<div>
Science Feature Articles</div>

הלב

עברית
.
מימין לשמאל: ד"ר עדנה בן - אשר, ד"ר צביה אולנדר וד"ר נילי אבידן. ציד גנים
 
 
מדענים ממכון ויצמן למדע ומהמרכז הרפואי על-שם שיבא בתל-השומר זיהו את מיקומה המדויק ואת אופיה של מוטציה גנטית, הגורמת הפרעת קצב לבבית תורשתית המתרחשת בתגובה למאמץ גופני או להתרגשות, הידועה גם בשם PVT) Polmorphic Ventricular Tachycardia) התסמינים השכיחים של מחלה זו, הפוגעת בעיקר בילדים, כוללים הרגשת חולשה פתאומית, סחרחורות, אובדן הכרה, ובמקרים קיצוניים - מוות פתאומי בתגובה למצבי מאמץ או התרגשות. תוצאותיו של מחקר זה תוארו באחרונה במאמר שפורסם בכתב-העת המדעי American Jorunal of Human Genetics . מוטציה שזיהו המדענים, השכיחה מאוד בקרב שבט בדואי מצפון הארץ, גרמה בעבר למותם של תשעה ילדים מבני השבט. "הממצא החדש עשוי לשפר את יכולתם של הרופאים לאתר את המחלה הקטלנית ולטפל בה, וכמו כן יסלול את הדרך להבנה טובה יותר של מחלות לב אחרות", אומרת ד"ר נילי אבידן מהמרכז לחקר גנום האדם על-שם קראון שבמכון ויצמן למדע. "אנחנו סבורים שמוטציות בגן זה יכולות להיות אחראיות להפרעות קצב לבביות אחרות, שהגורמים להן טרם פוענחו".
 
הדוקטורנטית הדס להט, בהנחיית פרופ' מיכאל אלדר וד"ר אילון פרס ממכון הלב ומהמכון הגנטי של המרכז הרפואי על-שם שיבא בתל-השומר, שפעלו יחד עם ד"ר נילי אבידן, ד"ר צביה אולנדר, ד"ר עדנה בן-אשר ופרופ' דורון לנצט מהמרכז לחקר גנום האדם על-שם קראון שבמכון ויצמן למדע, חקרו ומצאו שהמחלה נגרמת כתוצאה ממוטציה בגן המכונה CASQ2) Calsequestrin2), הממלא תפקיד חיוני בתהליך הכיווץ וההרפיה של שריר הלב. המוטציה משבשת את היכולת של החלבון שמקודד בגן CASQ2 לקשור ולשחרר יוני סידן על-פי הצורך (תהליכים אלה ממלאים תפקיד מרכזי בכיווץ והרפיה של רקמת השריר).
 
סיפור המחקר מתחיל בשבט בדואי החי בכפר בגליל העליון. ילדה בת שמונה מבנות הכפר התעלפה בעת מאמץ ואושפזה עקב כך בבית-החולים רמב"ם. שני אחיה סבלו מתופעות דומות, ועוד שניים מילדי המשפחה מתו בעבר בנסיבות דומות. הרופאים המטפלים לא ידעו את הסיבה המדויקת לתסמינים הקליניים האלה. ההנחה היתה כי מדובר בהפרעת קצב לבבית, אולם הרופאים לא ידעו מאיזה סוג. המשפחה הגיעה לפרופ' מיכה אלדר, מנהל מכון הלב במרכז הרפואי על-שם שיבא בתל-השומר, בבקשה לחוות דעת נוספת. בפגישה עמם התברר, כי בכפרם עוד מספר משפחות בעלות היסטוריה רפואית דומה. פרופ' אלדר איבחן את התופעה כמחלת לב נדירה המתבטאת בהפרעות קצב חמורות בלב. בהמשך אותרו שבע משפחות מהשבט, אשר נשלחו לאיבחון קליני מדויק במחלקת קרדיולוגיית ילדים בבית-החולים רמב"ם בחיפה.
 
אבות השבט הם, כנראה, שלושה אחים שהגיעו לגליל עם משפחתם המורחבת לפני כ-200 שנה. בני המשפחה התיישבו בכפר והתפרנסו בעיקר מחקלאות (גידולי שדה). כיום משרתים רבים מהם בצה"ל כגששים בשירות חובה וקבע. בשבט מקובלים מאוד נישואי קרובים. בשבע המשפחות שאותרו מתו באופן פתאומי בעשור האחרון תשעה ילדים בגילאי ארבע עד שבע שנים. ברוב המקרים קדמו למוות אירועי התעלפות או אובדן הכרה פתאומי בתגובה למאמץ או להתרגשות. ההורים לכל הילדים החולים לא הראו סימנים המזכירים את המחלה. עם זאת, קשרי משפחה מדרגה ראשונה או שנייה נמצאו תמיד בין בני זוג שלהם ילדים חולים.
 
בשלב זה החליטו החוקרים לאתר את הגןואת המוטציה הגורמים לתסמונת. באותו זמן, טרם סיומו של פרויקט גנום האדם, היו ידועים רק כ-40 מתוך 80 הגנים שהיו ממופים באזור שהיה חשוד בקשר למחלה. לפיכך החליטו הדס להט והמנחה שלה, ד"ר אילון פרס, לפנות ולבקש עזרה ממדעני מכון ויצמן למדע.
 
שתי קבוצות החוקרים נכנסו לעובי הקורה, וגילו שילדי השבט הסובלים מ- PVT נושאים גרסה מוטנטית של הגן CASQ2. להפתעתם התברר, שמדובר במוטציה קטנה מאוד: שינוי בנוקליאוטיד אחד בלבד ("אות" אחת בלבד מהצופן הגנטי). שיבוש זה בצופן הגנטי גורם לשינוי ברצף החומצות האמיניות שמרכיבות את החלבון, ולהחלפה של חומצה אמינית אספרטית בחומצה האמינית היסטידין.
 
שינוי יחיד זה משבש את יכולתו של החלבון המקודד בגן CASQ2 לקשור ולשחרר יוני סידן. "חלבון זה, הנושא מטען חשמלי שלילי חזק מאוד, מתפקד למעשה כמעין אברון תוך-תאי והוא מתאפיין ביכולת רבה לקשור ולאחסן יוני סידן", אומרת ד"ר אבידן. "אבל הגרסה המוטנטית של החלבון נושאת מטען חשמלי שלילי קטן יותר. תכונה זו של החלבון המוטנטי עלולה להפריע לו בתהליכי הקשירה והשחרור של יוני הסידן". יכולת נמוכה זו עלולה לשבש את תהליכי הכיווץ וההרפיה של רקמת שריר הלב, תופעה שעלולה לגרום להפרעות בקצב הלב, ולהוביל למוות.
 
במחקר זה השתתפו גם אתגר לוי-ניסנבאום וד"ר בולסלב גולדמן מהמרכז הרפואי על-שם שיבא בתל-השומר, וד"ר אסאד חורי וד"ר אברהם לורבר מהמרכז הרפואי רמב"ם בחיפה. המחקר נתמך על- ידי פרויקט התשתיות של משרד המדע, התרבות והספורט.
 
עברית

שירת הסירנה

עברית
 
ד"ר עירית שחר. תוצאות מעודדות
 
 
מערכת החיסונית של האדם היא מנגנון מאורגן היטב, ובדרך כלל יעיל מאוד. בין היתר היא כוללת יחידות מובחרות של תאים (לימפוציטים) מאומנים, המגיבים לאותות מצוקה המשוגרים אליהם מרקמות שהותקפו בידי מזהמים שונים. במענה לאותות המצוקה האלה יוצאים "לוחמי המערכת החיסונית" מכלי הדם ועושים את דרכם אל הרקמות המותקפות, שם הם נלחמים עד חורמה בפולשים הזרים והמזיקים. זוהי תגובה דלקתית. היא רצויה ולמעשה אפילו חיונית כאשר הגוף אכן נתון למתקפה שמסכנת אותו. אלא שלעתים קריאת המצוקה משוגרת בטעות, או שהיא גורמת לתגובה מוגזמת.
 
במקרה של קריאת מצוקה שגויה, ה"לוחמים" שנזעקו להילחם בפולש שאיננו עלולים לתקוף את תאיו הבריאים של הגוף. תגובה זו, הקרויה תגובה אוטו-אימונית, כלומר, תגובה של המערכת החיסונית כנגד מרכיבים עצמיים של הגוף, עלולה לגרום הפרעות ומחלות רבות, ברמות חומרה שונות, החל מדלקת כרונית קלה ועד למחלות העלולות לגרום מוות. במצב אחר, כאשר המערכת החיסונית נענית לקריאת חירום מוצדקת, אך עושה זאת בעוצמה רבה מדי, עלולות להתחולל מחלות דלקתיות שונות. ד"ר עידית שחר מהמחלקה לאימונולוגיה במכון ויצמן למדע, ותלמידת המחקר שלה, ליאת פליישון, הציעו באחרונה דרך להתגבר על תגובות מוגזמות של המערכת החיסונית.
 
