<div>
Science Feature Articles</div>

אבולוציה, בין סיכוי לסיכון

עברית
 
פרופ' נעמה ברקאי. יתרון הישרדותי
 

 

 
 
האומץ לבצע ניסויים הוא אחד המנועים שמניעים את האבולוציה. תאים חיים הם, מהבחינה הזאת, שדה ניסויים נפלא, שבו מולקולות שונות משפיעות על מולקולות אחרות וגורמות להן, לעיתים, לפעול בדרכים חדשות. כאשר המולקולות האלה הן גנים, או חלבונים, ניסויים כאלה יכולים להוביל את התא, ולעיתים את האורגניזם כולו, למסע אבולוציוני מרתק. פרופ' נעמה ברקאי, מהמחלקה לגנטיקה מולקולרית במכון ויצמן למדע, בחנה באחרונה היבטים שונים של תהליכי הבקרה המשפיעים על התבטאות גנים, התהליך שבו התא יוצר חלבונים על-פי המידע המקודד בגנים. החלבונים מפעילים את תהליכי החיים, ושינויים במבנה שלהם, הנובעים משינויים שיכולים להתחולל בגנים, עשויים להקנות לתאים יכולות חדשות ויתרונות הישרדותיים מצד אחד, אבל גם לגרום מחלות ואפילו מוות, מצד שני.
 
שאלה לדוגמה: מתי האבולוציה מתקדמת במהירות? מתי גנים יכולים להשתנות בקלות, בתיפקוד או בביטוי, ולבצע ניסויים שעלולים לסכן את האורגניזם, ומתי - ואילו - גנים שומרים בקפדנות על המבנה שלהם? שאלה בסיסית זו היא בעלת חשיבות מיוחדת על רקע התופעה המוכרת של גנים שמורים באבולוציה, כלומר, גנים שגרסאות דומות שלהם מצויות באורגניזמים פשוטים ומפותחים כאחד, החל משמרים, עבור דרך תולעים (נמטודות), זבובים, וצמחים, וכלה בבני אדם. ברור שהגנים השמורים באבולוציה ממלאים תפקידי חיים בסיסיים ואוניברסליים, המשותפים לכל עולם החי, כך ששינויים בהם גורמים למות האורגניזם או לאי-יכולת להתרבות. מצד שני, כמובן, בלי ניסויים ושינויים, האבולוציה לא תנוע קדימה. כיצד, אם כן, תחמה האבולוציה את הגנים שיש לשמור על המבנה שלהם? מה בדיוק מגן עליהם מהניסויים הגנטיים המתחוללים ללא הרף באזורים אחרים של הגנום?
 
פרופ' ברקאי וחברי קבוצת המחקר שלה גילו את "חוק חלוקת הסיכונים" של האבולוציה. מתברר, שככל שהגן מקודד חלבון שהוא חיוני ואוניברסלי יותר, קטן הסיכוי שהמקטע המאתחל שלו (פרומוטור) מכיל את ה"ביטוי" הגנטי TATA (רצף חוזר של ארבעה בסיסים מסוימים בצופן הגנטי). מקטע זה ממלא תפקיד מרכזי בתהליכי ההתבטאות של הגן. המדענים גילו שכאשר במקטע המאתחל של הגן מצוי ה"ביטוי" TATA, רמת הסיכון שאפשר לקחת, כתוצאה מביצוע שינויים ברמות הביטוי של הגן הזה, גדולה יותר. במילים אחרות, מדובר במעין הגדרת רמות סיכון, בדומה לניתוח סיכונים וסיכויים שמבצעים אנליסטים בשוק ההון. כשמחיר הטעות הוא גדול, הנטייה שלנו לקחת סיכון באיזור זה קטנה. כשמחיר הטעות זניח, אנחנו יכולים לנסות לממש סיכויים גדולים, גם במחיר נטילת סיכון גבוה. האבולוציה, מתברר, גילתה את העיקרון הזה מיליוני שנים לפני וול-סטריט ואחד-העם.
 
במחקר אחר בחנו פרופ' ברקאי וחברי קבוצת המחקר שלה ניסוי אבולוציוני שהטבע מבצע לעיתים בתאים חיים. מדובר בהכפלה ספונטנית של המטען הגנטי כולו. אותה תופעה משפיעה בדרך אחרת לחלוטין על שני מינים של שמרים. השמרים מהמין "קנדידה" (הידוע בין היתר כגורם מוות בחולי איידס) שעברו הכפלת גנום, שגשגו בקצב מהיר, וכך גם שמרי האפייה, בעלי הגנום הכפול, אלא ששמרים אלה (שמרי האפייה) למדו כתוצאה מהניסוי הגנטי "טריק חדש: הם רכשו את היכולת לגדול ולשגשג ללא חמצן.
 
פרופ' ברקאי וחברי קבוצת המחקר שלה בחנו את התופעה הזאת, ומצאו לה ביטוי אבולוציוני גנטי. הם בחנו 50 גנים הממלאים תפקיד בתהליכי חילוף החומרים של צריכת חמצן בשני מיני השמרים, וגילו כי מקטע גנטי מסוים, האחראי לתהליך ההתבטאות שלהם, עבר שינוי במהלך הכפלת הגנום. שינוי זה השפיע באופן דרמטי על התבטאותם של 50 הגנים האלה, וכנראה גם על תכונת צריכת החמצן של אחד ממיני השמרים.
 
רכישה של תכונה כזאת הייתה יכולה להעניק לשמרי האפייה יתרון הישרדותי מובהק בהשוואה לשמרי ה"קנדידה", במקרה של שינוי רדיקלי בהרכב האטמוספירה של כדור-הארץ. כך בדיוק, שילוב של שינויים סביבתיים וגנטיים הוביל - ועדיין מוביל - את האבולוציה בעולם החי בכדור-הארץ במשך מיליוני שנים, עד למצב המוכר לנו כיום.
 
פרופ' ברקאי היא פיסיקאית בהכשרתה, העוסקת כיום בחקר מדעי החיים. גישת המחקר המקורית שלה זיכתה אותה בימים אלה בפרס הלן ומרטין קימל למחקר חדשני המוענק מטעם מכון ויצמן למדע ומלווה במענק מחקר של מיליון דולר במשך חמש שנים.
 
עברית

מתגים

עברית

מדעני מכון ויצמן פיתחו שיטה להתקנת מתגי הפעלה וכיבוי בחלבונים

פרופ' מוטי ליסקוביץ. שליטה
 
התאים החיים מכילים אלפי חלבונים שונים, אשר מבצעים בהם הרבה מאוד פעולות חיוניות. חלבונים פגומים, או כאלה שאינם מתפקדים כראוי, גורמים למחלות. חקר החלבונים, מבניהם ודרך תיפקודם, הוביל בעבר לפיתוח תרופות ושיטות טיפול למחלות רבות. כך, למשל, גילוי מעורבותו של החלבון אינסולין במחלת הסוכרת סלל את הדרך לפיתוח טיפול המבוסס על הזרקת אינסולין. אך על אף המאמץ המחקרי העולמי המושקע בתחום זה, תפקידם של חלבונים רבים עדיין אינו ידוע. חוקרי החלבונים מבצעים מניפולציות גנטיות שונות, המאפשרות להפסיק את ייצורו של חלבון מסוים, או להגביר אותו מאוד. ניסויים כאלו מלמדים על פעילותו ותפקידו של החלבון הנחקר. הדרכים הקיימות לכיבוי ולהפעלה של גנים (האחראיים לייצור החלבונים) הן מורכבות ובעלות חסרונות שונים, ואינן נותנות מענה שלם לצורכי החוקרים.
 
פרופ' מוטי ליסקוביץ' ותלמיד המחקר אורן ארסטר, מהמחלקה לבקרה ביולוגית במכון ויצמן למדע, יחד ד"ר מירי אייזנשטיין, מהמחלקה לתשתיות למחקר כימי, פיתחו באחרונה שיטה ייחודית להתקנת "מתגים" להפעלה ולכיבוי, שאתם ניתן להחדיר לכל חלבון רצוי, וכך לשלוט במידת פעילותו: להגביר אותה פי כמה, ואף להפסיק אותה כמעט לגמרי. השיטה מספקת מכשיר מחקרי פשוט, יעיל ושימושי לחוקרים המעוניינים לבדוק את תיפקודם של חלבונים לא-מוכרים, ובעתיד עשויים להיות לה יישומים רבים נוספים.
 
שיטת ההפעלה של המתג מבוססת על מנגנון כימי-גנטי: אל רצף חומצות האמינו המרכיבות את החלבון מחדירים, בשיטות של הנדסה גנטית, רצף קצר של מספר חומצות אמינו. רצף זה מסוגל להיקשר, באופן חזק ובררני, לחומר כימי מסוים. קשירה של החומר הכימי לרצף חומצות האמינו משפיעה על רמת הפעילות של החלבון המהונדס - מגבירה או מפחיתה אותה. כאשר מפסיקים לתת את החומר, או מסלקים אותו מהמערכת, חוזר החלבון לרמת הפעילות הטבעית שלו.
 
