצב בהוואי.
 
הממצאים שהתקבלו תומכים במודל המקובל, שלפיו הננס הלבן מקיים יחסי גומלין עם כוכב שכן, מסוג ענק אדום. כוח המשיכה החזק של הננס הלבן פועל כמעין "משאבה" ששואבת גזים אשר נפלטים מהענק האדום,ונבלעים בננס הלבן. בדרך זו, הענק האדום מאבד בהדרגה את המסה שלו, לטובת הננס הלבן. כאשר המסה של הננס הלבן עולה על רמה קריטית מסוימת - הוא מתפוצץ.
 
באמצעות התצפיות הצליחו המדענים להבחין בקיומן של מספר טבעות מתרחבות, המקיפות את הננס הלבן כאשר הוא מתפוצץ. טבעות אלה הן, כנראה, השיירים של הענק האדום ש"נאכל" על-ידי הננס הלבן.
 
ממצאים אלה, שפורסמו באחרונה בכתב-העת המדעי Science, נאספו על-ידי שתי קבוצות חוקרים. ד"ר פרדיננדו פטאט עמד בראש קבוצת האסטרונומים בצ'ילה, וד"ר אבישי גל-ים עמד בראש הקבוצה במכון הטכנולוגי של קליפורניה. ד"ר גל-ים הצטרף באחרונה כחוקר בכיר לסגל המחלקה לפיסיקה של חומר מעובה במכון ויצמן למדע.
 
עברית

תגובה לתרופה

עברית
 
פרופ' דורון לנצט ופרופ' אריאל מילר. רפואה תפורה על-פי מידה

 

 
 
צוות של מדענים ישראליים, מהטכניון, ממכון ויצמן למדע ומחברת "טבע", איתרו באחרונה מאפיינים גנטיים האחראים לתגובה טובה של חולי טרשת נפוצה לתרופה קופקסון. ממצאים אלה עשויים לתרום לפיתוח ולקידום יישום של טיפול תרופתי אישי לחולי טרשת נפוצה.
 
קופקסון היא התרופה הישראלית המקורית הראשונה שאושרה לשימוש על-ידי מינהל המזון והתרופות של ארה"ב, ה-FDA, והיא משווקת היום ביותר מ-40 מדינות בעולם, בהן ארה"ב, קנדה, ארצות רבותבאירופה, אוסטרליה, אמריקה הלטינית וישראל.
 
מולקולת התרופה היא פרי המצאתם של פרופ' מיכאל סלע, פרופ' רות ארנון, וד"ר דבורה טייטלבאום מהמחלקה לאימונולוגיה במכון ויצמן למדע. תהליך פיתוחה לתרופה נעשה על-ידי מדענים מחברת "טבע", שגם מייצרת ומשווקת אותה.
 
"עד היום מבוססים טיפולים תרופתיים במחלות שונות על בחירה אקראית של מינונים וזמנים במתכונת של 'ניסוי וטעייה'", אומר פרופ' אריאל מילר מהפקולטה לרפואה ומהמכון למדעי הרפואה על-שם רפפורט בטכניון, וראש המרכז לטרשת נפוצה וחקר המוח במרכז הרפואי כרמל. "תהליך זה, כלומר חיפוש הדרך עד להשגת ההשפעה הרצויה, פוגם ביעילות הטיפול, ובמקרים רבים אף עלול לגרום לסיבוכים". בשנים האחרונות התברר, כי תרופות רבות אינן מתאימות באותה מידת יעילות לכל המטופלים, וכי השונות הזאת נובעת מהבדלים גנטיים בין המטופלים. לפיכך, עלה הצורך בפיתוח טיפולים תרופתיים שיותאמו למאפיינים הגנטיים הייחודיים של המטופלים. "טיפול כזה עשוי להיות יעיל יותר, ולגרום פחות השפעות לוואי".
 