ד"ר שחר התמקדה בחקר התנהגותם ומחזור חייהם של תאי המערכת החיסונית (תאי דם לבנים) מסוג B. תאים אלה נוצרים בלשד העצם (שמם נגזר מהאות הראשונה של המילה bone marrow , לשד עצם באנגלית). מלשד העצם הם נודדים אל הטחול, שם הם "מתבגרים". כשהם עוברים בכלי דם בדרכם אל הטחול, הם נחשפים לעתים לקריאות מצוקה (כימיות) המשוגרות מרקמות קרובות המותקפות על-ידי מזהמים כלשהם. תא B "מתוכנת" מעצם טבעו להגיב לאותות אזעקה אלה: לצאת מזרם הדם, לחדור דרך המרקם הבין-תאי, ולהגיע אל הרקמה המותקפת. אלא שתאי B צעירים, שטרם התבגרו, אינם כשירים עדיין להילחם באויב חיצוני. למעשה, כאשר תא B צעיר מדי נתקל בסימנים המעידים על נוכחותו של אויב - הוא מת.
 
כאן עולה שאלה: אם תאי ה-B הלא בוגרים נענים לפיתויים וסוטים הצידה לפעולות התאבדות לפני שהם מגיעים לטחול, כיצד מצליח הגוף לייצר תאי B בכמות הדרושה לפעילות תקינה של המערכת החיסונית? התשובה היא, שלתאי ה- B הלא בוגרים יש מנגנון שמאפשר להם להתנגד לשירת הסירנה המפתה המגיעה אליהם מהרקמות המותקפות. כשד"ר שחר וחברי קבוצת המחקר שלה התבוננו בתופעה הזאת, עלו בדעתם שתי שאלות: כיצד פועל מנגנון ההגנה של תאי ה- B הצעירים? והאם אפשר ללמוד מהמנגנון הזה על דרכים אפשריות לדיכוי תגובות חיסוניות בלתי-רצויות? המדענים, שנכנסו לעובי הקורה בחיפושיהם אחר תשובות לשאלות אלה, גילו להפתעתם שתאי ה- B הלא בוגרים מייצרים אינטרפרון גאמה (סוג של ציטוקין, מעין חלבון קצר המשמש "שליח כימי" שמעביר מסרים תקשורתיים בין מרכיבים שונים של המערכת החיסונית). כאשר תאי T של המערכת החיסונית מאותתים באמצעות ייצור כמויות גדולות של אינטרפרון גאמה, הם מגייסים בכך "לוחמים" נוספים, דבר שמגביר את התגובה הדלקתית. אבל כאשר תאי T מייצרים כמויות קטנות מאוד של אינטרפרון גאמה, הם גורמים בכך לתופעה הפוכה שאפשר לראותה כסירוב לגיוס: הפחתה ביכולתם של התאים להגיע לאזור הדלקת, ולצאת לעזרתה של הרקמה המותקפת.
 
תגלית זו הובילה את ד"ר שחר למסלול מחקר, שנועד לגלות את הדרך שבה תאי ה- B הלא בוגרים מצליחים לסרב ולהתנגד לצו הגיוס שמזעיק אותם למלחמה אבודה מראש. ובכן, ידוע שתא B המבקש להיענות לקריאה לעזרה חייב להיצמד לחלבונים מסוימים המוצבים על דופן כלי הדם. לשם כך עליו לארגן מחדש את השלד התאי שלו. ד"ר שחר וחברי קבוצת המחקר שלה גילו, שהאינטרפרון גאמה מונע את הארגון מחדש הזה, דבר שגורם לתא ה- B הצעיר להמשיך בדרכו אל הטחול ולהימנע מסטייה להרפתקאות שאינן רצויות לו בשלב הזה של חייו.
 
בשלב זה החליטו ד"ר שחר והרופאים המשתלמים ליאת פליישון ויאן טופילסקי לנסות להשתמש בכמויות קטנות של אינטרפרון גאמה לבלימת פעילותם של מרכיבים שונים של המערכת החיסונית, לרבות תאי T יוצרי דלקת. לשם כך השתמשו במודל אסתמה בעכברים, כלומר, בעכברים שמתחוללת בהם אסתמה, שהיא מחלה דלקתית שכיחה מאוד, הנובעת מתגובה מוגזמת ומסוכנת באופן מיוחד של המערכת החיסונית. בעת התקף אסתמה מציפים תאי ה- T של המערכת החיסונית את בלוטות הלימפה שבריאות, דבר שגורם לעיבוי דפנותיהם של הסימפונות, ומשבש בכך את הנשימה.
 
בסדרת ניסיונות שביצעו ד"ר שחר ותלמידיה התקבלו תוצאות מעודדות ביותר: כמויות מזעריות של אינטרפרון גאמה הפחיתו במידה רבה את הדלקת בסימפונותיהם של העכברים האסמתיים. בימים אלה נבחנת האפשרות לטפל באמצעות כמויות מזעריות של אינטרפרון גאמה בעכברים הסובלים מהתקפי אסתמה חמורים במיוחד. בקרוב יוחל בבחינת התאמתה של השיטה לטיפול בבני-אדם. אם זוכרים שאסתמה היא מחלה שכיחה מאוד בעולם המערבי, אפשר להניח מיליוני בני-אדם ממתינים לתוצאות הניסויים האלה בתקווה.
שירת הסירנה
 
עברית

תעודות משלוח גנטיות

עברית
ד"ר זיו רייך. בעקבות הסוס הטרויאני
 
אלף ספינות עמוסות לוחמים עזי נפש הפליגו מאיי יוון וצרו על חומותיה האדירות של העיר טרויה במלחמה שהתחוללה על חסדיה של הלנה היפה. אבל, כפי שתיאר הומרוס ביצירתו האלמותית, ה"איליאדה", כל העוצמה הצבאית הזאת לא הצליחה להבקיע את חומות העיר, עד שאסטרטג יווני ערמומי הגה תוכנית פעולה לא שגרתית.
 
מדענים ורופאים המבקשים לפתח וליישם טכניקות של ריפוי גנטי מוצאים את עצמם במצב דומה לזה של הלוחמים היווניים שצרו על חומות טרויה. חמושים בגנים תקינים ובריאים, העשויים להביא להחלמתם של חולים במחלות שונות, עומדים המדענים והרופאים האלה לפני מערך ביצורים המורכב משתי חומות: קרום המעטפת של התא, ואחריו הקרום העוטף את גרעין התא,שבו מוחזק החומר הגנטי שלו. כדי ליישם את הריפוי הגנטי חייבים המדענים והרופאים להעביר את הגנים התקינים שבידיהם דרך שתי החומות האלה, כך שהם יוכלו להשתלב במטען הגנטי של תאי האדם המטופל. אלא שכמו הלוחמים היוונים, גם המדענים והרופאים חייבים למצוא דרכים מתוחכמות כדי להבריח את הגנים התקינים מבעד לחומות הביולוגיות.
 
אחת מהדרכים שנוסו כדי להעביר את הגנים הרצויים אל גרעין התא התבססה על שירותיהם הטובים של נגיפים. במבט ראשון נראה שנגיפים הם הכלים המתאימים ביותר למשימה זו, מכיוון שזה בדיוק מה שהם עושים, בהצלחה, במשך מיליוני שנים: הם מחדירים את הגנים שלהם לתוך תאים חיים,משלבים אותם במטען הגנטי של המארח, ומאלצים אותו לשכפל עוד ועוד נגיפים בדמותם ובצלמם. כדי ליהנות מ"דובשם" של הנגיפים ולא להינזק מ"עוקצם", מוציאים מהם המדענים את המרכיבים הגנטיים המזיקים, ומחליפים אותם בגנים התקינים שהם מבקשים להחדיר לגרעין תא המטרה. תוכנית פעולה זו, שנראתה מבטיחה בתחילה, התגלתה בהמשך כבעייתית כאשר נמצא כי הנגיפים המהונדסים גורמים, בכל זאת, נזקים שונים, כגון הפצת חומרים רעילים, עירור תגובות חיסוניות ודלקתיות, ואף "כיבוי" גנים בריאים, לרבות גנים האחראיים לדיכוי התפתחותם של גידולים סרטניים. אם לא די בכל אלה, התברר שהנגיפים המהונדסים עשויים לעבור מוטציות שונות שיכולות להקנות להם תכונות מזיקות נוספות.
 