השלב הראשון בשיטה, שפורסמה באחרונה בכתב-העת המדעי Nature Methods, הוא הכנת מערך חלבונים מהונדסים, אליהם מוחדר רצף חומצות האמינו במיקומים שונים. בשלב השני נסרקים החלבונים, במטרה לזהות את אלה שמגיבים למתן החומר הכימי באופן הרצוי. ואכן, החוקרים גילו כי בחלק מהחלבונים המהונדסים הפחית החומר הכימי את רמת הפעילות, בעוד שחלבון נוסף הגיב לחומר הכימי בפעילות מוגברת. פרופ' ליסקוביץ': "יעילות השיטה הפתיעה אותנו - מתברר שיש צורך במערך קטן מאוד של חלבונים מהונדסים כדי למצוא צורות שמגיבות לחומר הכימי. בחברות ביוטכנולוגיה אפשר יהיה ליצור מערך גדול בהרבה של חלבונים מהונדסים, וכך למצוא חלבון מהונדס שעונה לדרישות באופן מיטבי".
 
ואכן, השיטה שפיתחו מדעני המכון ניתנת ליישום מיידי, הן לצורך מחקר ביוכימי בסיסי על פעילותם של חלבונים שונים, והן בחברות תרופות המחפשות חלבונים המהווים מטרה מתאימה להתערבות תרופתית. מדובר במכשיר יעיל, פשוט ורב-עוצמה, שניתן ליישם עבור כל חלבון. היתרון החשוב של השיטה, לעומת טכניקות אחרות, הוא השליטה  המוחלטת והמדויקת בפעילות החלבון המהונדס: ניתן לווסת את פעילותו במקומות מוגדרים, בזמנים מסוימים, להגיע לדרגת הפעילות הרצויה, ואף לחזור לרמת הפעילות הטבעית, וכל זאת באמצעות מתן מינונים מדויקים ומתוזמנים של חומר כימי פשוט.
 
בנוסף לכך, ניתן יהיה ליישם את השיטה, בעתיד, ברפואה גנטית. ייתכן שניתן יהיה להחליף חלבונים פגומים, הגורמים למחלות קשות, בחלבונים מהונדסים, ולשלוט ברמת פעילותם באופן מדויק - באמצעות מתן מינונים מתאימים של תרופה. יישום עתידי אפשרי נוסף הוא בתחום ההנדסה הגנטית. השיטה תאפשר, למשל, לייצר צמחים מהונדסים שבהם ניתן יהיה לשלוט במדויק במועד הבשלת הפרי, באמצעות מתן חומר כימי המגביר את פעילותם של החלבונים האחראיים על תהליך ההבשלה. בנוסף לכך נעשה שימוש רב בחלבונים - כמוציאים לפועל של תהליכים תעשייתיים, כחישנים ביולוגיים (ביו-סנסורים), ועוד. היכולת לשלוט בקצב התהליכים הללו, להגבירם או לעוצרם, בצורה מיידית והפיכה - היא בעלת ערך רב.
    
מודל ממוחשב של מבנה החלבון המהונדס הכולל את רצף חומצות האמינו שהוחדרו אליו (בצהוב), אליו קשור החומר הכימי (בירוק)
 

מדענים צעירים

עבודת המחקר של אורן ארסטר, ושלוש עבודות נוספות של תלמידי מחקר ממדרשת פיינברג, הוצגו באחרונה בכנס מדענים צעירים מטעם הפדרציה האירופאית של האגודות לביוכימיה (FEBS).
 
מחקרו של אייל קמחי, ממעבדתו של פרופ' יוסי שפרלינג מהמחלקה לכימיה אורגנית, חושף נתונים חדשים ומפתיעים על אודות אחד השלבים בתהליך ייצור החלבונים - תהליך ה"שיחבור": מולקולת האר-אן-אי ה"גולמית", שהיא העתק של מקטע מסליל הדי-אן-אי, עוברת "חיתוך והדבקה" בנקודות מסוימות, וכך מתקבלת מולקולת אר-אן-אי "בשלה", על פיה מיוצר החלבון. המערכת שבגרעין התא יודעת לזהות "סימני שווא", שהכללתם באר-אן-אי הבשל תוביל ליצירת חלבון קצר ופגום, ומתעלמת מהן. קמחי גילה, כי תקינותו של הרצף שמציין את תחילת החלבון הכרחית לצורך זיהוי זה. ממחקרו עולה, שאחד הרכיבים החשובים במנגנון הזיהוי הוא המולקולה המעבירה את חומצות האמינו לחלבון הנוצר.
 
יהודית פוזן, ממעבדתו של פרופ' יורם סולומון במחלקה לבקרה ביולוגית, חוקרת כיצד מתמודדים תאים עם עקה חמצונית, כלומר, מה הם המסלולים הביוכימיים המופעלים בתא בתגובה לתרכובות חמצן פעילות. פוזן הראתה, כי ה"גלאי" המזהה את התרכובות המזיקות, ומפעיל את התגובה התאית, הוא "שחקן" מוכר - הקולטן לגורם הגדילה EGF, אשר מעורב בתהליכים חיוניים רבים בתא - גדילה, חלוקה, נדידה ועוד, ופעילות-יתר שלו קשורה בתהליכים סרטניים. בהמשך גילתה, כי קישור יציב בין שני קולטנים כאלו הוא שמעביר לתא את ה"דיווח" על נוכחות תרכובות החמצן.
 
התנהגותו הדו-פרצופית של אנזים מסוים, PTP-אפסילון, היא נושא המחקר של יהודית קראוט-כהן, ממעבדתו של פרופ' ארי אלסון במחלקה לגנטיקה מולקולרית. במצבים מסוימים מקדם האנזים התמרה סרטנית, ומגביר את האגרסיביות של גידולים סרטניים, ואילו במקרים אחרים הוא מעכב חלוקת תאים. כיצד מסוגל אנזים יחיד לבצע תפקידים מנוגדים? מהו הגורם "המחליט" כיצד יתנהג האנזים? מחקרה של קראוט-כהן חושף מנגנון, שבמסגרתו האנזים מהווה חלק ממתג מולקולרי המעכב או מפעיל שרשרת אירועים האחראית על חלוקת התא. זיהוי ה"צמתים" שבהם מתקבלת ההחלטה אם להתחלק, והמנגנונים השולטים בקבלת החלטה זו, חשוב להבנת פעילותם של מנגנונים סרטניים שונים, ועשוי לסייע  לבלימתם.
 
אורן ארסטר
 
 
מדעי החיים
עברית

מדווחים מהשטח

עברית

קבוצה של מדענים ממכון ויצמן גילתה באחרונה גן העשוי לדווח ביעילות על תהליכים ביולוגיים

מימין: ד"ר בתיה כהן, פרופ' מיכל נאמן, ויקי פלקס וקרן זיו. מידע בזמן אמת
 
התקשורת המודרנית מציפה אותנו בשטף בלתי-פוסק של מידע, לעיתים בזמן אמיתי, על המתחולל בעולם. מדענים העוסקים בביולוגיה מולקולרית עומדים בפני אתגר לא פחות מורכב: איסוף וניתוח מידע עדכני על העולם המולקולרי הזעיר וההפכפך של היצורים החיים. לדוגמה, המטען הגנטי של האדם מכיל כ-20,000 עד 30,000 גנים, שעל פיהם מיוצרים חלבונים שונים. תהליך זה, הקרוי "התבטאות גנים", מבוקר על-ידי מנגנונים מורכבים ומסועפים, הקובעים אילו מהגנים יתבטאו, באיזה תא, מתי, ובאיזו מידה. החלבונים שנוצרים בסופו של תהליך זה קובעים כיצד יתפקד התא החי, דבר שמשפיע על האורגניזם כולו. כך, למשל, התבטאות גנים משפיעה על תהליכים כמו יצירת כלי-דם, חילוף חומרים, וגם על התחוללות מחלות שונות, לרבות סרטן.
 
כשמדובר בבעלי חיים, בצמחים ובפטריות, הרי שלאורך המסלול של ביטוי הגנים, מדי-אן-אי ועד לחלבון, קיימים מספר שלבים הניתנים לבקרה באמצעות מנגנונים שונים. לדוגמה, השלב שבו מועתקים גדילי הדי-אן-אי, שלב העיבוד של מולקולת אר-אן-אי שליח (על-פי המידע הגנטי המקודד בגנים), השלב הסופי של יצירת החלבון, ועוד. מדענים רבים מנסים לפתח שיטה שתאפשר להם לקבוע איזה מנגנון שולט באילו גנים, ומהי התוצאה המדויקת של ביטוי גנים מסוימים.
 