המחקר החדש, העוסק במרכיבים הגנטיים של התגובה לקופקסון, אשר ממצאיו פורסמו באחרונה בכתב-העת המדעי Pharmacogenetics and Genomics, מהווה צעד משמעותי בהתקדמות לקראת יישום החזון הרפואי הזה. במחקר המשותף סיפקה "טבע" את דגימות הדי-אן-איי מחולים מטופלים בתרופה, והבדיקות הגנטיות נעשו במעבדות מרכז קראון לחקר גנום האדם במכון ויצמן למדע, בראשות פרופ' דורון לנצט מהמחלקה לגנטיקה מולקולרית. לצורך כך השתמשו המדענים במערכת מתקדמת, ראשונה מסוגה בארץ, שמאפשרות סריקה מדויקת ומהירה של גנום האדם. שלושת השותפים למחקר בחנו את הקשר בין מספר סמנים גנטיים לבין התגובתיות של חולי טרשת נפוצה לקופקסון. כך עלה בידיהם לאתר מאפיינים גנטיים התורמים לתגובתיות טובה לקופקסון. ממצאים אלה מהווים צעד חשוב בדרך לשיפור יכולת החיזוי של תגובת מטופלים לתרופה. "ניתחנו את הרצף הגנטי של 27 גנים מועמדים בכל אחד מהחולים המשתתפים בניסוי", אומר פרופ' לנצט, "וזיהינו שני גנים בעלי סיכוי גבוה לקבוע את התגובה לקופקסון. בעתיד אפשר יהיה להשתמש בשיטה ובממצאים אלה כדי לסרוק את המטען הגנטי של חולים בטרשת נפוצה, לאבחן מראש את מידת התגובה שלהם לטיפול בקופקסון, ואולי אף לקבוע את המינון ואת אופן הטיפול המיטבי המתאים לכל אחד מהם".
 
במחקר השתתפו גם פרופ' ז'ק בקמן (אז במכון ויצמן למדע), ד"ר ליאת הירדני וד"ר דן גולדשטאוב מחברת "טבע", ואיריס גרוסמן, תלמידת מחקר משותפת בטכניון ובמכון ויצמן למדע.
 

קופקסון - עבר הנושק פני עתיד

בשנות ה-50 של המאה ה-20 החל פרופ' אפרים קציר ממכון ויצמן למדע (לימים הנשיא הרביעי של מדינת ישראל) לחקור את תכונות החלבונים, שהם מאבני הבניין של כל מערכת ביולוגית. לצורך כך יצר מודלים סינתטיים פשוטים של חלבונים שנקראו "פולי-חומצות אמיניות". תלמידו באותן שנים, פרופ' מיכאל סלע, שלימים כיהן כנשיא מכון ויצמן למדע וזכה בין היתר בפרס ישראל, החליט לבחון את השפעתן של מולקולות המודל הסינתטיות הללו על המערכת החיסונית. מחקרים אלה הובילו אותו למסקנה, שייתכן כי אפשר יהיה להשתמש בחומרים סינתטיים אלה לבלימה של טרשת נפוצה, מחלה אוטו-אימונית הנגרמת כאשר המערכת החיסונית של הגוף תוקפת את המעטפת השומנית של סיבי העצב ומחבלת בהעברת האותות החשמליים דרכם. פרופ' סלע, יחד עם תלמידתו דאז, פרופ' רות ארנון (לימים - כלת פרס ישראל, סגנית נשיא מכון ויצמן למדע ונשיאת האקדמיות למדעים באסיה), וד"ר דבורה טייטלבאום, ביצעו שורה ארוכה של ניסויים. תוצאות ניסויים אלה הובילו לפיתוח תרופה ולשורה של ניסויים קליניים, שבוצעו על-ידי חברת "טבע", ובהם נבחנו יעילות ובטיחות השימוש בה לטיפול בבני-אדם. בסיום התהליך, בשנת 1996, אושרה תרופת הקופקסון על-ידי מינהל המזון והתרופות האמריקאי (FDA). בכך הייתה הקופקסון לתרופה הישראלית המקורית הראשונה שאושרה לשיווק בארה"ב. כיום, לאחר 10 שנות שיווק פעיל בארה"ב ובעוד כ-40 מדינות, מהווה הקופקסון גורם צמיחה חשוב ל"טבע" ועמוד תווך בכלכלה הישראלית.
 
קו הייצור של קופקסון במפעל "טבע"
 
עברית

תעודת זהות, בבקשה

עברית
 
פרופ' ישראל פכט. הקשר החלבוני

 

 
 