כך החלו המדענים לחפש דרכים חלופיות להעברת "חבילות בריאות גנטיות" אל גרעין התא. "כלי הרכב" החדשים שנבחנו למטרה זו היו מולקולות של פולימרים (שרשרות מולקולריות ארוכות, דמויות מחרוזות), או ליפידים (מולקולות דמויות שומן). פולימרים וליפידים אינם עוברים מוטציות, ולפיכך הם בטוחים יותר מנגיפים. הם גם מצליחים להחדיר די-אן-אי לתוך תאי המטרה, אבל אינם מצליחים לחדור את המכשול האחרון, ומת "קודש הקודשים" של התא, מעטפת הגרעין שבו מאוחסן המטען הגנטי שלו.
 
כאן נכנסו לתמונה ד"ר זיו רייך מהמחלקה לכימיה ביולוגית במכון ויצמן למדע, וחברי קבוצת המחקר שהוא עומד בראשה. בדומה ללוחמים היווניים שצרו על טרויה, הם פיתחו "סוס טרויאני" מולקולרי שאיפשר להם להחדיר גנים "חיצוניים" אל תוך קרום התא. כדי להבין את דרך פעולתו של "הסוס הטרויאני" המולקולרי יש לדעת, כי במעטפת הגרעין קיימות "תעלות" שדרכן יכולות מולקולות קטנות וגדולות לחדור אל הגרעין או לצאת ממנו. אולם, בעוד שמולקולות שקוטרן מגיע עד שמונה או תשעה נאנומטרים (נאנומטר הוא מיליונית המילימטר) יכולות לעבור דרך התעלה באופן חופשי, מולקולות גדולות יותר – דוגמת מולקולות די-אן-אי - המבקשות לעבור דרך קרום מעטפת הגרעין, "נדרשות" להציג "תעודות משלוח" מיוחדות שעליהן מצוין במפורש שהן מיועדות להגיע אל גרעין התא. "תעודות משלוח" אלה הן, למעשה, רצפים חלבוניים קצרים (פפטידים) הקרויים NLS. גנים "חיצוניים" המידפקים על שערי המעטפת של גרעין התא, ואינם נושאים את "תעודות המשלוח" האלה NLS) ), פשוט אינם עוברים את מחסום "הבדיקה הביטחונית", ומושארים בחוץ.
 
במאמציו להתגבר על בעיה זו הצליח ד"ר רייך למצוא דרך "להרכיב" את הגן המיועד למשלוח על גבי מולקולה אחרת שכבר מצוידת ב"תעודת המשלוח" המייעדת אותה אל גרעין התאNLS ) ). כדי לעשות זאת הוא מבצע במולקולת הדי-אן-אי המיועדת להעברה פעולות התאמה המאפשרות לה היקשר אל המולקולה המעניקה לה "טרמפ". כך מצליח הגן החיצוני לחדור אל גרעין תא כ"טרמפיסט", בתצורה המשמרת את המידע הכלול בו, כשהוא ניתן לקריאה. החלבונים שמעניקים לגן החיצוני את ה"טרמפ" אינם מפריעים לתהליך הקריאה, כיוון שתפקידם הטבעי הוא להיקשר אל הדי-אן-אי שבתוך הגרעין. תהליך התאמת הגן החיצוני לקבלת ה"טרמפ", שפיתח ד"ר רייך, הוא יעיל, מדויק ולא יקר. ובנוסף לכך, המחקר שהוביל לפיתוח השיטה החדשה טמן בחובו התפתחויות נוספות, בכיוון לא צפוי.מאחר שקיימים סוגים רבים של חלבונים המחזיקים ב- NLS, נדרשו ד"ר רייך וחבריו לבחור את החלבון שישמש אותם לצורך המחקר. הם בחרו במשפחת חלבונים הנקראת NFbK. ד"ר רייך: "בחרנו בחלבונים אלו מפני שהם נקשרים לדי-אן-אי בחוזקה, ואפשר לשלוט בכניסתם לתוך הגרעין באמצעות שיגור אותות מסוימים אל התא". אך חלבוני ה- NFbK הוכיחו עצמם כמבטיחים הרבה יותר מכפי שציפו המדענים בתחילה. בעוד ד"ר רייך בוחן את האפשרות להשתמש בהם כב"כלי רכב" ה"מובילים" גנים אל גרעין התא, התברר שהם ממלאים תפקיד מרכזי בתהליכים המובילים להתחוללותן של כמה מחלות אוטואימוניות ומחלות סרטניות, לרבות מחלת הודג'קינס, שהיא סוג נפוץ של לימפומה. מתברר, שבעוד שבתאים בריאים חלבוני ה- NFkB חודרים לגרעין רק כשהם מקבלים אות מיוחד, בתאים שבהם מתחוללת מחלת הודג'קינס הם נעים שוב ושוב בין גרעין התא לבין המרקם התוך-תאי.
 
עדי מסיקה, אחת מתלמידות המחקר של ד"ר רייך, סבורה שתכונה זו של חלבוני ה- NFkB בתאי ההודג'קינס יכולה להיות מנוצלת לקטילה בררנית של התאים האלה. די-אן-אי המקודד את המידע הדרוש לבנייתו של חלבון הגורם להרס עצמי של התא, עשוי לחדור לגרעין התא כ"טרמפיסט" על גבה של מולקולת חלבון ממשפחת BkFN. מכיוון שחלבונים אלה לא ייכנסו לגרעיניהם של תאים רגילים ובריאים כל עוד לא יישלחו לעברם האותות המתאימים, תוכל השיטה הזאת לשמש להרס בררני של תאי ההודג'קינס בלבד. דרך פעולה זו תיבחן בקרוב במחקר שיבוצע בשיתוף פעולה עם רופאים מבית החולים על שם שיבא בתל השומר.
 
 
 
עברית

הזרוע הקצרה של כרומוזום תשע

עברית
מימין לשמאל: ד"ר עדנה בן-אשר, ד"ר צביה אולנדר וד"ר נילי אבידן. שורשים גנטיים
 
חוקרים ממכון ויצמן למדע ברחובות ומבית-החולים הדסה בירושלים זיהו את הגן שגרסאות פגומות שלו גורמות להתפתחות מחלת ניוון שרירים ייחודית (מיופתיה תורשתית מסוג HIBM ). מחלה זו שכיחה בקרב יהודים יוצאי איראן והארצות השכנות לה. התגלית התפרסמה באחרונה בכתב העת Nature Genetics. 
 
התיאור הראשון של מחלה זו נרשם לראשונה ב- 1984 על-ידי פרופ' זוהר ארגוב מהמחלקה הנוירולוגית בבית-החולים הדסה עין-כרם בירושלים. המחלה מתבטאת בחולשת שרירים הדרגתית ברגליים, ובשלב מאוחר יותר פוגעת בשרירי הידיים ומובילה לנכות כללית.
 
בשנת 1996 מופה מיקומו הגנומי של הגן האחראי למחלה: הזרוע הקצרה של כרומוזום תשע. תגלית זו, של פרופ' סטלה מיטרני-רוזנבאום מהיחידה לביולוגיה מולקולרית בבית-החולים הדסה הר הצופים, היוותה את ראשית הפיענוח של מחלת ניוון שרירים ייחודית זו. משלב זה נדרש עוד מאמץ של חמש שנים, שהביא בסופו של דבר לפיצוח חידת המחלה הקשה. במרדף הגנטי הזה מילאו חוקרים ממרכז קראון לחקר גנום האדם שבמכון ויצמן למדע תפקיד מרכזי. בצוות זה השתתפו פרופ' דורון לנצט, פרופ' ז'קי בקמן, ד"ר עדנה בן-אשר, ד"ר נילי אבידן, ד"ר צביה אולנדר, וד"ר מרים חן. יחד אתם עבדו פרופ' סטלה מיטרני-רוזנבאום, תלמידות המחקר שלה, איריס אייזנברג וחגית הוכנר, וכן ד"ר תמרה פוטיכהת, מרק ברש, משה שמש, גיל גרבוב, אינה שמילביץ ופרופ' אדם פרידמן מהמחלקה לביולוגיה מולקולרית בבית-החולים הדסה הר הצופים.
 
המדענים הפעילו באופן מתוחכם את מאגרי הנתונים שנוצרו במסגרת פרויקט גנום האדם, וכך, יחד עם עמיתיהם מבית-החולים הדסה, הצליחו לזהות את ההתמרה הגנטית (מוטציה) הגורמת למחלה. המוטציה שהתגלתה פוגעת באנזים הממלא תפקיד מרכזי במסלול האחראי לבניית פרודות (מולקולות) סוכר מסוג Sialicacid שהן מרכיב חיוני במבנה ובתפקוד של חלבונים רבים. החוקרים משערים שהעדר הסוכר גורם להצטברות חלבון פגום בתאי השריר, דבר הגורם לניוונם. תגלית זו תפתח פתח להבנה עתידית טובה יותר של ניוון השרירים, ובשלב מאוחר יותר אף לפיתוח אמצעים מתקדמים לריפוי המחלה.
 