לצורך זה משתמשים המדענים בגנים-מדווחים, המוסרים להם מידע בזמן אמיתי, היישר ממוקדי האירועים של העולם המולקולרי. כאשר הגנים המדווחים האלה מתבטאים, נוצר על-פיהם חלבון שניתן לזיהוי בקלות. לדוגמה, GFP הוא אחד הגנים המדווחים הנפוצים, משום שכאשר הוא מתבטא כחלבון, הוא "מכריז" על נוכחותו באמצעות אור ירוק. הגן המדווח מוצמד, בשיטות של הנדסה גנטית, לגן אותו החוקרים מעוניינים לבדוק. בדרך זו הם מקבלים דיווחים אמינים על המקומות שבהם הגן מתבטא, וכן על מידת התבטאותו, אופי פעילותו, מנגנוני הבקרה המשפיעים עליו, ועוד. עם זאת, כאשר הגנים האלה מדווחים על פעילות המתרחשת באיבריו הפנימיים של בעל-חיים או אדם, קשה לקלוט את המידע הזה, בגלל קושי טכני בזיהוי הגן המדווח במעמקי הגוף. כך, למשל, גנים מדווחים אינם יכולים למסור מידע על התפתחות העובר (מאחורי מחסום השליה), או במערכת העצבים המרכזית (מאחורי מחסום הדם-מוח). לכן, מדענים רבים מחפשים גנים מדווחים חדשים, שאפשר לעקוב אחר פעילותם בדרכים אחרות, כגון דימות בתהודה מגנטית - MRI. עד כה נמצאו כמה גנים כאלה, אלא שהם מחייבים שימוש בחומר נוסף.
 
קבוצה מהמחלקה לבקרה ביולוגית במכון ויצמן למדע, בראשות פרופ' מיכל נאמן, ובהשתתפות ד"ר בתיה כהן, ותלמידות המחקר ויקי פלקס וקרן זיו, גילתה באחרונה גן, העשוי לדווח ביעילות על תהליכים ביולוגיים. גן זה, הקרוי פריטין, מקודד לחלבון שממלא תפקיד חשוב בגוף: הוא לוכד ברזל מהתאים ומנטרל אותו. באמצעות הגברת הביטוי של הגן (דבר שגורם להגדלת שיעור החלבון פריטין בגוף), אפשר להגדיל את אגירת הברזל. השינויים בכמות הברזל ניתנים לזיהוי באמצעות MRI - ללא צורך במתן חומר חיצוני נוסף כלשהו. הרעיון הזה החל במחקר משותף של פרופ' נאמן עם ד"ר יואב צתרי ז"ל. 
 
גן הפריטין הוחדר למקטע די-אן-אי מעגלי שהוזרק לעכברים. כדי לבדוק את אמינות הדיווח של הפריטין צירפו אליו גן מדווח ותיק ומנוסה - GFP. מהשוואת הדיווחים העצמאיים של כל אחד מהגנים אפשר ללמוד על מידת הדיוק של הגן המדווח החדש. בנוסף לכך, צורף גם גן המגיב לנוכחותה של התרופה האנטיביוטית טטרציקלין. גן זה מתפקד כמעין מפסק, המפעיל ומכבה בעת ובעונה אחת את שני הגנים המדווחים. כך אפשר לוודא שמקור המידע המתקבל הוא אכן בגנים המדווחים, ולא בפעילותם של גנים אחרים.
 
במחקר שתוצאותיו פורסמו בכתב-העת המדעי Nature Medicine הראתה קבוצת המחקר, כי הפריטין פועל כגן מדווח מדויק, יעיל ואמין. דיווחיו מהכבד, מתאי האנדותל (התאים המדפנים את כלי הדם), ומשלבים שונים במהלך ההתפתחות העוברית של עכבר, נקלטו ב-MRI ללא צורך במתן  חומר חיצוני כלשהו.
 
ד"ר כהן: "ממצאים חדשים אלה מראים, כי החלבון פריטין עשוי לדווח על ביטוי גנים ועל פעילותם הביולוגית ביעילות רבה יותר בהשוואה לגנים מדווחים אחרים שאפשר לקלוט את דיווחיהם ב-MRI. גישה זו עשויה לסייע בחקר פעילותם של גנים שונים בתהליכי התפתחות, ובמעקב אחר תאים נודדים בגוף. כמו כן אפשר יהיה להשתמש בשיטה בחקר מודלים של מחלות שונות, למשל בכבד ובמוח, ובמעקב אחר התפתחות גידולים".   
 
פעילות הגן המדווח פריטין בתאי אנדותל המדפנים את כלי הדם במוח של עכברים בוגרים. חתכים מאזורים שונים במוח עכברים הנושאים את הגן המדווח (בשורה התחתונה) מראים פעילות גבוהה יותר של חלבון הפריטין (המתבטאת בצבעים אדומים יותר) בהשוואה לאזורים אלה בעכברים שאינם מבטאים את הגן המדווח (בשורה העליונה)
 
 
פעילות הגן המדווח פריטין בדופן כלי דם של עוברי עכברים. בשורה העליונה נראות הדמיות MRI של עכברה בהריון. חתכי האורך מראים את הכבד (L), לב (H), מוח (B) ושליה (P). בשורה התחתונה - מיפוי ערכי R2 שנמדדו באמצעות MRI. העוברים המהונדסים הנושאים את הגן המדווח (מימין) מראים פעילות גבוהה יותר של חלבון הפריטין (המתבטאת בצבעים אדומים יותר) בכבד ובלב, בהשוואה לאחיהם שאינם נושאים את הגן המדווח (משמאל)
 
מדעי החיים
עברית

מרחיבים את המעטפת

עברית
 
פרופ' אליאור פלס. צמיחה
 
טרשת נפוצה ומחלות רבות אחרות התוקפות את מערכת העצבים מתבטאות בהרס מעטפת המיאלין - השכבה השומנית העוטפת את סיבי העצב. קבוצה של מדענים ממכון ויצמן למדע זיהתה באחרונה את המנגנון האחראי להיווצרות מעטפת זו בזמן התפתחות מערכת העצבים. התגלית עשויה, בעתיד, לסייע בפיתוח דרכים לשיחזור מעטפת המיאלין לאחר שנפגעה כתוצאה ממחלות שונות.
 
תאי העצב הם בעלי שלוחות דקות וארוכות (אקסונים), המגיעות לעיתים לאורך של מטר ויותר. המיאלין מכסה קטעים גדולים של השלוחות האלה, כשבין הקטעים קיימים רווחים קטנים. שכבת המיאלין נוצרת כאשר תאים מסוימים, הקרויים תאי גליה, נלפפים מסביב לאקסון, ומכסים אותו בשכבות, היוצרות מעטפת עבה וסגורה היטב. כיסוי המיאלין מגן על סיבי  העצב, ומאפשר לאותות החשמליים הזורמים בהם לדלג במהירות רבה בין המרווחים שבין מקטעי "שמיכות המגן".  דילוגים חשמליים אלה מאפשרים העברה מהירה ויעילה של אותות חשמליים עצביים לאורך סיבי העצב. כאשר כיסוי המיאלין חסר, או פגום, האותות אינם מסוגלים לדלג לאורך האקסון - דבר שגורם לפגיעה בתיפקודו התקין של סיב העצב, ויכול להביא בהדרגה למותו.
 
פרופ' אליאור פלס, תלמיד המחקר איבו שפיגל, וחברים נוספים בקבוצת המחקר של פרופ' פלס, מהמחלקה לביולוגיה מולקולרית של התא במכון ויצמן למדע, חקרו, בשיתוף עם מדענים אמריקאים, את תאי העצב בעת התפתחותן והיווצרותן של מעטפות המיאלין. הם גילו זוג חלבונים שמעבירים מסרים מהאקסון לתאי הגליה. חלבונים אלה, הקרויים Necl, שייכים למשפחה גדולה של "מולקולות דבק", המקשרות ומצמידות תאים חיים אלה לאלה. המדענים גילו ש"מולקולות דבק" אלה (Necl1 ו- Necl4) מבצעות תפקיד נוסף:  הן מעבירות אותות תאיים שגורמים לתאי הגליה לפתוח בתהליך הייצור של מעטפת המיאלין.
 
מתברר, שייצור ה-Necl4 בתאי הגליה מתגבר כאשר הם באים במגע עם אקסון מחוסר מיאלין, וכן בתחילת תהליך ההיווצרות של מעטפת המיאלין. לעומת זאת, כאשר יש בתאי הגליה מחסור ב-Necl4 או כאשר נמנע הקשר בין 4 Necl ל-Necl1, תהליך המיאלניזציה לא מתבצע באופן תקין.
 
פרופ' פלס: "גילינו מערכת חדשה של תקשורת בין תאים אלה של מערכת העצבים. התרופות המשמשות כיום לטיפול בטרשת נפוצה ובמחלות אחרות הנגרמות כתוצאה מפגיעה בשכבת המיאלין מסוגלות להאט את המחלה - אבל לא לעצור או לרפא אותה. כיום, הנזק שנגרם לסיבי העצב במחלות אלה, הוא בלתי-הפיך. אבל אם נצליח להבין את המנגנונים ששולטים בתהליך עטיפת האקסונים בכיסוי המיאלין, נוכל בעתיד  למצוא דרך לשחזר את התהליך הזה בחולים". ממצאים אלה פורסמו בגרסה המקוונת של כתב-העת המדעי Nature Neuroscience.
 