קו ההגנה הקדמי של המערכת החיסונית מורכב מיחידות ניידות מיוחדות המסוגלות לזהות פולשים זרים ומזיקים - כמו נגיפים או תאים זרים. לוחמי היחידות האלה הם תאי T הנושאים על פניהם קולטנים מיוחדים שבאמצעותם הם בוחנים תאים הנקרים על דרכם, מזהים חלבונים מסוימים, ומוודאים אם מדובר בחלבון עצמי של הגוף או בחלבון זר. הזיהוי מתבצע כאשר הקולטן של תאי ה-T סורק מבנים חלבוניים גדולים ומורכבים הקרויים MHC המוצגים על-פניהם של כל תאי הגוף, כשבתוכם מעוגנים מקטעי חלבון קצרים. הרצף המולקולרי של המבנים המשולבים האלה מהווה מעין "תעודת זהות" של התא. קולטן תא ה-T שבוחן את תעודת הזהות הזו מסוגל לזהות בדייקנות שינויים קלים מאוד ברצף החלבוני: די בשינוי של חומצה אמינית בודדת, כדי שהחלבון יזוהה כזר. כך מצליחים תאי ה-T "לדוג" תא נגוע בנגיף מתוך אלפי תאים בריאים, גם כשמדובר בנגיף אותו לא פגשו מעולם.
 
מדענים רבים בעולם מנסים זה זמן רב להתחקות אחר התהליך שבו קולטן של תא T נקשר למבנה החלבוני המוצג על-פניהם של תאים. מחקרים שעשו שימוש בשיטות הקובעות מבנה תלת-ממדי של חלבונים (באמצעות קריסטלוגרפיה של קרני X), השיגו מידע באשר למבנה הגורמים המעורבים בתהליך, וזיהו את פני השטח של התאים הנושאים, שעליהם מוצגים המבנים החלבוניים לצורך בחינתם על-ידי תאי ה-T. מחקרים מסוג זה מסוגלים אמנם לזהות את מבנה הקולטן הקשור למבנה החלבוני, אך אינם תורמים להבנת שלבי הביניים של תהליך הקישור.
 
תעלומה רבת שנים זו נפתרה באחרונה, במחקר של צוות מדענים מצרפת, גרמניה וישראל, בראשות פרופ' ישראל פכט מהמחלקה לאימונולוגיה במכון ויצמן למדע. חברי הצוות הצליחו לספק את התמונות החסרות של שלבי הביניים, וחשפו בפרטי פרטים את התהליך שמאפשר למערך ההגנה של הגוף לסרוק גורמים חשודים ולבדוק את זהותם. ממצאים אלה, שהתפרסמו באחרונה בכתב-העת המדעי "רשומות האקדמיה הלאומית למדעים של ארה"ב" (PNAS), תורמים להבנה מעמיקה יותר של המערכת החיסונית ותיפקודה במצבי בריאות וחולי, דבר שעשוי להוביל לכיוונים חדשים במחקר הרפואי ובפיתוח תרופות מתקדמות.
 
פרופ' פכט וחברי קבוצת המחקר השתמשו בשיטה המאפשרת לצפות בתהליכים ביולוגיים ברמת הפרדה של אלפיות השנייה, והראו כיצד נקשרים הקולטנים של תאי T למבנים החלבוניים המורכבים. הם גילו, שתהליך הקישור מתחולל בשני שלבים נפרדים ועוקבים, ובכך הוכיחו את התיאוריה המקובלת הגורסת כי תהליך זה מתבצע בדרך של "התאמה מאולצת": המגע הראשוני בין הקולטן החלבוני של תא ה-T למבנה החלבוני המוצג על תא המטרה הוא זה שמפעיל את השלב השני, שבו מתחוללים שינויים מרחביים במבנה הקולטן, והוא מתאים את עצמו לצורת החלבון אותו הוא קושר.
 
פרופ' פכט אומר, כי ממצאי המחקר עשויים להסביר מה שנראה עד כה כפרדוקס קשה להסבר: תאי ה-T, המגלים בררנות גבוהה ביותר, המאפשרת להם לזהות בדייקנות מבנים חלבונים מסוימים, מסוגלים בכל זאת להיקשר למגוון רחב של חלבונים שונים. ניסויים נוספים שיתבססו על ממצאי המחקר הזה יספקו פרטים על היבטים נוספים של התהליך, כמו, לדוגמה, על הגורמים למחלות אוטו-אימוניות, על יכולתם של נגיפים מסוימים, כמו נגיף ה-HIV, להתחמק מהמערכת החיסונית, ועל הדרכים לפתח תרופות וטיפולים למחלות רבות.
 
במחקר השתתפו גם דמיטרי גקמסקי מהמחלקה לאימונולוגיה במכון ויצמן למדע; ארווין לוויצקי וארנסט גרל ממכון מקס פלנק לביופיסיקה, גרמניה; חוויאר סאלקווין, ברנרד מליסן ומרק בונוויל מהמכון הלאומי הצרפתי למחקר בריאות ורפואה; ופליקס מונטרו- ז'ולאן מחברת "בקמן קולטר", צרפת.
 
עברית

עמודים