בדיקה גנטית שכבר פותחה בעקבות התגלית מאפשרת כיום אבחנה טרום-לידתית למשפחות מאוכלוסיית הסיכון. הדבר חשוב במיוחד ליהודים יוצאי איראן, שביניהם אחד מכל 20 אנשים נושא את המוטציה.החוקרים מציינים, כי התגייסותן של משפחות החולים בארץ ובחו"ל למאמץ הכולל לסייע במחקר, הן במתן דגימות דם והן בתמיכתן הכספית הנדיבה, היתה מכרעת בחשיבותה ובתרומתה לפיענוח הבסיס הגנטי של המחלה. המחקר בוצע במסגרת המעבדה הלאומית לתשתיות גנומיות, הפועלת במכון ויצמן למדע בתמיכת משרד המדע.
עברית

טריליון מחשבים בטיפת מים

עברית
פרופ' אהוד שפירא, קובי בננסון וד"ר רבקה אדר. חישוב ביוכימי
 
בשנת 1954 בנו מדעני מכון ויצמן למדע את המחשב האלקטרוני הראשון בישראל, ומהראשונים בעולם. הם קראו לו בחיבה "ויצק". כעבור 30 שנה כבר היה בעיצומו עידן המחשבים המבוססים על שבבי סיליקון, שכל אחד מהם מסוגל לבצע פעולות חישוב בהיקף העולה פי אלפים ומיליונים על כושר החישוב של "ויצק". כיום עוסקים במכון ויצמן במחקר שנועד להביא לפיתוחם של שבבי מחשב זעירים ויעילים עוד יותר. שבבים אלה יפעלו על פי חוקיה המתהווים של האלקטרוניקה הקוואנטית, ויש המעריכים כי הם יעשו לשבבי הסיליקון את מה ששבבי הסיליקון עשו למחשבים בני דורו של "ויצק". אבל, מפתיע ככל שהדבר אולי יישמע, כבר כיום יש מי שמתכנן לבצע פעולות חישוב במסלול התקדמות שונה לחלוטין. פרופ' אהוד שפירא, מסגל הפקולטה למתמטיקה ומדעי המחשב של מכון ויצמן למדע, אותו מקום שבו נבנה "ויצק", חצה את כיכר הדשא שבמרכז המכון והקים מעבדה בבניין המאכלס ברובו מדענים מתחום מדעי החיים, ביולוגים וביוכימאים. כאן, יחד עם תלמיד המחקר שלו, יעקב בננסון, ועמיתת המחקר ד"ר רבקה אדר,ובשיתוף עם פרופ' צבי ליבנה וד"ר תמר פז-אליצור מהמחלקה לכימיה ביולוגית במכון, הוא מתכנן, ובאחרונה אף הצליח להדגים, מחשב זעיר - אוטומט סופי הניתן לתכנות – הבנוי ממולקולות ביולוגיות בודדות. אמנם, בשלב זה מדובר במערכת המסוגלת לבצע חישובים מוגבלים למדי, ועם זאת, טיפת תמיסה אחת במעבדתו החדשה של פרופ' שפירא עשויה להכיל לא פחות מטריליון נאנו-מחשבים ביולוגיים כאלה, הפועלים ומבצעים חישובים בעת ובעונה אחת, במידת דיוק של יותר מ- %99.8 לפעולת חישוב, וצורכים לשם כך פחות ממיליארדית הוואט.

 

 

קלט ופלט

הקלט, הפלט וה"תוכנה" של המחשב הזעיר בנויים מולקולות DNA, החומר הגנטי. ה"חומרה" שלו מורכבת משני אנזימים ("מכונות מולקולריות") המבצעים פעולות שונות על מולקולות DNA. כאשר מולקולות אלו נתונות יחד בתמיסה, מולקולות החומרה והתוכנה פועלות יחד, בתיאום, על מולקולות הקלט, ומייצרות את מולקולת הפלט. המערכת המולקולרית הזאת פועלת כמכונת חישוב מתמטית הנקראת "אוטומט סופי". הנאנו-מחשב הביולוגי ניתן לתכנות באמצעות בחירת מולקולות שונות של "תוכנה". למשל, אפשר לתכנת את המחשב כך שיבדוק האם במולקולת קלט המקודדת רשימה של הספרות 0 ו-1, כל מופעים של 0 קודמים לכל המופעים של 1.

 
"בתא החי יש מכונות מולקולריות משוכללות הפועלות על מולקולות נושאות מידע כגון DNA ו- RNA בדרך שדומה ביסודה לתהליכי חישוב", אומר פרופ' שפירא, מהמחלקה למתמטיקה שימושית ומדעי המחשב, והמחלקה לכימיה ביולוגית במכון. "עד כה איננו יודעים כיצד לשנות את המכונות האלה או ליצור מכונות חדשות. לכן אנו מתמקדים באיתור מכונות טבעיות שהשילוב ביניהן עשוי לגרום להן לבצע פעולות חישוב". שפירא הציב לפני תלמיד המחקר שלו, יעקב בננסון, אתגר: לתכנן מחשב מולקולרי שיוכל לקבוע האם מספר המופעים של הספרה 1 ברשימה של הספרות 0 ו -1הוא זוגי. בננסון פתר את הבעיה באמצעות DNA ושתי מכונות מולקולריות טבעיות: האנזים 1Fok-, החותך מולקולות DNA באופן ייחודי, והאנזים Ligase, המחבר שתי מולקולות DNA זו לזו.

 

 

מולקולות תוכנה

בתהליך המחקר הבינו פרופ' שפירא וחברי קבוצת המחקר שלו, שהנאנו-מחשב הביולוגי שבנו ניתן לתכנות באמצעות בחירת קבוצות שונות מבין המולקולות המקודדות את שמונה כללי הפעולה האפשריים של אוטומט סופי דו-מצבי הפועל על רשימות של 0 ו-1. שמונה המולקולות של כללי הפעולה (כלומר, מולקולות התוכנה) יחד עם שתי מולקולות "הצגת פלט" המציגות את תוצאת החישוב יכולות להרכיב 735 תוכניות הפעלה לנאנו-מחשב הביולוגי. המדענים בחנו במעבדה כמה מהתוכניות האלה, כולל התוכניות הבודקות האם ברשימה של ספרות 0 ו -1מופיעה הספרה 0 לפני הספרה 1, והאם מספר מופעי הספרה 1 הוא זוגי. כן נבחנו תוכניות הבודקות האם ברשימה מופיעה הספרה 0 לפחות (או לכל היותר) פעם אחת, האם הספרה 0 מופיעה לאחר הספרה 1, והאם הרשימה מתחילה ב-0 ומסתיימת ב – 1.

 

 

ארבע אותיות

הנאנו-מחשב הביולוגי שבנו פרופ' שפירא וחברי צוותו משתמש בארבע ה"אותיות" של הצופן הגנטי T,C,G,A) ( , המרכיבות את מולקולת ה- DNA, כדי לקודד את הקלט ואת כללי ה"תוכנה". מולקולת הקלט ומולקולת התוכנה מתוכננות כך שגדיל DNA אחד שלהן ארוך ממשנהו, כך שבקצה המולקולה משתלשל גדיל DNA בודד הקרוי "קצה דביק". אם אותיות ה"קצה הדביק" של מולקולת הקלט הן בנות זוג משלימות לאותיות ה"קצה הדביק" של מולקולת תוכנה, עשויות שתי המולקולות להיצמד זו לזו באופן זמני, והאנזים Ligase יכול לחברם למולקולה אחת. "הקצה הדביק" של מולקולת הקלט מקודד את הסמל ואת מצב החישוב הנוכחי, ואילו הקצה הדביק של מולקולת התוכנה מזהה שילוב מסוים בין סמל ומצב חישוב. לאוטומט הסופי הדו-מצבי, דו-סימלי, ישנם ארבעה שילובים כאלה. לכל שילוב יכול הנאנו-מחשב להגיב בשני צעדים אפשריים: להישאר במצבו הנוכחי, או לשנות את מצבו. שמונה שילובים של מולקולות תוכנה מכסים את כל אפשרויות הפעולה של המחשב.