חתך רוחב בשלוחת תא עצב עטוף בתא גליה, כפי שהוא נראה במיקרוסקופ אלקטרונים. מעטפת המיאלין נראית בצבע כהה, ובמרכזה תא העצב. מסביב למעטפת המיאלין ניתן לראות את הציטופלסמה של תא הגליה
 

חתך רוחב בעצב היקפי המכיל כמה שלוחות תאי עצב, כפי שהוא נראה במיקרוסקופ אלקטרונים. מעטפות המיאלין נראות בשחור, ובמרכזן תאי העצב
 
מדעי החיים
עברית

מילים נרדפות

עברית

מדעני המכון הישוו את הגנום של תשעה זני שמרים, זיהו כ-2,800 גנים משותפים, ובחנו את הגורמים להבדלים בין הזנים

אורנה מן וד"ר צחי פלפל. מוטציות שקטות
 
מדוע הפיל שונה מהנמלה? שאלה בסיסית ועתיקה זו מעסיקה דורות של חוקרי טבע, המנסים לזהות את המקור למיגוון העצום של היצורים החיים על פני כדור-הארץ. במהלך השנים נמצאו מספר תשובות אפשריות לשאלה הזאת. הפשוטה שבהן אומרת, שההבדל בין היצורים נובע ממערך הגנים שלהם: חיידק בעל שוטון מכיל קבוצת גנים שאינה מצויה בחיידק חסר שוטון. פשוט ואינסטינקטיבי ככל שיהיה, הסבר זה אינו מספק, שכן יצורים שונים מאוד זה מזה מכילים כמות גדולה להפתיע של חומר גנטי זהה. האדם והשימפנזה, למשל, חולקים כ-99% מהחומר הגנטי שלהם. הסבר נוסף אומר, שגם גנים משותפים יכולים לתרום לשונות בין יצורים, כאשר הם מופעלים בעוצמות, במיקומים ובתזמונים שונים. לפי ההסבר הזה, מערכת הבקרה הגנטית המפקחת על ביטוי הגנים, כלומר על תהליך הפיכתם לחלבונים פעילים, אחראית במידה גדולה לשונות בין יצורים. מערכת בקרה זו פועלת בשני שלבים: השלב הראשון, בו מתמקד עיקר המחקר, הוא ה"שיעתוק" - יצירת מולקולת אר-אן-אי-שליח על סמך מקטע של די-אן-אי. השלב השני הוא שלב ה"תרגום", בו נוצר חלבון על-פי מולקולת האר-אן-אי-שליח. ד"ר צחי פלפל מהמחלקה לגנטיקה מולקולרית, ותלמידת המחקר אורנה מן, המונחית גם על-ידי פרופ' יואל זוסמן מהמחלקה לביולוגיה מבנית, בחרו להתמקד בשלב הפחות נחקר הזה, ובדקו האם ייתכן שגם תהליך התרגום עשוי לגרום לשונות בין יצורים.
 
ד"ר פלפל ואורנה מן התמקדו ב"מילים הנרדפות" שבספר הגנטי. מה הן מילים אלו? כידוע, רצף הדי-אן-אי מורכב מרצפים  הכוללים ארבע אותיות: A, T, G ו- C. כל "מלה" בת שלוש אותיות יוצרת "קודון" המסמן חומצת אמינו מסוימת, כל "משפט", או גן, אחראי ליצירת חלבון. מאחר שמספר הקודונים האפשריים (64) גדול ממספר חומצות האמינו (20), הרי שכל חומצה אמינית מקודדת על-ידי מספר צירופים. מדענים נהגו להתייחס אליהם כאל "מילים נרדפות" - החלפה של קודון בקודון נרדף (בעקבות מוטציה) לא תשפיע על החלבון שיווצר מהגן. עד עתה מקובל היה להניח כי מוטציות אלו, המכונות "מוטציות שקטות", אינן באות לידי ביטוי ביצור שעבר את המוטציה, ולכן אינן גורמות לשונות בין יצורים, ואף אינן גורמות למחלות גנטיות. המחקר של ד"ר פלפל ואורנה מן, שפורסם באחרונה בכתב-העת Nature Genetics, מראה כי הבדלים בקצב וביעילות שבה  מתורגמים הקודונים הנרדפים משפיעים על תכונות היצור השלם.
 
מדוע יעילות התרגום שונה עבור קודונים נרדפים שונים? הסיבה לכך היא, שעבור כל קודון קיימת מולקולה ייחודית, הקרויה אר-אן-אי-מעביר, שתפקידה להוביל את חומצת האמינו התואמת לקודון אל החלבון ההולך ונבנה. יעילות התרגום תלויה בשכיחותן של מולקולות אר-אן-אי-מעביר שונות: ככל ששכיחותן של מולקולות האר-אן-אי-מעביר התואמות לקודון מסוים גדולה יותר, כך ייעשה התרגום בקצב מהיר יותר.
 
החוקרים הישוו את הגנום של תשעה זני שמרים, וזיהו כ-2,800 גנים משותפים. לאחר מכן חישבו את יעילות התרגום של הגנים האלו, על-פי הקודונים המרכיבים אותם. מתברר, כי אכן קיימים הבדלים גדולים ביעילות התרגום של הגנים במינים השונים, וכי קיים קשר בין יעילות התרגום לבין תכונות מין השמרים. כך, למשל, שמרים המעדיפים להפיק את האנרגיה הדרושה להם מחמצן (מינים אירוביים) תירגמו ביעילות רבה את הגנים הדרושים לביצוע הפעילות הזאת. לעומתם, מיני שמרים המפיקים אנרגיה ללא חמצן (שמרי תסיסה), העדיפו תרגום יעיל של גנים אחרים. ד"ר פלפל: "אורח חיים מסוים, שדורש התבטאות מוגברת של גנים מסוימים, יגרום להעדפה לייצוג הגנים הללו באמצעות קודונים שמתורגמים ביעילות הגבוהה ביותר. ההעדפה הזו מושגת על-ידי לחצי ברירה טבעית".
 
אחת ההשלכות החשובות של המחקר נוגעת לתפקידן של "מוטציות שקטות" כגורמי מחלות. עד כה חיפשו מדענים מוטציות המשנות את רצף חומצות האמינו, מתוך הנחה כי רק מוטציות כאלו גורמות להפרעה בתיפקוד החלבון ולכן גורמות למחלות. מחקרו של ד"ר פלפל מסב את תשומת הלב אל המוטציות השקטות, שגם להן, כפי שהתברר, יש השפעה ניכרת על דמותם ותיפקודם של יצורים חיים.  
 
 
מדעי החיים
עברית

חלבון אחד, ארבעה ממדים

עברית

מימין: פיוטר צווטקוב פרופ' יוסף שאול וד"ר נינה ראובן. ברירת מחדל

במשך שנים רבות סברו המדענים, כל אחד מעשרות אלפי החלבונים השונים בגופנו מתקפל ויוצר מבנה ייחודי ומורכב החיוני לתיפקודו. אבל האם זו באמת דרך הטבע? בשנים האחרונות מצטברות ראיות לקיומם של חלבונים "חסרי מבנה" - אשר מכילים מקטעים שעוברים למצב מסודר ויציב רק תוך כדי תהליך הקישור למטרה (ולא באופן אוטומטי ובלתי תלוי). אבל, האם החלבונים האלה מופיעים בצורתם חסרת המבנה גם בתוך תאים חיים? פרופ' יוסף שאול, ראש המחלקה לגנטיקה מולקולרית במכון ויצמן למדע, סבור שהתשובה על השאלה הזאת היא חיובית, וכי האזורים חסרי המבנה בחלבונים האלה ממלאים תפקידים חיוניים בתא. במחקר שביצע באחרונה הוא גילה מסלול חדש של מכונת הריסה תאית לפירוק חלבונים משומשים, הפועלת, כנראה, בחלבונים חסרי מבנה בלבד.

 
רוב חלבוני התא נוצרים ומפורקים באופן רצוף במקומות שונים בתא. מכונות ההריסה לחלבונים, הנקראות פרוטיאוסומים, שומרות על איזון ברמות החלבונים בתא. אחד מאלה, למשל, הוא פרוטיאוסום הקרוי 26S. תהליך פירוק חלבון באמצעות 26S מתחיל כאשר מולקולה קטנה, הקרויה יוביקוויטין, נצמדת אל החלבון המשומש, ומסמנת אותו כמיועד לפירוק (על גילוי מערכת היוביקוויטין זכו פרופ' אהרון צ'חנובר ופרופ' אברהם הרשקו מהטכניון, יחד עם פרופ' ארווין רוס מאוניברסיטת קליפורניה, בפרס נובל לכימיה לשנת 2004). 
 