 
בכל צעד בתהליך החישוב נצמדת מולקולת קלט למולקולת תוכנה )באמצעות הצמדה זמנית של ה"קצוות הדביקים" שלהן זה לזה( והאנזים Ligase מחברם באופן קבוע. בפעולה זו צורך האנזים אנרגיה בצורת שתי מולקולות PTA. האנזים 1- koF מזהה אתר ייחודי על מולקולת התוכנה שחוברה למולקולת הקלט, וחותך את מולקולת הקלט במקום המוגדר על-ידי מולקולת התוכנה, ובכך חושף "קצה דביק" המקודד את סימן הקלט ומצב החישוב הבאים. תהליך זה חוזר על עצמו עד שלאחר עיבוד הסימן האחרון נוצרת מולקולת הפלט בעלת "קצה דביק" המקודד את המצב הסופי של החישוב. לכל אחד משני המצבים הסופיים מתאימה מולקולת "הצגת הפלט" בעלת קצה דביק שונה ואורך שונה, אשר לאחר חיבורה עם מולקולת הפלט ניתן לזהותה בטכניקה הקרויה נדידה חשמלית "אלקטרופורזה"), המפרידה בין מולקולות DNA על פי אורכן. הנאנו-מחשב הביולוגי שבנו פרופ' שפירא וחברי קבוצת המחקר הוא פשוט מכדי שאפשר יהיה לבסס עליו יישומים כלשהם. עם זאת, המדענים מקווים שהוא יוביל לפיתוחם של נאנו-מחשבים ביולוגיים שאפשר יהיה להפעילם בתוך תאי גוף האדם כך שהם ישתלבו וישפיעו על תהליכים ביוכימיים שונים המתחוללים בהם. פרופ' צבי ליבנה מהמחלקה לכימיה ביולוגית במכון יצמן למדע, ששיתף פעולה במחקר עם צוותו של פרופ' שפירא, סבור שייתכן כי בדרך זו יוכלו המחשבים הזעירים האלה לחולל תהליכי ריפוי שונים, על-פי תכנות מראש. "ייתכן שנאנו-מחשבים ביולוגיים עתידיים יוכלו לזהות תהליכים ביוכימיים לא תקינים המתחוללים בגוף, ובתגובה לכך ייצרו מולקולות של תרופה שיחזירו את הפעילות הביוכימית לתקנה". במחקר השתתף גם פרופ' אהוד קינן מהמחלקה לכימיה בטכניון ומהמחלקה לביולוגיה מולקולרית במכון סקריפס, בארה"ב.
 
 
 

פרופ' אהוד שפירא

קיבל תואר ראשון במתמטיקה ופילוסופיה מאוניברסיטת ייל, והצטרף למכון ויצמן למדע בשנת 1982. בשנות ה-80 היה מעורב בפרויקט היפאני לפיתוח "מחשבי הדור החמישי", ופירסם מאמרים וספרים על הלוגיקה של שפות תכנות מקביליות. בשנות ה-90 הובילו מחקריו בתחום פיתוח שפות התכנות להקמתה של חברת "יוביק", שעסקה בפיתוח סביבות אינטראקטיביות ברשתתות מחשבים. כשהחברה נקנתה על ידי "אמריקה און ליין" נטל פרופ'  שפירא חופשה ללא תשלום כדי לסייע בהטמעת הטכנולוגיה שפיתחה "יוביק" ליבמ, ופרופ'  שפירא חזר למכון ויצמן למדע, שם הקים את המעבדה לנאנו-מחשבים ביולוגיים אשר בה התבצע המחקר. תכנון של פרופ' שפירא למחשב מולקולרי, ששימש בסיס לפיתוחו של הנאנו-מחשב הביולוגי המתואר במאמר שהתפרסם האחרונה ב"נייצר", נרשם לא מכבר בארה"ב כפטנט מספר 569,266,6.

עברית

בלימת ההשמדה

עברית
פרופ' ירון כהן. שמירה על רמת האינסולין
 
ניסוי קליני שבוצע באחרונה בבית- החולים "הדסה" בירושלים הוכיח, כי חומר תרופתי ניסיוני מצליח לבלום את מחלת הסוכרת מסוג 1, הידועה גם כ"סוכרת נעורים". החומר התרופתי הניסיוני, הקרוי DiaPep 277, פותח על-ידי חברת פפטור מקריית ויצמן בנס ציונה, על בסיס מקטע של מולקולת חלבון (פפטיד 277 ), שהתגלה בידי פרופ' ירון כהן וחברי קבוצת המחקר שהוא עומד בראשה, במכון ויצמן למדע. הניסוי הקליני, שבוצע בשיתוף עם רופאים בבית הספר לרפואה של "הדסה" והאוניברסיטה העברית בירושלים, ועם חברת פפטור בע"מ, תואר בכתב העת הרפואי היוקרתי "דה-לנצט".
 
בניסוי השתתפו 35 חולים שבאחרונה אובחנה אצלם סוכרת מסוג 1. בתחילת הניסוי חולקו החולים באקראי לשתי קבוצות טיפוליות. החולים מקבוצה טיפולית אחת קיבלו בתקופה של ששה חודשים שלוש זריקות שהכילו 277 DiaPep (המכיל את פפטיד 277 המעורב בתחליב שמן). החולים מהקבוצה הטיפולית השנייה (קבוצת הביקורת) קיבלו מתכונת זריקות שהכילו תערובת סרק בלתי מזיקה ("פלסיבו"). המדענים, שעקבו אחר רמות האינסולין וכן אחר תפקוד המערכת החיסונית בגופם של המטופלים, זיהו בגופם של המטופלים מהקבוצה הראשונה (שקיבלו את DiaPep 277 ) בלימה של תהליך השמדת תאי הלבלב המייצרים את האינסולין, דבר שהתבטא בשמירה על הרמה הקיימת של ייצור אינסולין טבעי, ובהפחתה ניכרת של הצורך לספק לחולה אינסולין בהזרקה. לא התגלו השפעות לוואי בעקבות הזרקת 277 Diapep .
 
לעומת זאת, במצבם של החולים מקבוצת הביקורת (שלא קיבלו את 277 DiaPep) אובחנה הידרדרות מובהקת של המחלה: גופם ייצר כמויות פוחתות והולכות של אינסולין, כך שהם נזקקו ליותר ויותר זריקות אינסולין. 
 
סוכרת מסוג 1 היא מחלה כרונית הנגרמת כתוצאה מהתקפה של המערכת החיסונית על תאי הלבלב המייצרים אינסולין, דבר שגורם להרס התאים האלה (זוהי מחלה אוטו-אימונית, שבה המערכת החיסונית של הגוף תוקפת את הגוף, שעליו היא אמורה להגן, ופוגעת בו). החולים בסוכרת מסוג 1 חייבים להזריק לגופם אינסולין ממקור חיצוני. אינסולין הוא הורמון שמחדיר את הסוכר הנישא בזרם הדם אל תוך התאים(שבהם מעובד הסוכר ומשמש לייצור אנרגיה הדרושה להפעלת הגוף). קיים גם סוג נוסף של סוכרת, הקרוי סוכרת מסוג 2. מחלה זו נובעת מתגובה לא תקינה של הגוף לאינסולין, והיא אינה אוטו-אימונית. הטיפול בחולים במחלה זו מתבסס בעיקר על דיאטה ופעילות גופנית. מספר חולי הסוכרת בעולם מגיע כיום ל-140-120 מיליון בני אדם.
 
מדעני "הדסה" שהשתתפו במחקר: פרופ' איתמר רז וד"ר מיוריאל מצגר. מטעם חברת פפטור בע"מ השתתפו ד"ר דנה אליאס (שהיתה תלמידת מחקר וחוקרת בתר-דוקטוריאלית במעבדתו של פרופ' ירון כהן במכון ויצמן למדע, וכיום היא מכהנת כסגן נשיא למחקר ולפיתוח בחברת פפטור), ד"ר אן אברון וד"ר מיראנה תמיר.
עברית

מוות בתחנת הכוח

עברית
ד"ר איתן גרוס. הקרבה למען הכלל
 
תאים חיים, היחידות בסיסיות של כל יצור חי, יכולים לעבור באחת משתי דרכים עיקריות במסעם האחרון. אחת מהדרכים האלה היא, למעשה, הקרבה עצמית שבה התא החולה או הפגוע מעדיף למות מכיוון שהמשך חייו עלול לגרום נזק גדול יותר לאורגניזם השלם. תופעה זו קרויה "אפופטוזיס" (השם נגזר מהמלה היוונית העתיקה המתארת נשירה של עלים בשלכת). "המוות המתחולל בדרך זו הוא מהיר ונקי", אומר ד"ר איתן גרוס מהמחלקה לבקרה ביולוגית במכון ויצמן. "הוא מתחולל ללא דלקות, אינו משאיר שאריות, ואינו גורם נזק לתאים הסובבים. התא ה'מאבד את עצמו לדעת' פשוט מתכווץ, מת, ונאכל על-ידי תאים אחרים". כשל או תקלה בתהליכי האפופטוזיס יגרמו לכך שתאים חולים או פגועים ימשיכו לחיות, תוך שהם מחוללים תהליכים הרי אסון שעלולים לפגוע באורגניזם השלם. כך, למשל, עלולות להיגרם מחלות כגון סרטן, איידס, מחלת אלצהיימר ועוד.
 
"הרס עצמי", אומר ד"ר גרוס, "אינו דבר קל. 'המדריך להתאבדות' של התא, אותה 'תוכנה' המורה לו, בתנאים מוגדרים, 'לאבד את עצמו לדעת', מכיל מערך הוראות מסובך ומורכב מאוד". בשנות ה-80 התגלתה משפחת חלבונים בשם 2 BCL- הממלאת תפקיד מרכזי באפופטוזיס, דבר שהאיץ במידה ניכרת את הפעילות המחקרית בתחום זה. התחום קיבל חיזוק נוסף כאשר התגלה שאנזימים הנקראים Caspases משמשים גם כמפעילים של מספר חלבונים ממשפחת ה 2 BCL-. בשלב זה החלו מדענים בכל העולם להשקיע מאמצים מחקריים ניכרים במטרה לפענח את תעלומת "תוכנת ההתאבדות" של התאים החיים. קבוצת המחקר של ד"ר גרוס, למשל, מבצעת בעת ובעונה אחת שלושה מחקרים נפרדים הקשורים לאפופטוזיס. שניים מהם עוסקים במעורבותה של "תחנת הכוח של התא", המיטוכונדריון, בתהליך.
 
המיטוכונדריון הוא אברון תוך-תאי הממלא תפקיד מרכזי בתהליכי הפקת האנרגיה בגוף. על פי מבנהו ותכונות נוספות שלו סבורים רבים, כי מקורו האבולוציוני הוא במיקרואורגניזם עצמאי שנבלע בתא הקדמון שממנו התפתחו רוב בעלי-החיים והצמחים עלי אדמות. פגיעה במיטוכונדריונים מחבלת במידה קטלנית בתא כולו, וייתכן שזה מה שקורה בשלבים הראשונים של הפעלת "תוכנת ההתאבדות". מהי פגיעה במיטוכונדריון? לפי סברה אחת נוצרות במיטוכונדריון תעלות שדרכן דולפת תכולתו אל המרחב התוך-תאי. תיאוריות אחרות מצביעות על היווצרות של רדיקלים חופשיים הגורמים להתפרקות קרום המיטוכונדריון. ד"ר גרוס מצא באחרונה, שלפני התאבדות התא נוצרים בקרום המיטוכונדריונים שלו גושים המורכבים מחלבון הקרוי tBID (ממשפחת חלבוני ה- 2- BCL ). ייתכן שתהליך זה מהווה מעין הכנה ליצירת תעלות במיטוכונדריון. תפיסה זו מקבלת חיזוק ממחקר אחר של ד"ר גרוס, שבו גילה כי חלבון אחר ממשפחה זו, הקרוי BAX, גורם להיווצרות רדיקלים חופשיים בתאי שמרים, דבר שעלול להביא למות תא השמר. פעולות התאמה שונות המבוצעות בתאי שמרים עשויות, אם כן, לאפשר מחקר של תופעת האפופטוזיס בבעלי-חיים חד-תאיים אלה, שבדרך הטבע לא טמונה בהם "תוכנת התאבדות", מכיוון שבמקרה של בעלי-חיים חד-תאיים, משמעותו של מות התא היא מותו של האורגניזם השלם. במחקר נוסף הקשור לאפופטוזיס בשחלות (המכונה "אטרזיה"), משתף ד"ר גרוס פעולה עם פרופ' אלכס צפרירי מאותה המחלקה. ד"ר גרוס: "ביוץ הוא תהליך שתופעת האפופטוזיס בולטת בו במיוחד. השחלות מכילות כמויות גדולות של זקיקים (המכילים ביציות לא בוגרות). במשך החיים, הזקיקים שעוברים ביוץ הם החריגים, ואילו הרוב הגדול, אלפי תאי זקיקים, פשוט מתים,'מאבדים את עצמם לדעת' בתהליך של אפופטוזיס". ד"ר גרוס בדק זקיקים בתרביות, ומצא שאנזימי Caspase כמעט שלא הופעלו בתהליכי האפופטוזיס. ואם לא די בכך, כשבלמו החוקרים את פעילות ה- Caspases, עוכבו תהליכי האפופטוזיס חלקית. למעשה, בניסויים בתרביות נמצא, שבשלב הביוץ גוברת פעילותו של האנזים הזה. על בסיס הממצאים האלה מציע ד"ר גרוס שאנזימי ה- Caspases ממלאים בשחלה תפקיד כפול: תפקיד אחד הקשור לאפופטוזיס, ותפקיד שני, בתהליך הביוץ, שאינו קשור לאפופטוזיס.
עברית

חלון הזדמנויות בשמיים

עברית
פרופ' אלי וקסמן. חסם עליון לשטף הניטרינים
 
בני אדם מתבוננים בשמיים ומחפשים משמעות במשך כל ההיסטוריה של המין האנושי, ולמעשה עוד משחר הפרה-היסטוריה. בתחילה, כמובן, התבוננו בשמיים בעין עירומה. אחר כך בא זמנו של הטלסקופ האופטי, ואחריו באו טלסקופים ומתקני צפייה שבחנו את גרמי השמיים עלפי אורך הגלים האלקטרו-מגנטיים שהם פולטים, החל מגלי רדיו ואינפרא-אדום, ועד לקרינת גאמה, קרינה אולטרא-סגולה וקרינת X ("רנטגן"). תמונות היקום המתקבלות באורכי הגל השונים משלימות זו את זו, ומאפשרות הבנה טובה יותר של מבנים (צבירי גלקסיות, גלקסיות, ערפיליות) ותהליכים שונים ביקום.
 
בנוסף לתצפיות בתחומים השונים של הגלים האלקטרו-מגנטיים מתבוננים האסטרופיסיקאים ביקום גם כפי שהוא מצטייר באמצעות הקרינה הקוסמית, המורכבת מאלומות חלקיקים הנפלטות מגרמי השמיים השונים. בין אלה אפשר למנות פרוטונים, ניטרונים, אלקטרונים, חלקיקי אלפא, ואפילו ניטרינים. העניין הוא, שרוב החלקיקים האלה טעונים במטען חשמלי כלשהו, וכתוצאה מכך, מסלוליהם בדרך לכדור-הארץ מושפעים משדות מגנטיים וחשמליים שונים, שעוצמתם ומקומם ביקום אינם ידועים. לפיכך,קשה מאוד לעקוב אחר מסלוליהם של החלקיקים האלה עד למקורותיהם, דבר שמפחית במידה ניכרת את המידע שאפשר לאסוף באמצעותם על היקום.
 
במצב העניינים הזה גוברת מאוד האטרקטיוויות של חלקיקי הניטרינו, שאינם נושאים מטען חשמלי, ורק באחרונה התברר שכנראה יש להם מאסה מעטה מאוד (עד לאחרונה סברו המדענים כי הניטרינים הם חסרי מאסה לחלוטין). תצפיות ביקום כפי שהוא מצטייר על-פי אלומות הניטרינים הנעות בו ממקום למקום עשויות לספק מידע רב ערך על מיקומיהם של גרמי שמיים הפולטים ניטרינים, וכן על אופיים הפיסיקלי של מקורות הניטרינים, שהרחוקים ביניהם הם מגרמי השמיים הבהירים והאנרגטיים ביותר. הפיסיקאים מניחים שמקורות אלה עשויים להיות "מעבדות פיסיקליות ענקיות", כגון גרעינים פעילים של גלקסיות, הנתונים להשפעתו של חור שחור. אלא שגודל הסיכוי הוא כגודל הקשיים בדרך למימושו. והקושי העיקרי בתחום זה נובע מתכונה ייחודית נוספת של הניטרינים: אלה הם חלקיקים "סוציומטים" למדי, שכמעט אינם מקיימים אינטראקציות (יחסי גומלין)עם חלקיקי חומר אחרים שאתם הם באים במגע.
 