פרופ' שאול, ד"ר נינה ראובן ותלמידי המחקר גד אשר, פיוטר צווטקוב, יחד עם פרופ' חיים כהנא וציפי ברקוביץ מהמחלקה לגנטיקה מולקולרית במכון ויצמן למדע, גילו תהליך נוסף של פירוק חלבונים, המתבסס על פרוטיאוסום הקרוי 20S. חלבונים שמפורקים בתהליך הזה אינם מסומנים מראש על-ידי היוביקוויטין. פרוטיאוסום זה משמיד אותם באופן אוטומטי בתהליך שהמדענים כינו "חיסול בברירת מחדל". מהמחקר של מדעני המכון עולה, כי האזורים חסרי המבנה של חלבונים מסוימים הם הסימון שמפעיל את "מכונת ההריסה" מסוג 20S. בין השאר התברר למדענים המופתעים, שאחד החלבונים שמפורקים בדרך זו הוא לא אחר מאשר p53, חלבון שתפקידו הוא בלימת התפתחות של גידולים סרטניים, ואשר תקלות בתיפקודו מעורבות בהתחוללות מקרים רבים מאוד של סרטן.
 
רמות החלבון הזה עולות ויורדות בתא בתגובה לעקות שונות, מפני שהוא ממלא תפקיד עיקרי גם בתיקון נזקים לאחר פגיעה וגם בהתאבדות המתוכננת של התא במקרה של נזק בלתי-הפיך. התגלית הייתה מפתיעה, מפני שבמשך זמן רב היה ידוע שהחלבון הזה מפורק באמצעות 26S (ולא באמצעות 20S).
 
במבט ראשון נראה, כי הריסה אוטומטית אינה מתאימה לחלבון p53, שהתא זקוק לו בכמויות גדולות בכל פעם שעקה כלשהי מפריעה לפעילותו. אבל המדענים גילו, שבמקרים אלה נכנסת לתמונה מולקולה נוספת, הקרויה NQO1, כדי למנוע את ההשמדה. לעומת יוביקוויטין, המהווה תווית "מיועד להשמדה", המולקולה NQO1 מהווה תווית שמכריזה "לא להשמיד". המדענים מציעים, שמולקולה זו פועלת כ"שומר  שער" אשר מונע "חיסול בברירת מחדל" באמצעות הפרוטיאוסום 20S.
 
פרופ' שאול והקבוצה שלו סבורים, שחלבונים חסרי מבנה יכולים לעבור פירוק בשני מנגנונים: או בפרוטיאוסום 26S באמצעות תוויות יוביקוויטין, או ב"חיסול במחדל" באמצעות הפרוטיאוסום 20S. ביתר פירוט, כאשר החלבון חסר המבנה בא במגע עם "שותף", הוא מבסס לעצמו מבנה מוגדר יותר. במצב זה הוא מפורק במסלול היוביקוויטין על-ידי 26S. לעומת זאת, כאשר הוא פועל לבדו, במצבו חסר המבנה, ואם אינו מוגן על-ידי NQO1, הוא חשוף לסכנת חיסול על-ידי 20S. פרופ' שאול סבור, כי מרכיבים חסרי מבנה עשויים להעניק יתרונות לחלבונים כמו p53. בתמורה לאובדן חלקי של היציבות (שאולי פחות חשובה לו, מכיוון שהוא נקרא לשירות לתקופות לא ארוכות), הוא מקבל גמישות מוגברת. כאחד מגורמי הבקרה העיקריים בתא, הוא מתחבר למספר גדול של חלבונים אחרים בתא, ומבנה גמיש עשוי לסייע לו להתאים את עצמו למיגוון צורות של חלבונים שונים. מפני שהחלבונים הייחודיים האלה משנים את צורתם בארבעה ממדים - כולל זמן - שאול הציע שם חדש לקבוצת החלבונים הזאת: חלבוני ארבעה ממדים. פרופ' שאול, יחד עם מדענים נוספים ממכון ויצמן למדע, חוקר את השימוש בפרוטיאוסום 20S כבכלי לזיהוי חלבוני ארבעה ממדים.
 
מחקר זה עשוי לסייע למדענים לשפוך אור חדש על תכונותיהם של חלבונים, ולהשיג תובנות חשובות על תהליכי התחוללות של מחלות, כגון מחלת פרקינסון, המתאפיינת בהצטברות של חלבונים חסרי מבנה במוח. ייתכן כי תקלה כלשהי במערכת החיסול במחדל גורמת לעלייה ברמת החלבונים האלה, דבר שמעורב במחלה. 

 

שיווי משקל

במחקר שנועד לבחון את פעילותה של מולקולת התווית NQO1, פיענחו פרופ' שאול וחברי קבוצת המחקר שלו את תעלומת פעילותה של תרכובת אנטי-סרטני טבעית. כורכומין, החומר שמעניק לתבלין כורכום את צבעו הצהוב המבריק, משמש לטיפול נגד סרטן. למעשה, ניסויים רבים במעבדות מראים שהכורכומין הורג תאים סרטניים בתרביות. אבל בכמה ניסוים בעכברים התגלתה השפעה הפוכה ומטרידה: בבעלי-החיים שטופלו בחומר חלה התפתחות של הגידול.
 
חברי קבוצת המחקר של פרופ' שאול, יחד עם פרופ' ליאו זקס, ד"ר יוסף לוטם, ורוניקה רייס, גד אשר ופיוטר צווטקוב, בחנו את הדרך שבה חומרים שונים משפיעים על יכולתה של NQO1 לעכב את החיסול במחדל. בין היתר, השתמשו בכורכומין, שהוא חומר נוגד חימצון פעיל מאוד, וברסברטרול, חומר שנמצא ביין אדום ומאריך את חייהם של זבובי פירות. החוקרים מצאו, שהכורכומין בולם את הפעילות של NQO1, ומאיץ את החיסול של p53. הפחתה של כמות החלבון הזה בתא עשויה להיות גורלית כאשר מתחולל בתא תהליך שעלול להוביל להפיכת התא לתא סרטני. ברגעים אלה נדרש p53 לפעולה, כדי לעצור את התהליך. מחסור בחלבון הזה מחליש את מערכת ההגנה של התא מפני הסרטן. האם ייתכן שתובנה זו נכונה גם באשר לחומרים נוגדי חימצון אחרים? פרופ' שאול: "מערכות ביולוגיות פעולות בדרך של שמירת איזון. תוספת של יותר מדי חומר נוגד חימצון, או חומר אחר שמשפיע על האיזון הזה, עלולה להביא לתוצאות הפוכות מהרצויות".

 

מדעי החיים
עברית

עונת הנדידה

עברית
שרה לביא ופרופ' יוסף ירדן. גורמי גדילה
 
השלב שבו גידול סרטני ראשוני מתחיל לשלוח גרורות הוא אחד הגורמים המרכזיים המשפיעים על אלימות הגידול, על מידת הנזק שהוא גורם, ועל סיכויי ההחלמה מהמחלה. היכולת ליצור גרורות קשורה בתכונה המאפיינת תאים בריאים וסרטניים כאחד: היכולת לנדוד ממקום למקום, כלומר לעבור ממצב קבוע למצב נייד. צוות מדענים ממכון ויצמן למדע חושף בימים אלה פרטים חדשים על המנגנון המולקולרי האחראי לנדידה. ממצאי המחקר, שהתפרסמו באחרונה בכתב-העת המדעי Nature Cell Biology, תורמים להבנת האופן שבו נוצרות גרורות סרטניות, והם עשויים לשמש, בעתיד, כבסיס לפיתוח שיטות לריפוי המחלה.
 
תנועה של תאים דרך צינורות הדם וכלי הלימפה מתקיימת כחלק מתהליכים ביולוגיים טבעיים (כמו איחוי פצעים), וגם בתהליכים סרטניים. כדי שנדידה זו תתאפשר, על התא להתנתק מהתאים המקיפים אותו ומהחומר הבין-תאי שאליו הוא מעוגן. האיתות הפוקד על התא להתכונן לנדידה נעשה באמצעות חומרים מסוימים המגיעים אל התא מבחוץ, הקרויים "גורמי-גדילה". מלבד שליטתם ביכולת התנועה של התא, חומרים אלה מפעילים תהליכים תאיים רבים נוספים כמו חלוקה והתמיינות, ופעילות לא-תקינה שלהם מעורבת בסוגים שונים של סרטן. כאשר גורם הגדילה נקשר לקולטן שלו, הוא מחולל רצף שינויים מבניים בתא: השלד התאי, "מערכת הפיגומים" של התא, העשויה מסיבי חלבון צפופים ומסודרים, מתפרק, דבר שמפעיל מנגנונים שונים המאפשרים לתא לנוע ולצאת לנדודים. שלב ביניים בתהליך ההשפעה של גורם הגדילה הוא הפחתה בשיעור הייצור של חלבונים מסוימים, המתחוללת במקביל להגברת ייצורם של חלבונים אחרים, שמוציאים לפועל את התהליכים הדרושים להתנעת תהליך הנדידה של התא.
 
כדי לנסות ולהבין מי הם החלבונים המתווכים בפעילותו של גורם הגדילה, ומה הם המנגנונים הגנטיים המפעילים את התהליך, התגייס צוות חוקרים גדול בראשותו של פרופ' יוסף ירדן מהמחלקה לבקרה ביולוגית במכון ויצמן למדע. הצוות כלל את תלמיד המחקר ד"ר מנחם כץ וחברים נוספים מקבוצת המחקר של פרופ' ירדן, שנעזר בתלמידי מחקר נוספים מקבוצתו של פרופ' איתן דומאני מהמחלקה לפיסיקה של מערכות מורכבות במכון ויצמן למדע, ושל פרופ' גדעון רכבי מהמרכז הרפואי על-שם חיים שיבא בתל השומר. בשלב ראשון מיפו המדענים את כלל השינויים הגנטיים המתחוללים בתא בתגובה למתן גורם גדילה, אשר מעודד התפתחות גרורות של סרטן השד. בתוך אוסף הנתונים העצום שהתקבל, הכולל את כל החלבונים שכמותם גדלה או קטנה, התבלטה משפחת חלבונים הקרויים "טנסינים", שתפקידם לייצב את מבנה התא. להפתעתם של החוקרים, הכמות של אחד מחלבוני המשפחה עלתה בצורה דרמטית, ואילו רמתו של חלבון אחר ירדה. מהי הסיבה לתגובה ההפוכה של חלבונים דומים, בני משפחה אחת?
 
מתברר, כי על אף הדמיון המשפחתי בין שני החלבונים, קיים הבדל מבני משמעותי ביניהם. החלבון שכמותו יורדת בעקבות מתן גורם-גדילה הוא מולקולה ארוכה יחסית, המורכבת משתי זרועות: זרוע אחת נקשרת אל סיבי החלבון היוצרים את השלד התאי, וזרוע נוספת נקשרת אל נקודות עיגון המצויות על קרום התא, המצמידות את התא אל החומר החוץ-תאי. חלבון זה מייצב את מבנה התא, ומצמיד אותו לחומר החוץ-תאי. החלבון השני, לעומתו, הוא קצר יותר, ומורכב מזרוע בודדת הנקשרת רק לנקודת העיגון. כאשר החלבון נקשר לנקודות העיגון הוא יוצר מעין "פקק" המכסה אותן, ומונע מהן לקשור את סיבי השלד. כתוצאה מכך פיגומי התא מתמוטטים, והתא מתחיל לנוע בדרך שעשויה להוביל אותו לייסוד גרורה חדשה.
 
שורה של ניסויים, שנעשתה בשיטות של הנדסה גנטית, הוכיחה כי גורם הגדילה אכן משפיע ישירות על שני החלבונים, הן בתאים בריאים והן בתאי סרטן שד, וכי שני החלבונים האלה שולטים ביכולת הנדידה  של התאים. כך, למשל, כאשר מנעו החוקרים את ייצורו של החלבון הקצר, היוצר את ה"פקק", נמנעה נדידת תאים, בעוד שייצור יתר שלו מגביר את הנדידה.
 
בהמשך ביצעו המדענים סדרת בדיקות בנשים חולות סרטן-שד דלקתי. סוג זה של סרטן מפושט וגרורתי ידוע כאלים ביותר, ובמקרים רבים הוא גורם למוות מוקדם של החולות. בעבר נמצא כי סוג זה של סרטן קשור בפעילות מוגברת של גורם הגדילה. החוקרים גילו, כי קיים מיתאם גבוה בין פעילות יתר של גורם הגדילה בחולות סרטן לרמות גבוהות של "חלבון הפקק" האחראי לנדידת תאים. כן התברר, כי קשירת גורם הגדילה לקולטן שלו מעלה את כמותו של "חלבון הפקק". בנוסף מצאו החוקרים מיתאם בין רמות גבוהות של "חלבון הפקק" לבין הופעת גרורות סרטניות בקשרי הלימפה. גילוי זה תומך בהשערה, כי החלבון הזה ממלא תפקיד חשוב בהיווצרות גרורות סרטניות, שכן קשרי הלימפה הם התחנה הראשונה של התאים הסרטניים הנישאים בכלי הלימפה ממקום הגידול הראשוני אל יתר  חלקי הגוף.
 
בניסוי נוסף בחנו המדענים את השפעתה של תרופה החוסמת את הקולטן לגורם הגדילה, אשר משמשת לטיפול בחולות סרטן שד המראות פעילות יתר של גורם הגדילה. בדיקה של חולות שקיבלו את התרופה הראתה, כי הטיפול גורם להיעלמות החלבון המסוכן מהתאים הסרטניים. פרופ' ירדן: "זיהינו מנגנון בעל חשיבות קלינית שיכול לחזות את התפתחות הגרורות הסרטניות, ואולי גם את התגובה לטיפול". גילוי המנגנון עשוי לתרום, בעתיד, לפיתוח תרופה שתמנע או תפחית את ייצור החלבון, וכך תמנע את יצירת הגרורות בסרטן שד, ובסוגי סרטן גרורתיים נוספים.
 
במחקר השתתפו ד"ר מנחם כץ, ד"ר עידו עמית, ד"ר עמי צתרי, שרה לביא, ניר בן-שטרית, גבי טרציק, ד"ר מושית לינדזן ורועי אברהם מקבוצת המחקר של פרופ' יוסף ירדן; טל שי מקבוצת המחקר של פרופ'  איתן דומאני; ד"ר נינט אמריליו וד"ר יסמין יעקב-הירש מקבוצת המחקר של פרופ' גדעון רכבי בבית-החולים על-שם שיבא בתל השומר; צוות חוקרים מהמכון לפתולוגיה מולקולרית ולאימונולוגיה ומהפקולטהלרפואה באוניברסיטת פורטו, פורטוגל; וחוקרים אמריקאים מאוניברסיטת דייוויס, קליפורניה, אוניברסיטת בוסטון, ואוניברסיטת דיוק, צפון קרוליינה.    
 
ד"ר מנחם כץ
 

הגנטיקה של הגרורה

סרטן המעי הגס הוא אחד מסוגי הסרטן הנפוצים בעולם המערבי ובישראל. הגידול, המתחיל את חייו כבליטה קטנה, או פצע במעי, הופך בהמשך לסרטן פולשני ואלים, כשאת עיקר הנזק גורמות גרורות המגיעות לכבד. מחקר של פרופ' אברי בן-זאב ותלמידת מחקר מקבוצתו, הרופאה ד"ר ננסי גברט, מהמחלקה לביולוגיה מולקולרית של התא במכון ויצמן למדע, שפורסם באחרונה בכתב-העת המדעי Cancer Research, חושף מנגנון גנטי המעורב ביצירת גרורות של סרטן המעי הגס, ותורם להבנת התהליכים האחראיים להתפרצותו האלימה. 
 
הגורם המגלגל את כדור השלג של המחלה, במקרים רבים מאוד (90%-80%), הוא פגיעה במסלול תאי מסוים להעברת אותות, ובעיקר בחלבון המפתח שלו - בטא-קטנין. חלבון זה ממלא תפקיד חשוב בהיצמדות תאים, אך במצבים מסוימים, כמו למשל בשלב ההתפתחות העוברית, או בהתרבות תאי גזע, יש לו תפקיד נוסף: הוא נכנס אל גרעין התא, ומעודד ביטוי של גנים. כאשר חלבון הבטא-קטנין מצטבר בכמויות גדולות מדי בתוך התא, הפעילות הבלתי-מבוקרת שלו יכולה לגרום לביטוי גנים מחוללי סרטן.
 
באופן מפתיע, אחד מאותם גנים המופעלים על-ידי בטא-קטנין בתאי סרטן המעי הגס, הקרוי L1-CAM, הוא קולטן חלבוני המופיע בעיקר על פני תאי עצב, בהם הוא אחראי להכרה בין תאים, היצמדותם והתנועה שלהם. מהו תפקידו בתאים הסרטניים? מחקרים קודמים של פרופ' בן-זאב הראו, כי הקולטן הזה אינו מתבטא בכל תאי הגידול, אלא רק באלה המצויים ב"חזית הפולשנית" שלו, ורק בשלב שבו הוא נעשה אלים וגרורתי. ממצאים אלה רמזו, כי גן זה ממלא תפקיד חשוב בשלב האלים של סרטן המעי הגס, על-ידי כך שהוא גורם לתנועה הפולשנית של התאים.
 
החוקרים בדקו השערה זו בעכברים, במודל מחקרי המדמה התפתחות סרטן מעי גרורתי. התברר, שתאי סרטן המעי בהם הוחדר הגן L1-CAM יצרו גרורות סרטניות בכבד, בעוד שתאים סרטניים שאינם מבטאים את הגן לא יצרו גרורות. בנוסף גילו החוקרים, כי ביטויו של אנזים מסוים, האחראי על חיתוך החלק החוץ-תאי של הקולטן, מוגבר גם הוא על-ידי בטא-קטנין באותם תאים, ומחזק את השפעתו הפולשנית של L1-CAM.
 