ההשערה בדבר קיומם של הניטרינים כיסוד נוסף של חלקיקי חומר בסיסיים הועלתה לראשונה על-ידי הפיסיקאי וולפגנג פאולי בשנות ה-30. הוא ביקש להציל באמצעותם את חוק שימור האנרגיה, שבאותו זמן נראה היה כאילו הוא מופר בתהליכים רדיו-אקטיוויים מסוימים. מאז העלאת ההשערה ועד לגילויים בפועל של הניטרינים חלפו שנים רבות, בעיקר מכיוון שכאמור, הניטרינים מקיימים עם סביבתם תקשורת מעטה במיוחד. למעשה, אמצעי ההגבה היחיד שלהם לסביבה הוא הכוח החלש, השולט בתהליכים רדיואקטיוויים שונים, כגון התפרקות הניטרון. אלא שכוח זה הוא כל כך חלש, עד שלמעשה, הניטרינים כמעט שאינם משאירים עקבות במסלוליהם. למשל, ניטרינו חוצה בדרכו את כדור הארץ, במשך שבריר שנייה, מבלי להתעכב. רק מעט מאוד מבין הניטרינים החולפים דרך כדור הארץ יפגשו בדרכם חלקיק חומר שאתו הם יקיימו "קשר" כלשהו, שאחר תוצאותיו אפשר יהיה לעקוב. לפיכך, כדי להבחין בניטרינים, ובאמצעותם ללמוד על גרמי השמיים שפלטו אותם, בונים הפיסיקאים גלאים ענקיים המכילים אלפי טונות של חומר שחלקיק ניטרינו אחד מבין טריליונים עשוי להתנגש בו, דבר אשר יתבטא בפרץ אור זעיר, שאפשר להבחין בו ועל-פיו ללמוד על מה שאירע (התנגשות חלקיק ניטרינו בחלקיק של חומר מכדור- הארץ).
 
בדרך זו הצליחו המדענים, וביניהם פרופ' ישראל דוסטרובסקי ממכון ויצמן למדע, להבחין בניטרינים שנפלטו מהשמש שלנו )תצפית שאישרה את התיאוריה על הדרך שבה מפיקים הכוכבים את האנרגיה שהם פולטים(. בניסויים נוספים נצפו חלקיקי ניטרינו שמקורם בסופרנובה קרובה יחסית שהתחוללה בענני מגלן, אחת הגלקסיות הסמוכות לגלקסיה שלנו, "שביל החלב". עם ההצלחה, כמו שאומרים, בא התיאבון, והאסטרו-פיסיקאים החלו לשאוף לצפות ביקום באמצעות גלאי ניטרינים שיוכלו לגלות ניטרינים בעלי אנרגיה גבוהה, אשר נפלטו ממקורות רחוקים ואנרגטיים ביותר, שאזורי ייצור האנרגיה שלהם אינם מאפשרים מעבר פוטונים, ולכן איננו יכולים לחקור אותם באמצעות מתקנים המבוססים על קליטת קרינה אלקטרו-מגנטית. למעשה, גלאי ניטרינים גדולים ויעילים מספיק עשויים לאפשר תצפיות ביקום כולו, כפי שהוא נראה ב"פילטר" אשר מבחין במקורות הפולטים חלקיקי ניטרינו. הפיסיקאים רואים באפשרות הזאת חלון הזדמנויות נדיר וחדש לגילוי עובדות חדשות על היקום ועל הכוחות הפועלים בו.
 
האם בניית מערכת כזאת של גלאי ניטרינים היא בגדר אפשרות מעשית? כדי לענות על השאלה הזאת יש לדעת מה שיעורו של שטף הניטרינים שמגיע ממקורות שונים לכדור-הארץ. וכאן בדיוק נכנס לתמונה פרופ' אלי וקסמן מהפקולטה לפיסיקה במכון ויצמן למדע. יחד עם פרופ' ג'ון בקל מאוניברסיטת פרינסטון הוא חישב ומצא, שקיים חסם עליון לשטף הניטרינים. משמעות החסם הזה )"חסם וקסמן-בקל"(היא, שכדי לגלות ניטרינים בעלי אנרגיה גבוהה יש צורך בגלאי שקוף שיכיל לפחות טריליון טונות נוזל. מסביב לגלאי השקוף יש לבנות מערך של גלאי אור. כך, כל התנגשות של חלקיק ניטרינו קוסמי שיתנגש בחלקיק חומר מכדור-הארץ תפיק הבזק אור זעיר שייקלט בגלאי האור ההיקפיים. מדובר במתקן הגדול בערך פי 20 ממגדל אייפל.
 
ושוב נשאלה השאלה, האם מדובר בפרויקט מעשי? האם אפשר להוציאו אל הפועל? ועדה בין-לאומית של מדענים, שבה השתתף פרופ' וקסמן, בוחנת את האפשרות לבנות גלאי ענק ושקוף כזה, למשל, בתוך כיפת הקרח המכסה את הקוטב הדרומי של כדור הארץ, ביבשת אנטארקטיקה. מתברר, שבעומק כיפת הקרח המכסה את אנטארקטיקה, הקרח שקוף לחלוטין, כך שאפשר להשתמש בו לבניית הגלאי. אפשרות נוספת לבנות טלסקופ של ניטרינים באנרגיות גבוהות היא להציב את הגלאי בעומק הים התיכון )בעומק רב, מי הים הם שקופים(. כך או אחרת, עלות הפרויקט הזה מוערכת בכ -100מיליון דולר, סכום קטן מהסכומים הנדרשים כיום לבניית מאיצי החלקיקים המתקדמים אשר נחוצים למחקרי ההמשך בתחום הפיסיקה של החלקיקים האלמנטריים.
 
מה אפשר יהיה ללמוד באמצעות הגלאים הענקיים האלה? פרופ' וקסמן: "כאשר פרוטון של הקרינה הקוסמית פוגע בפוטון, נפלט חלקיק ניטרינו. אם נוכל לגלות את הניטרינים האלה, נוכל לשרטט את אתרי התנגשות האלה, ובאמצעותם לעקוב אחר הקרינה הקוסמית עד למקורה, שהוא, כיום, אחת התעלומות הגדולות בתחום האסטרופיסיקה".
 
תעלומה נוספת שעשויה לבוא על פתרונה באמצעות האסטרונומיה של ניטרינים באנרגיות גבוהות היא מקורם של פרצי קרינת גאמה המופיעים ביקום מפעם לפעם. פרופ' וקסמן, פרופ' ג'ון בקל מאוניברסיטת פרינסטון ופרופ' פיטר מזרוש אוניברסיטת פנסילווניה הראו במחקריהם העיוניים, שמקורותיהם של פרצי קרינת הגאמה האלה עשויים להיות סילוני חומר המתפרצים בעת שחור שחור סופח אליו את החומר השיורי של הכוכב, שהוא עצמו נוצר כתוצאה מקריסת ליבתו. באותו תהליך נפלטים גם חלקיקי ניטרינו עתירי אנרגיה, והיכולת "לראותם" עשויה להוביל את החוקרים למקורותיהם של פרצי קרינת הגאמה. בנוסף לשתי התעלומות האלה עשויים גלאי הניטרינים הענקיים לבחון כמהמהנחות הבסיס של תורת היחסות הכללית, באמצעות השוואת מהירותם של הניטרינים האנרגטיים למהירותם של פוטונים המגיעים מאותו המקור. בדרך זו אפשר יהיה לזהות, בין היתר, השפעות )האטת מהירות( של חלקיקים העוברים בשדות כבידה המאיטים את תנועתם.
 
כדי לבחון את האפשרות הזאת נבנה באחרונה בקוטב הדרומי מתקן ענק לגילוי ניטרינים, השקוע עמוק בתוך כיפת הקרח האנטארקטית. גודלו של גלאי זה, הגדול יותר ממגדל אייפל, הואכעשירית מגודלו של הגלאי הנדרש לפי חישוביו של פרופ' וקסמן. אפשרות בנייתו של הגלאי השלם נבחנת בימים אלה בידי צוות בין-לאומי של מדענים. פרופ' וקסמן משתתף בצוות הזה, ומטבע הדברים, הוא מקווה שבסופם של הדיונים יוחלט לפתוח לפני האסטרופיסיקאים את חלון ההזדמנויות החדש הזה.
 
 
 
גלאי AMANDA הקיים, שגודלו עשירית מהגלאי המתוכנן, בהשוואה לגודלו של מגדל אייפל
 
 
עברית

אבולוציה עכשיו

עברית
ד"ר דן תופיק. אנזימים רשלניים
 
כשהוא רוכן בריכוז רב מעל לקדירת מרק המורכב בעיקר מתערובת של גנים, מוסיף ד"ר דן תופיק כמות נדיבה של שמן. התוצאה היא מערך צפוף של טיפות מים, שכידוע אינם מתערבבים בשמן - אמולסיה. כל אחת מהטיפות הזעירות האלה מכילה גן אחד ויחיד. ד"ר תופיק, המתבונן במעשה ידיו, מקווה למצוא בטיפות האלה ובתכולתן תשובות לכמה משאלות היסוד של החיים.
 