יחד עם פרופ' איתן דומאני ותלמידת המחקר שלו, מיכל שפר, מהמחלקה לפיסיקה של מערכות מורכבות, מיפו המדענים את הגנים המופעלים בתאים שאליהם הוחדר הגן L1-CAM, והישוו אותם למאפיינים של הפעלת גנים ברקמות סרטניות שנלקחו מחולים הסובלים משלב מתקדם של סרטן המעי הגס. נמצאו כ-160 גנים שביטויים מוגבר על-ידי L1-CAM, מתוכם 70 הראו ביטוי גבוה גם ברקמות סרטן המעי של 170חולים, אך לא ב-40 דגימות של רקמת מעי בריאה. בהמשך מתכוון פרופ' בן-זאב לחקור את תפקידם של גנים אלה בהתפתחות מחלת הסרטן, במטרה להבין את המנגנונים באמצעותם משרה L1-CAM היווצרות גרורות של סרטן המעי הגס
מדעי החיים
עברית

סוף הזיכרון

עברית
מדעני מכון ויצמן הצליחו למחוק במהירות זיכרונות ארוכי-טווח בחולדות
 
"זוהי תקיעת מקל בגלגליו של מנוע מולקולרי זעיר המתחזק את הזיכרון"
 
מחיקת זיכרונות ארוכי טווח
 
מה מתרחש במוחנו כאשר אנו לומדים וזוכרים? האם המידע הנלמד נצרב כשינוי פיסי ברשתות עצביות, מעין כתב חרוט על לוח שעווה? פרופ' ידין דודאי, ראש המחלקה לנוירוביולוגיה במכון ויצמן למדע, ושותפיו למחקר, גילו באחרונה שתהליכי איחסונו של זיכרון ארוך טווח בקליפת המוח הם דינמיים הרבה יותר, ומחייבים פעולה תמידית של מעין "מנוע מולקולרי", המשמר את השינוי שחוללה הלמידה ברשת העצבית. נראה, שאם מפסיקים את פעולתו של המנוע הזעיר הזה, שעותקים ממנו מצויים בכל תא עצב, חדל הזיכרון מלהתקיים. הממצאים, שפורסמו באחרונה בכתב-העת המדעי Science, מערערים את התפיסה המקובלת באשר ליציבותם של זיכרונות ארוכי-טווח ולדרך שבה הם נשמרים במוח, ועשויים לסלול דרך לטיפול עתידי חדשני בהפרעות זיכרון.
 
פרופ' דודאי ותלמידת המחקר רעות שמע, יחד עם פרופ' טוד סקטור מהמרכז הרפואי של אוניברסיטת המדינה של ניו-יורק (SUNY), אילפו חולדות להירתע מטעמים מסוימים. לאחר מכן הזריקו חומר שחוסם חלבון מסוים לתוך האיזור בקליפת המוח שמשמר את זיכרונות הטעם. החלבון שבו מדובר הוא סוג של אנזים, כלומר מולקולה שפעולתה גורמת לשינויים מבניים ותיפקודיים בחלבונים אחרים, המשמשים לה כחלבוני מטרה. כאשר פעולת האנזים משותקת, חלבוני המטרה צפויים לחזור למצבם מלפני השינוי. פרופ' דודאי ושותפיו למחקר יצאו מנקודת הנחה, שהאנזים המדובר מהווה כעין "מנוע" הפועל ללא הרף כדי לחדש את השינויים שיצרה הלמידה בחלבונים שבתאי העצב שבקליפת המוח. לכן, אם יחסמו את פעולתו של המנוע (האנזים), יימחקו השינויים בחלבונים הללו, ועמם יימחק הזיכרון. וכך אמנם קרה: לאחר הזרקה חד-פעמית של המעכב לתוך קליפת המוח, החולדות שכחו במהירות את מה שלמדו על הטעם. הטכניקה פעלה על זכרונות של טעמים שונים זמן רב אחרי שהזיכרונות הללו נוצרו. יתר על כן, כל הסימנים העידו שהזיכרונות נמחקו כנראה ללא שוב.
 
"השיטה שבה פעלנו דומה לתקיעת יתד בגלגליו של 'מנוע מולקולרי' שצריך לפעול ללא הרף כדי לשמר את הזיכרון", אומר פרופ' דודאי. "כאשר 'המנוע' הזה מפסיק לפעול, נראה שהזיכרונות חדלים מלהתקיים". במילים אחרות, הזיכרון אינו תוצאה של שינוי חד-פעמי ברשתות העצביות, אלא תהליך דינמי שהמוח צריך לתדלק ולתחזק אותו ללא הרף. ממצאים אלה מעלים בין השאר את האפשרות, שבעתיד אפשר יהיה לפתח גישות תרופתיות חדשות להגברת הזיכרון  וייצובו.
מדעי החיים
עברית

מסע המולקולה

עברית
 
פרופ' ג'פרי גרסט וליאורה חיים. כמו בסרט
 
כאשר מולקולה של אר-אן-אי-שליח עוזבת את גרעין התא, לאן היא הולכת? על-פי התפיסה הרווחת, מולקולה זו, הנושאת את המידע הגנטי הדרוש לבניית חלבונים, משוטטת בחלל התא החי, עד שהיא פוגשת, באקראי, "בית חרושת לחלבונים" (ריבוזום), הקורא את המידע הגנטי ומייצר לפיו את החלבון הדרוש. לאחר מכן נשלחים החלבונים החדשים מאתר הייצור האקראי אל האיזור בתא שבו הם נחוצים. אבל פרופ' ג'פרי גרסט, ותלמידת המחקר ליאורה חיים מהמחלקה לגנטיקה מולקולרית במכון ויצמן למדע, בחנו מחדש את התהליך הזה, ועל פי ממצאיהם, שפורסמו באחרונה בכתב-העת המדעי Nature Methods, הם מציעים כי התאים החיים מעדיפים ליצור את החלבונים קרוב לאתר שבו הם נדרשים. כדי לפעול בדרך  היעילה הזאת, הם חייבים להעביר את האר-אן-אי-שליח לריבוזום המצוי בקרבת האתר שבו נדרשים החלבונים.
 
במחקר שביצעו באחרונה, פיתחו פרופ' גרסט וליאורה חיים שיטת מעקב חדשה אחר מסלול תנועתה של מולקולת אר-אן-אי-שליח מגרעין התא ועד לאתר שבו נדרשים החלבונים. שיטה זו עשויה לשמש, בעתיד, כלי למחקר יעיל של תהליכים שונים בתא, ולפיתוח דרכי טיפול חדשות במחלות שונות.
 
עד כה נתקלו המדענים בקשיים במעקב אחר מולקולות של אר-אן-אי-שליח. שיטה אחת חייבה ייצור כמויות גדולות מהמולקולה, מה שגרם לכך שרבות מהן טעו בדרך. בשיטה אחרת היה צורך לקבע את הדוגמא, כך שאפשר היה לצפות בנקודה אחת בלבד במסעה של המולקולה. לעומת זאת, השיטה החדשה של פרופ' גרסט וליאורה חיים מאפשרת לצפות בשלבים שונים של התהליך, בתאים חיים, וללא צורך בייצור כמויות מוגברות של המולקולה.
 
מדעני המכון עיצבו מקטע די-אן-אי קצר שאותו שילבו, בטכניקות של הנדסה גנטית, במרווח שבין גן מסוים לבין מקטע גנטי הצמוד אליו, אשר משפיע על מסלולה של מולקולת האר-אן-איי שליח שתיווצר על-פי אותו גן. המקטע הגנטי המשולב מצטרף לאר-אן-אי-שליח. הוא גם נקשר לחלבון הפולט אור ירוק, דבר שמאפשר למדענים לעקוב אחר  מהלכה של מולקולת האר-אן-אי-שליח. המעקב מתבצע באמצעות צילום מיקרוסקופי ייחודי, המסוגל להתמקד בגופים זעירים,  שגודלם כשתי מולקולות בלבד. "שיטה זו מאפשרת מעקב אחר תהליכי ייצורם של  חלבונים רבים", אומר פרופ' גרסט.
 
במחקר שהתבצע בתאי שמרים הצליחו המדענים לצפות, בפעם הראשונה בתאי שמרים חיים, במולקולות של אר-אן-אי-שליח. פרופ' גרסט וליאורה חיים, יחד עם תלמידי המחקר ריטה גלין-ליכט, גד צפור וסטלה ארנוב, עקבו אחרי התנועות של  מולקולות האר-אן-איי שליח שמקודדות מידע אשר על-פיו נבנים חלבונים שממלאים תפקיד חשוב בשינויים בצורתו של קרום התא, באתר שבו מתחוללת הנצה - תחילת התפתחותו של תא חדש מתוך תא שמר קיים. עבודה זו פורסמה בכתב-העת המדעי Molecular and Cellular Biology.
 
חברת "ידע", הזרוע ליישומים תעשייתיים של מכון ויצמן למדע, הגישה בקשה לרישום פטנט על השיטה. כעת מתכוננים פרופ' גרסט וחברי קבוצת המחקר שלו למפות את מסלולי התנועה של מולקולות האר-אן-אי-שליח, הנושאות את המידע הדרוש לבנייתם של כל 6,000 ויותר החלבונים המצויים בתאי השמרים. מפה כזאת עשויה להוות כלי רב-ערך לגילוי הכללים שלפיהם מתבצע שינוע של אר-אן-אי-שליח, בתאים חיים. 
מדעי החיים
עברית

סימפוניה של תמונות

עברית

מדעני מכון ויצמן פיתחו שיטה משולבת שפותחת אפשרויות חדשות לפיענוח המבנה המולקולרי של חומרים רבים

 
פרופ' לוסיו פרידמן. הדמייה מגנטית משופרת
 
 
חובבי מוסיקה קלאסית יודעים לזהות יצירות שונות ומלחינים שונים, הודות לשילוב הצלילים הייחודי המאפיין אותם. באופן דומה, מדענים יודעים לזהות קרינה שבוקעת מחומרים שונים, ולקבוע על-פיה את המבנה המדויק שלהם. כדי לגרום לחומר לפלוט את הקרינה האופיינית לו, משתמשים המדענים בתהודה מגנטית גרעינית - NMR, ובדימות בתהודה מגנטית - MRI. טכניקות אלה אינן פולשניות, הן צורכות מעט אנרגיה, ולפיכך הן משמשות לטווח רחב של בדיקות ובחינות, מהמבנה הכימי של תרופות, ועד למעקב אחר התפתחות מוח העובר. תכונת המגנטיות היא הבסיס לפעילותם של ה-NMR וה-MRI. כאשר גרעיני האטומים נחשפים לשדה המגנטי שבמכשירים אלה, הם מתעוררים לחיים ומתחילים להסתובב סביב עצמם - כמו מחטים של מצפן מיקרוסקופי. כתוצאה מכך הם פולטים גלים אלקטרו-מגנטיים. גרעינים של אטומים מסוגים שונים משדרים גלים שונים, וכך נוצר דפוס קרינה אופייני לכל חומר. המדענים מנתחים את דפוסי הקרינה, ועל-פיהם הם יוצרים תמונה רב-ממדית מלאה ומדויקת של המולקולות המרכיבות את החומר.
 
השיטה זכתה לפופולריות עצומה, ונעשה בה שימוש במיגוון רחב של תחומי מחקר כמו רפואה, ביולוגיה מבנית, כימיה תרופתית, פיסיקה של חומר מעובה, ומדעי כדור-הארץ. מכשירים המבוססים על תהודה מגנטית הוכיחו את עצמם כאמצעי מחקר רב-ערך, ובעל יישומים רבים מאוד: החל מתכנון סוגים חדשים של מוליכים למחצה, חומרים קטליטיים (זרזים כימיים) ותרופות יעילות, ועד למחקר בזמן אמת של פעילות מוח האדם, ואבחון מצב בריאותו של העובר.
 
"עם זאת, אותן התכונות שעושות את המכשירים האלו שימושיים כל-כך ברפואה ובמחקר, העובדה שהם אינם פולשניים ופולטים רק רמות נמוכות ביותר של אנרגיה, ולכן אינם מזיקים, אחראיות גם לחיסרון הגדול שלהם: רמת הרגישות הנמוכה של הבדיקה", מסביר פרופ' לוסיו פרידמן, מהמחלקה לפיסיקה כימית שבפקולטה לכימיה במכון ויצמן למדע. "כדי לשפר את רמת הרגישות של המדידות נאלצים המדענים להשתמש בריכוזים גבוהים של דוגמאות נבדקות, שלעיתים קשה להשיגם. אפשרות אחרת היא לפתח מגנטים חזקים יותר, שהם יקרים מאוד ויכולתם מוגבלת, בסופו של דבר. למעשה, כדי לקבל תמונה רב-ממדית - דו-ממדית, תלת-ממדית ואף ארבע-ממדית - יש לבצע שורה של מדידות נפרדות ולשלב את הנתונים העולים מהן. התהליך כולו הוא איטי, ונדרשים שעות ואף ימים עד לקבלת התוצאות הסופיות".

פרופ' פרידמן, והמדען דמיר בלזינה העובד בחברת Oxford Instruments Molecular Biotools, אשר מפתחת מיכשור ביולוגי-מולקולרי, פיתחו, במחקר משותף, שיטה המשפרת במידה ניכרת את רגישות המדידה של מכשירי התהודה המגנטית, ומאפשרת ליצור במהירות גדולה תמונה רב-ממדית של החומר, על בסיס נתוני NMR. השיטה שפיתחו משלבת שתי  טכניקות: NMR רב-ממדי אולטרה-מהיר, והיפר-קיטוב גרעיני דינמי (DNP היפר-מקוטב). השיטה תוארה באחרונה בכתב העת המדעי Nature Physics.

היפר-קיטוב היא שיטה שפותחה בעשורים האחרונים על-ידי מספר קבוצות מחקר, במטרה להתגבר על מגבלת הרגישות של מכשירי ה-NMR. הרעיון הוא "להטיל משמעת" על גרעיני האטומים המסתובבים ללא סדר. במכשירי NMR ו-MRI רגילים, מחטי המצפן של גרעיני האטומים "מאבדות את הצפון", ומצביעות באקראיות לכיוונים שונים. רק אחוז זעיר מכלל הגרעינים (אחד מכל 50,000) פועל באופן  מסודר הנדרש כדי שאפשר יהיה לקרוא אותו במכשיר NMR. תהליך ההיפר-קיטוב מסדר את מחטי  המצפן כך ש"יצביעו צפונה". ככל שיש יותר מחטים ממושמעות ומסודרות, כך עולה רגישות הקריאה ב-NMR. באמצעות שימוש בטכניקות שונות, כמו קירור של הדוגמא מטמפרטורת החדר עד קרוב לאפס המוחלט (273- מעלות צלזיוס), מאפשר ההיפר-קיטוב לסדר כ-20% מגרעיני האטומים (גרעין אחד מכל חמישה) - שיפור פי 10,000 של השיטה הנהוגה עד היום. בכך נמצא פתרון לבעיית הרגישות, אך נוצרות שתי בעיות חדשות: הטמפרטורה הנמוכה אינה מאפשרת לבדוק דוגמאות במצב נוזלי, שהוא מצב הצבירה האופייני לדוגמאות ביולוגיות. כדי להתגבר על הבעיה הזאת הפעילו המדענים את תהליך ההיפר-קיטוב על הדוגמה הקפואה, ולאחר מכן הפשירו אותה למצב נוזלי. כך התקבל חומר נוזלי ומסודר, שאיפשר רמת רגישות גבוהה של בדיקת NMR. אולם, תהליך זה הציב את החוקרים מול בעיה אחרת: את החומר המופשר לא ניתן להקפיא שנית, ולכן לא ניתן לבצע את אוסף הבדיקות החוזרות, שנדרש לשם קבלת תמונה רב-ממדית של החומר.

בנקודה זו נכנסו לתמונה פרופ' פרידמן וחברי קבוצת המחקר שהוא עומד בראשה. הם פיתחו גירסה משופרת של טכניקת NMR, הקרויה "NMR רב-ממדי אולטרה-מהיר". שיטה זו מבוססת על "פריסה לפרוסות" של הדוגמה הנבדקת, המבטלת את הצורך לאסוף מספר גדול של סריקות. כך יכולים המדענים לקבל בסריקה בודדת, תוך שבריר שנייה, מערך נתונים של המבנה הרב-ממדי של החומר.
 
"שתי שיטות יעילות במידה יוצאת דופן נמצאות בהישג ידנו. אחת מגבירה את הרגישות, והשנייה מגבירה את המהירות. מה יקרה אם ננקוט את הגישה החדשה, ונאחד את שתי השיטות, במקום להמשיך בתהליך המתסכל והאיטי של שיפור המיכשור והתהליכים הקיימים?" שאל את עצמו פרופ' פרידמן. מיזוג שתי השיטות אכן הוביל לסימפוניה מוצלחת והרמונית: הנתונים שהתקבלו באמצעות השיטה של פרופ' פרידמן איפשרו להעלות את רמת הרגישות של המדידות במספר סדרי גודל, וכן ליצור תמונה רב-ממדית מדויקת בתוך פרק הזמן שנדרש בדרך כלל לסריקת NMR בודדת.
 
שיטה משולבת זו פותחת אפשרויות חדשות לפיענוח המבנה המולקולרי של חומרים רבים, והיא עשויה לסייע גם בחקר תופעות דינמיות המתחוללות בפרקי  זמן קצרים (עד כה אי-אפשר היה למדוד תופעות כאלה). בנוסף לכך, באמצעותה אפשר יהיה לחשוף תופעות חדשות שנותרו עלומות עד כה.   
 
 NMR דו ממדי אולטרה-מהיר והיפר-מקוטב (מימין), בניגוד לשיטה המקובלת (משמאל), מאפשר שימוש בדוגמא מרוכזת פחות (במבחנה למעלה), הודות ללסידור אחיד של גרעיני האטומים, ואינו מצריך כמות גדולה של סריקות (בחלק התחתון). הסיגנל המתקבל בשיטה זו חזק יותר, ורגישות הבדיקה עולה
 
 
 
 
פרופ' לוסיו פרידמן. הדמייה מגנטית משופרת
חלל ופיסיקה
עברית

עמודים