"מה מכתיב ברירה טבעית ואבולוציה?", שואל ד"ר תופיק מהמחלקה לכימיה ביולוגית במכון ויצמן למדע. "קחו למשל את החלבונים, אבני הבנייה הבסיסיות של גופנו. באופן תיאורטי יכולות להתקיים 20 בחזקת 50 גרסאות שונות של החלבונים הכי קצרים שאנו מכירים, ולא דיברנו עוד על הארוכים שבהם. אך אם כל האפשרויות היו מתקיימות, משקלם הכולל של החלבונים היה גדול ממשקלו של כדור-הארץ כולו. לפיכך, רק מעט מאוד אפשרויות נבחרו וזכו להתממש. אנחנו רוצים לדעת כיצד בדיוק התבצעה הבחירה הזאת".
 
ברירה טבעית נחקרה במעבדה זמן רב לפני שתופיק נכנס לזירה, אך המחקרים האלה בוצעו בתאים חיים. מספרם הגדול של הגורמים הפועלים בתא, והעשויים להשפיע על תוצאות המחקר, היקשה במידה רבה על יכולתם של החוקרים לקבל תוצאות חד-משמעיות. אם לא די בכך, אפשרויותיהם של החוקרים לעקוב אחר גורמים פוטנציאליים המניעים ברירה טבעית בתוך תאים חיים הן מוגבלות למדי. ד"ר תופיק מצא פתרון מקורי למכשולים אלה: הוא בנה מודלים פשוטים של תאים חיים, שהגורם הלא ידוע היחיד הקיים בהם הוא תהליך הברירה המופעל עליהם. שיטתו, שפותחה בשיתוף עם ד"ר אנדרו גריפית מהמעבדה לביולוגיה מולקולרית בקמברידג', מבטיחה לשנות את דרכי המחקר בתחום זה, ומאפשרת לבחון בניסוי אחד מיליארדי דוגמאות (בטכניקות שהיו מקובלות עד כה אפשר היה לבחון בניסוי אחד אלף עד מיליון דוגמאות לכל היותר).
 
בשלב הראשון בשיטתו של ד"ר תופיק מחליט החוקר אילו תכונות חדשות יאפיינו את החלבון (אנזים) שהוא רוצה לפתח. לאחר מכן הוא לוקח גן המקודד לייצור חלבון קיים (שעוד לא נושא את התכונות הרצויות), ומעתיק אותו מספר רב של פעמים, תוך כדי יצירת מוטציות רבות. כך יוצר החוקר, במכוון, גרסאות רבות מאוד של האנזים, בתקווה שלפחות אחת מהמוטציות האלה אכן תתאפיין ברשימת התכונות החדשות הרצויות. כל אחת מטיפות המים הזעירות שנוצרות במערכת הניסויית של ד"ר תופיק מהווה מעין "תא מלאכותי" פשוט המכיל גן אחד בלבד וחומרים הדרושים ל"תרגומו" לאנזים (ריבוזומים, חומצות אמינו, נוקליאוטידים, מולקולות המשמשות מקורות אנרגיה דוגמת ATP, ועוד). באמצעות תהליך כימי שתכנן ד"ר תופיק נהרסים ונשטפים כל הגנים שהמידע הצפון בהם אינו עשוי להביא ליצירת האנזים המתאים. תהליך זה מבוסס על בחינת קיומה או אי- קיומה של נקודת היצמדות בין הגן שמקודד את האנזים, לבין תוצרי פעולתו של האנזים. גנים שקיימת בהם נקודת ההיצמדות הזאת,הם אלה שנבחרים להישרדות, ואילו האחרים נשטפים אל מחוץ למערכת. כך נשארים במערכת רק הגנים המתאימים ביותר המקודדים לאנזימים בעלי התכונות הרצויות.
 
הגנים המוצלחים משוכפלים במספר רב של עותקים ועוברים עוד סיבוב של "ברירה טבעית". התהליך הזה חוזר על עצמו פעמים רבות, עד שבסופו של התהליך נוצרים גנים מפותחים מאוד, שמובילים ליצירת אנזימים מהירים ויעילים. בדרך זו מקווה ד"ר תופיק להפיק אנזימים מהירים ויעילים פי מיליונים בהשוואה ל"בנק האנזימים" ההתחלתי שאתו יצא לדרך.
 
ד"ר תופיק: "מכיוון שמדובר בתהליך רב- שלבי, אנו יכולים לראות את השלבים השונים בתהליך האבולוציוני. השלבים האלה עשויים לספק הבנה טובה יותר על הדרך שבה התחוללו תהליכים כאלה בטבע, ועל הסיבות לכך שחלבונים מסוימים הועדפו על פני אחרים". ממצאי מחקריו של ד"ר תופיק רומזים על האפשרות שככל שהדבר נוגע לאנזימים, ייתכן שהטבע העדיף אנזימים לא מדויקים, או "רשלניים", המסוגלים לבצע כמה מלאכות שונות (בדרך כלל האנזימים ידועים כמכונות ייחודיות: הם נקשרים לחומרים מוגדרים ויוצרים מהם תוצר מסוים).אבל, ד"ר תופיק מצא שבמולקולות של אנזימים לא מעטים מצויים אתרים שיכולים, באופן מקרי ובלתי מכוון, לבצע כמה "חלטורות" שונות. ד"ר תופיק: "פעולות אלה אולי לא יבוצעו ביעילות רבה ואולי אפילו לא יבואו לידי ביטוי בתנאים רגילים, אך העובדה שהיכולת קיימת, והיא תוכל, בעת הצורך, לעזור ליצור החי לשרוד, מעניקה לאנזימים האלה יתרונות אבולוציוניים המסייעים להם לשרוד".
 
ייתכן שבעתיד תסייע שיטתו המקורית של ד"ר תופיק ליצירת קשת רחבה של אנזימים חדשים ומועילים שישמשו ביישומים תעשייתיים בתחומי הכימיה, הביוטכנולוגיה והרפואה. ולא פחות חשוב, הדרך הזאת עשויה לסייע בהבנה טובה יותר - ואולי אפילו בפיתוח דרכים לחיקוי - של דרך ההתפתחות הטבעית של ה"מכונות" השונות המניעות את תהליכי החיים.
עברית

איך תרופה פועלת

עברית
פרופ' עדה יונת. מבנה הריבוזום
 
חמש תרופות אנטיביוטיות מצליחות לשתק את פעולתם התקינה של חיידקים, הודות לכך שהן נצמדות אל הריבוזומים שמצויים ופועלים בחיידקים האלה. כתוצאה מההיצמדות משותקים הריבוזומים, שהם "בתי החרושת לחלבונים של התא", דבר שמשבש את ייצור החלבונים של החיידק. החלבונים הם מרכיבים הביוכימיים העיקריים המפעילים את פעולות החיים השונות, ושיבוש בתהליכי הייצור שלהם גורם למות החיידק.
 
צוות החוקרים שפעל בשני המכונים, בראשותה של פרופ' עדה יונת מהמחלקה לביולוגיה מבנית במכון ויצמן למדע, גילה באחרונה כיצד, בדיוק, פועלות התרופות האלה. פרופ' יונת חשפה באחרונה את מבנהו המורכב של הריבוזום. עבודת מחקר זו, שנמשכה כעשרים שנה, הוכתרה על-ידי כתב-העת המדעי היוקרתי "סיינס" כאחת מעבודות המחקר החשובות של שנת 2000. על בסיס הכרת מבנה הריבוזום החליטו פרופ' יונת, ד"ר ענת בשן ותלמיד המחקר רז זריבץ ממכון ויצמן למדע, לנסות לגלות כיצד תרופות אנטיביוטיות שונות נקשרות לריבוזום ומשתקות אותו. לשם כך הם הכינו גבישים של יחידות מבנה מסוימות של ריבוזומים מחיידקים שטופלו בכל פעם באחת מבין חמש תרופות אנטיביוטיות ידועות.
 
בשלב זה פיענחו המדענים את המבנה המרחבי של יחידות הריבוזום המרכיבות את הגבישים, באמצעות הפצצה של הגבישים בקרני X ("רנטגן") ומעקב אחר פיזור הקרינה שפגעה בגביש (טכנולוגיה הקרויה קריסטלוגרפיה בקרני X). בשיטה זו הצליחו המדענים להבחין במולקולות של התרופות האנטיביוטיות כשהן צמודות לאתרי הפעילות של הריבוזום באופן שמסכל את פעולתו התקינה. ממצאי המחקר הזה התפרסמו באחרונה בכתב העת המדעי היוקרתי "נייצ'ר".
 
הבנת מנגנון הפעולה של התרופות האנטיביוטיות עשוי להוביל לשיפור אסטרטגיות הטיפול בתרופות אלה, וכן לפיתוח דור חדש ויעיל יותר של תרופות אנטיביוטיות. מדעני מכון מקס פלנק בגרמניה שהשתתפו במחקר הם: פרנסואה פרנצ'סקי, יורג הרמס, אנטה טוצילי, רנאטה אלברכט ופרנק שלונצן.
עברית

עמודים